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C10orf67在低氧适应及非小细胞肺癌发生发展中的功能与机制研究
结题报告
批准号:
81672764
项目类别:
面上项目
资助金额:
55.0 万元
负责人:
杨翠萍
学科分类:
H1802.肿瘤发生
结题年份:
2020
批准年份:
2016
项目状态:
已结题
项目参与者:
江丽萍、申秋硕、李卓然、胡本霞、苗英杰、刘坤、傅锦林、王二林
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中文摘要
低氧在高原和非小细胞肺癌(NSCLC)中常常出现,低氧信号通路在肿瘤发生发展各方面都起着至关重要的作用。申请人前期利用趋同进化的方法比较了327个家养哺乳动物 (高原和平原:马、绵羊、山羊、牛、猪和狗) 的全基因组序列及转录组数据,除了已知的HIF-1/2信号通路分子,还筛选得到功能未知的基因:C10orf67。前期结果显示,C10orf67参与调控低氧诱导的细胞凋亡通路,并在NSCLC细胞和组织中高表达并调节A549增殖。申请人拟:1)利用体外生化试验研究其体外功能:细胞增殖、凋亡、迁移和侵袭等;2)利用裸鼠荷瘤实验研究其体内功能;3)结合临床大样本关联性分析、蛋白质组和转录组学等方法,解析其在低氧适应及NSCLC发生发展过程中的功能及机制。该项目利用进化及肿瘤学交叉学科的研究方法,筛选低氧适应候选基因并研究其在NSCLC中的功能与机理,在肿瘤发生机理研究领域具有创新性及广泛的应用前景。
英文摘要
Hypoxia occurs naturally at high-altitudes and commonly in pathological conditions (e.g. tumor, like non-small cell lung cancer: NSCLC). Here, we used large-scale comparative population genomic data to reveal the genetic mechanism and species specific features underlying high-altitude adaptation of Tibetan mammals including domestic mammals (horse, sheep, goat, cattle, pig and dog), pika, zokor, antelope, yak, et al. Interestingly, many genes involved in tumorigenesis were found to evolve under selection. We uncovered multiple novel positively selected genes from the selected gene pool, like C10orf67, which are highly expressed in non-small cell lung cancer (NSCLC) tissue, and whose depletion inhibit whereas over-expression promote lung cancerous cell A549 proliferation, migration and xenograft tumor in vivo. We also identified unique amino acid mutations on different selected genes, and have found interesting hypoxia adapted (fitness) phenotypes by generating site specific Knock-In mice. Thus, adaptation of the domestic mammals to high-altitude not only provides insights into studying pattern of physiological evolution, but also searching for novel genes and potential therapeutic targets playing important roles in hypoxic tumors.
低氧是高原极端环境的重要因素之一,也在低氧实体瘤如非小细胞肺癌(NSCLC)中出现。低氧相关信号通路在实体瘤发生和发展的各个阶段都起着至关重要的作用。申请人前期利用趋同进化的方法比较了327个家养哺乳动物(高原和平原:马、绵羊、山羊、牛、猪和狗)的全基因组序列及转录组数据,除了已知的与低氧密切相关的转录因子HIF-1/2,申请人还筛选得到许多与低氧适应密切关联的功能未知基因,例如:C10orf67。前期研究结果显示,C10orf67参与调控低氧诱导的细胞凋亡通路,并在NSCLC的肿瘤组织和细胞中高表达,参与调节肿瘤细胞的增殖。利用体外生化试验研究C10orf67参与调控肿瘤细胞增殖、凋亡、迁移和侵袭等能力;利用裸鼠荷瘤实验研究其体内功能;结合临床大样本关联性分析、蛋白质组和转录组学等方法,解析其在低氧适应及NSCLC发生发展过程中的功能及机制。申请人成功构建了C10orf67通过低氧相关信号通路调控肿瘤进展的分子网络;筛选获得NSCLC临床诊断新分子和治疗新靶点。项目执行期间,申请人以第一或通讯作者(包括共同)发表SCI论文8篇,申请国家发明专利8项,获得授权2项。该项目利用遗传进化及肿瘤学交叉学科的研究方法,筛选低氧适应候选基因,并深入解析C10orf67等基因在NSCLC发生发展中的功能与分子机制,为肿瘤学的临床与基础研究提供了新方法。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
DOI:10.7150/thno.43142
发表时间:2020-01-01
期刊:THERANOSTICS
影响因子:12.4
作者:Xu, Peifang;Jiang, Liping;Chen, Yongbin
通讯作者:Chen, Yongbin
YTHDF1 links hypoxia adaptation and non-small cell lung cancer progression
YTHDF1 将缺氧适应与非小细胞肺癌进展联系起来
DOI:10.1038/s41467-019-12801-6
发表时间:2019-10-25
期刊:NATURE COMMUNICATIONS
影响因子:16.6
作者:Shi, Yulin;Fan, Songqing;Chen, Yongbin
通讯作者:Chen, Yongbin
Hypoxia and cancer related pathology
缺氧与癌症相关病理学
DOI:10.1016/j.canlet.2020.05.002
发表时间:2020-08-28
期刊:CANCER LETTERS
影响因子:9.7
作者:Xiong,Qiuxia;Liu,Baiyang;Chen,Yongbin
通讯作者:Chen,Yongbin
DOI:10.24272/j.issn.2095-8137.2017.045
发表时间:2017-07-18
期刊:Zoological research
影响因子:4.9
作者:Jiang LP;Shen QS;Yang CP;Chen YB
通讯作者:Chen YB
NCAPH plays important roles in human colon cancer.
NCAPH 在人类结肠癌中发挥重要作用
DOI:10.1038/cddis.2017.88
发表时间:2017-03-16
期刊:Cell death & disease
影响因子:9
作者:Yin L;Jiang LP;Shen QS;Xiong QX;Zhuo X;Zhang LL;Yu HJ;Guo X;Luo Y;Dong J;Kong QP;Yang CP;Chen YB
通讯作者:Chen YB
NXPH4/EGFR/PD-L1信号轴促进肿瘤免疫逃逸的功能与机制研究
人类特有lncRNA GSCAR影响GBM发生发展的功能与机制研究
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