高通量测序探寻子宫内膜异位症致病基因的研究

批准号:
81571411
项目类别:
面上项目
资助金额:
57.0 万元
负责人:
孟元光
依托单位:
学科分类:
H0412.子宫内膜异位症与子宫腺肌症
结题年份:
2019
批准年份:
2015
项目状态:
已结题
项目参与者:
李立安、范文生、黄柯、赵路阳、顾成磊、张哲、任远
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中文摘要
子宫内膜异位症是常见妇科疾病,但至今病因未明,诊断滞后于发病多年,手术及药物治疗均易复发。我们在前期实验中运用外显子测序(WES)技术对在位、异位内膜腺体细胞进行了测序,发现了大量潜在的突变位点和致病基因。本研究拟采用双线研究的手段,运用高通量测序技术结合激光显微切割技术从DNA、RNA两个层面探寻致病基因及相关信号通路。研究内容:1)采用直接测序法对大量样本进行前期WES结果的验证,确定突变位点;2)转录组测序技术量化在位、异位内膜腺体细胞中异常表达的mRNA和lncRNA,获得疾病特异性表达谱;3)联合转录组测序和WES的结果准确定位致病基因及相关信号通路,并采用实时定量PCR、原位杂交等技术扩大样本量进行验证。本研究对揭示内异症基因层面的发病机制具有重要意义,为诊断标记物及个体化靶向治疗位点的选择提供思路。
英文摘要
Endometriosis is considered to be a common gynecologic disease; however, the key drivers of endometriosis pathogenesis remain poorly understood, the diagnosis lags behind the onset for many years, and the treatments of drug therapy and surgery make this disease easily recur. In previous study, we conducted whole-exome sequencing (WES) to comprehensively search for somatic mutations in both eutopic and ectopic endometrium and identified many candidate single nucleotide variants and genes. Based on these observations, we propose using high through-put sequencing combined with laser capture microdissection to pinpoint the endometriosis-causing genes in the levels of DNA and RNA simultaneously. In this study, we will: 1) use PCR-direct sequencing method to verify the mutations discovered in previous WES in large sample size; 2) use RNA sequencing method to quantify the mRNA and lncRNA expressions level and to analysis potential genes; 3) integrate WES data with RNA sequencing data, localize the disease-related genes precisely and use transcriptomic methods, like real time PCR and in situ hybridization, to verify the data. Our study has important significance and value in revealing the pathogenesis of endometriosis and finding early diagnostic biomarkers and effective target therapies.
子宫内膜异位症是常见妇科疾病,但至今病因未明,诊断滞后于发病多年,手术及药物治疗均易复发。我们在前期实验中运用外显子测序(WES)技术对在位、异位内膜腺体细胞进行了测序,发现了大量潜在的突变位点和致病基因。本研究拟采用双线研究的手段, 运用高通量测序技术结合激光显微切割技术从DNA、RNA两个层面探寻致病基因及相关信号通路。研究内容:1)采用直接测序法对大量样本进行前期WES结果的验证,确定突变位点.;2)转录组测序技术量化在位、异位内膜腺体细胞中异常表达的mRNA和lncRNA,获得疾病特异性表达谱;3)联合转录组测序和WES的结果准确定位致病基因及相关信号通路,并采用实时定量PCR、原位杂交等技术扩大样本量进行验证。本研究对揭示内异症基因层面的发病机制具有重要意义,为诊断标记物及个体化靶向治疗位点的选择提供思路。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
DOI:10.3892/br.2016.758
发表时间:2016-11
期刊:Biomedical reports
影响因子:2.3
作者:Luyang Zhao;C. Gu;Ke Huang;W. Han;Meng Fu;Y. Meng
通讯作者:Luyang Zhao;C. Gu;Ke Huang;W. Han;Meng Fu;Y. Meng
DOI:--
发表时间:2018
期刊:解放军医学院学报
影响因子:--
作者:张倩;顾成磊;叶明侠;张哲;孟元光
通讯作者:孟元光
Integration analysis of microRNA and mRNA paired expression profiling identifies deregulated microRNA-transcription factor-gene regulatory networks in ovarian endometriosis.
microRNA 和 mRNA 配对表达谱的整合分析确定了卵巢子宫内膜异位症中失调的 microRNA-转录因子-基因调控网络。
DOI:10.1186/s12958-017-0319-5
发表时间:2018-01-22
期刊:Reproductive biology and endocrinology : RB&E
影响因子:--
作者:Zhao L;Gu C;Ye M;Zhang Z;Li L;Fan W;Meng Y
通讯作者:Meng Y
Identification of global transcriptome abnormalities and potential biomarkers in eutopic endometria of women with endometriosis: A preliminary study.
子宫内膜异位症女性在位子宫内膜整体转录组异常和潜在生物标志物的鉴定:初步研究
DOI:10.3892/br.2017.902
发表时间:2017-06
期刊:Biomedical reports
影响因子:2.3
作者:Zhao L;Gu C;Ye M;Zhang Z;Han W;Fan W;Meng Y
通讯作者:Meng Y
DOI:10.1159/000487450
发表时间:2018-01-01
期刊:CELLULAR PHYSIOLOGY AND BIOCHEMISTRY
影响因子:--
作者:Zhao, Qingdong;Ye, Mingxia;Meng, Yuanguang
通讯作者:Meng, Yuanguang
染色体9q31.1-33.1区microRNAs群对宫颈癌中PI3K活性的调控及其临床意义研究
- 批准号:81272867
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:70.0万元
- 批准年份:2012
- 负责人:孟元光
- 依托单位:
KRT18对LRP16的功能调控及其在子宫内膜癌中的临床病理学意义
- 批准号:30872749
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:32.0万元
- 批准年份:2008
- 负责人:孟元光
- 依托单位:
LRP16基因对子宫内膜癌细胞增殖的影响及其临床意义研究
- 批准号:30471813
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:20.0万元
- 批准年份:2004
- 负责人:孟元光
- 依托单位:
国内基金
海外基金
