组氨酸激酶HK853的动态ATP lid对反应调节蛋白RR468磷酸活化的影响
结题报告
批准号:
21603268
项目类别:
青年科学基金项目
资助金额:
21.0 万元
负责人:
刘乙祥
学科分类:
B0707.化学生物学理论、方法与技术
结题年份:
2019
批准年份:
2016
项目状态:
已结题
项目参与者:
刘晓黎、寇新慧、王丹、黄丽群
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中文摘要
双组分信号转导系统(Two-component System, TCS)调控着细菌的大部分生命活动,是最具潜力的新型抗菌药物靶标之一。细菌的TCS由组氨酸激酶HK和反应调节蛋白RR两部分组成,以磷酸传递的方式实现信号转导从而启动细胞应答。至今尚不明确反应调节蛋白RR如何接受来自组氨酸激酶HK的磷酸基团从而实现活化。我们发现HK上较为动态的ATP lid影响磷酸传递过程却不影响HK的其它功能。本项目拟选用模式蛋白HK853-RR468为研究对象,运用核磁共振动态研究、蛋白质交联、基因突变、同位素标记、酶活测试等技术,在复合物层次上捕捉低丰度瞬态构象并阐述蛋白质结构、动态和功能之间的联系,从原子水平上揭示HK853的ATP lid在磷酸传递过程中对RR活化的作用。该研究将有助于深入理解细菌的信号转导机理,为新型抗菌药物的设计提供理论依据,用以抗击日益严重的“超级细菌”。
英文摘要
Two-component systems (TCS) regulate most important life processes of bacteria, which are potential targets of novel antibacterial drugs. A typical TCS consists of a histidine kinase (HK) and a response regulator (RR), transducing signals through phosphotransfer to trigger cellular regulation. It is not clear how response regulators are activated by receiving phosphoryl group from histidine kinases. Interestingly, we found that the dynamic ATP lid of HK plays an important role in phosphotransfer between HK and RR, but does not affect other functions of HK. In this project, HK853-RR468 was chosen as a model TCS. Low-population transient conformations would be investigated in the form of protein complex by using NMR technology, isotope labeling and protein cross-linking technology. Furthermore, the mechanism of RR activation regulated by ATP lid of HK853 through phosphotransfer would be elucidated in combination with gene mutagenesis and enzymologic assays. In light of the relationships between structure, dynamics and functions, the study would give us a better understanding on the mechanisms of two-component signal transduction systems and provide us theory basis for designing antibacterial drugs to beat back “super bacteria”.
双组分信号转导系统 (Two-component system, TCS) 调控细菌大多数重要的生命活动,由组氨酸激酶(Histidine kinase, HK)和应答调节蛋白 (Response regulator, RR) 两部分组成,通过磷酸转移实现信号转导,是重要的新型抗菌药物靶标。磷酸基团如何从组氨酸激酶传递至下游的应答调节蛋白从而实现活化是理解该信号转导机制的关键。本项目针对组氨酸激酶ATP lid如何影响信号转导进行了深入研究。我们综合运用核磁共振技术、X射线晶体衍射技术、原子探针标记技术,酶活测试以及细菌侵染实验等技术手段分别对HK、RR及其复合物,从原子水平、分子水平到细胞水平进行了系统研究,发现了:(1)ATP lid区域的突变影响HK蛋白的自激酶活性,并阐述了木犀草素对HK蛋白的抑制机理;(2)RR蛋白的动态活化机制,并揭示了可能的抑制剂结合位点,同时发展了一种蛋白质翻译后修饰的检测方法;(3)复合物状态下HK行使磷酸酶功能的pH调控分子机制以及酶促反应机理。本项目针对TCS磷酸转移机制的研究为新型抗菌药物的设计提供重要的研究基础。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
DOI:doi.org/10.1016/j.aca.2019.12.013
发表时间:2020
期刊:Analytica Chimica Acta
影响因子:6.2
作者:Huang Liqun;Kou Xinhui;Zheng Wenwen;Xiao Xiong;Li Conggang;Liu Maili;Liu Yixiang;Jiang Ling
通讯作者:Jiang Ling
A pH-gated conformational switch regulates the phosphatase activity of bifunctional HisKA-family histidine kinases.
pH 门控构象开关调节双功能 HisKA 家族组氨酸激酶的磷酸酶活性
DOI:10.1038/s41467-017-02310-9
发表时间:2017-12-13
期刊:Nature communications
影响因子:16.6
作者:Liu Y;Rose J;Huang S;Hu Y;Wu Q;Wang D;Li C;Liu M;Zhou P;Jiang L
通讯作者:Jiang L
DOI:doi: 10.1016/j.bbrc.2020.01.036.
发表时间:2020
期刊:Biochemical and Biophysical Research Communications
影响因子:--
作者:Ji Shixia;Luo Liang;Li Conggang;Liu Maili;Liu Yixiang;Jiang Ling
通讯作者:Jiang Ling
Chemical shift assignments of the catalytic and ATP-binding domain of HK853 from Thermotoga maritime
来自 Thermotoga Maritime 的 HK853 的催化和 ATP 结合结构域的化学位移分配
DOI:10.1007/s12104-019-09872-3
发表时间:2019
期刊:Biomolecular NMR Assignments
影响因子:0.9
作者:Zhou Yuan;Liu Xinghong;Li Conggang;Liu Maili;Jiang Ling;Liu Yixiang
通讯作者:Liu Yixiang
DOI:10.3390/molecules24050933
发表时间:2019-03-01
期刊:MOLECULES
影响因子:4.6
作者:Zhou, Yuan;Huang, Liqun;Jiang, Ling
通讯作者:Jiang, Ling
细菌应答调控蛋白N端结构域的变构机制研究
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