中国西南山区特有类群齿蟾属物种的分类学研究

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31201702
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    23.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0402.动物系统与分类
  • 结题年份:
    2015
  • 批准年份:
    2012
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2013-01-01 至2015-12-31

项目摘要

Exact species delimitation is fundamental for systematics, ecology and conservation biology. Morphological taxonomy is the base, but it often loses species diversity. Integrating multiple data and new methods of morphological taxonomy, molecular phylogenetics and ecological biogeography become popular on species delimitation. The genus oreolalax is endemic to the mountains of the southewestern China,but species taxonomy within it is still unclear and phylogenetic relationships within it was also unresolved. Therefore, our group will collect all known populations of this genus and study species taxonomy within it. We will use new phylogenetic methods based on coalescent rules to reconstruct the phylogenetic relationships among species of Oreolalax and conduct molecular species delimitation; further, we will conduct morphometric statistical analyses, comparing qualitative morphology among species and reconstruct evolutionary patterns of main morphological characters,and based on these results,we test taxonomy of this genus; finally, using ecological niche modeling we investigate ecological difference among species or lineages and provide ecological evidence for species delimitation. This work will provide new content on species taxonomy and delimitation of Chinese amphibians, and is in favour of researches on biogeography and conservation biology of this genus.
精确的物种分类是系统学、生态学和保护生物学等学科的重要基础。传统的形态学分类是分类学的基础,但形态分类往往会丢失物种多样性。整合形态学、新的分子系统学、生态生物地理学等多学科数据和方法对物种进行分类是现代分类学发展的趋势。齿蟾属是我国西南山区特有的两栖动物类群,其物种分类尚存诸多问题、系统发育关系未得到解决。因此,本项目以该属为研究对象,对其进行广泛的种群采样,整合多学科数据和方法对该属物种进行界定与分类厘定,构建新的自然分类系统。以溯祖原理为主导的新的分子系统学方法构建齿蟾属系统发育关系,并进行分子分类;根据形态量度统计分析、定性性状比较和形态特征演化的分析结果进行物种形态分类厘定;通过生态位建模检测不同物种或支系间的生态差异水平,为物种分类提供生态证据。本项研究的开展将丰富中国两栖动物分类学的研究内容,为齿蟾属的生物地理学和保护生物学的研究奠定基础。

结项摘要

本项目通过分子系统学、形态特征分析和生态生物地理模拟对主要分布于中国西南山区的齿蟾属进行了综合分类。本文通过广泛的采样共获取了齿蟾属所有已知物种的68个种群上千号的分子和标本材料,对所有物种代表性样品的8个线粒体基因片段和7个核基因片段进行了测序。本文检测了近千号标本的定性形态特征并测量了其形态量度。分子系统学结果表明,齿蟾属可能包含20个以上物种,分子结果识别出了3个隐含物种,但分子结果并不支持前人提出的齿蟾属分为四个种组的分类意见,该结果只支持秉志齿蟾种组的单系性,而其他种组并不聚为单系。多样性分析结果显示,横断山区-云贵高原北侧可能为齿蟾属的起源分化中心,其分化是沿着四川盆地两侧进行物种形成和扩散,但该属的总体物种形成速率却基本稳定。形态特征分析表明,远缘物种的形态差异十分显著,但近缘物种之间定性形状差异不间断,而定量分析也并不能完全将其分开。生态位模拟分析显示,不同的物种之间均存在生态位的差异,但也表现出远缘物种具有更为显著的生态差异。综合以上分析,齿蟾属现应包含物种至少20个,物种之间在分子上的差异明显,而近缘物种在形态和生态位上的差异不显著,齿蟾属的多样性演化较稳定。本文的研究为后续该区域多样性进化和生物地理学研究提供了重要的基础。本项目在规定期内顺利按计划完成,并资助发表了6篇SCI论文。

项目成果

期刊论文数量(6)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Phylogeographic Patterns of mtDNA Variation Revealed Multiple Glacial Refugia for the Frog Species Feirana taihangnica Endemic to the Qinling Mountains
mtDNA变异的谱系地理格局揭示了秦岭特有蛙种Feirana taihangnica的多重冰川庇护所
  • DOI:
    10.1007/s00239-013-9544-5
  • 发表时间:
    2013-03-01
  • 期刊:
    JOURNAL OF MOLECULAR EVOLUTION
  • 影响因子:
    3.9
  • 作者:
    Wang, Bin;Jiang, Jianping;Li, Cheng
  • 通讯作者:
    Li, Cheng
The complete mitochondrial genome of Oreolalax lichuanensis (Amphibia, Anura, Megophryidae).
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  • DOI:
    10.1080/23802359.2016.1143340
  • 发表时间:
    2016-10-03
  • 期刊:
    Mitochondrial DNA. Part B, Resources
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Wang G;Wang S;Liang X;Xie F;Jiang J;Wang B
  • 通讯作者:
    Wang B
Complete mitochondrial genome of Paramegophrys oshanensis (Amphibia, Anura, Megophryidae)
Paramegophrys oshanensis(两栖类、无尾目、Megophryidae)的完整线粒体基因组
  • DOI:
    10.3109/19401736.2013.766183
  • 发表时间:
    2013-10-01
  • 期刊:
    MITOCHONDRIAL DNA
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Xiang, Tianmin;Wang, Bin;Xie, Feng
  • 通讯作者:
    Xie, Feng
The complete mitochondrial genome of Oreolalax major (Amphibia, Anura, Megophryidae)
Oreolalax Major(两栖类、无尾类、Megophryidae)的完整线粒体基因组
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    Mitochondrial DNA
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Xiang Tianmin;Li Cheng;Jiang Jianping;Xie Feng
  • 通讯作者:
    Xie Feng
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  • DOI:
    10.3109/19401736.2015.1018235
  • 发表时间:
    2016-01-01
  • 期刊:
    MITOCHONDRIAL DNA PART A
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Deng, Xuyan;Wang, Shouhong;Deng, Liangji
  • 通讯作者:
    Deng, Liangji

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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