孤独症全基因组关联第二阶段研究

批准号:
81071110
项目类别:
面上项目
资助金额:
32.0 万元
负责人:
王力芳
依托单位:
学科分类:
H1008.儿童和青少年精神行为障碍
结题年份:
2013
批准年份:
2010
项目状态:
已结题
项目参与者:
杨晓玲、双梅、孙伟、秦健、李俊、郑凡凡、卢天兰、阮燕燕
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中文摘要
孤独症是一种起病于婴幼儿期的神经发育障碍。研究提示遗传因素在该病发病中起重要作用。孤独症全基因组关联研究(GWAS)克服了候选基因策略的局限性,有助于从全基因组水平发现新的易感基因。由于种族遗传异质性,亟待开展汉族人群孤独症GWAS研究。本课题组前期已完成汉族孤独症GWAS第一阶段研究,对240个孤独症家系进行了全基因组50万个单核苷酸多态性(SNPs)芯片检测,发现40余个与孤独症关联的SNP位点。本研究将另外收集较大孤独症家系样本,采用与前期工作相同的诊断标准(孤独症诊断访谈量表),降低样本的异质性;继而采用Sequenom MassARRAY等基因型检测方法,对GWAS第一阶段筛选出的具有显著意义的SNP位点进行第二阶段验证;以期发现新的孤独症神经发育相关易感基因,并对易感基因功能进行初步研究。本研究与前期工作密切衔接,预期结果将为孤独症病因与发病机制提供线索。
英文摘要
本项目采用多种国际通用的诊断标准,并引进相应工具,完成孤独症诊断访谈量表(ADI-R)、孤独症评定量表(CARS)、孤独症行为问题问卷(ABC)的评定,辅以较为完整的各项临床评估。采集儿童孤独症患者血样,以及其父母正常对照的血样,并提取DNA。目前已收集汉族儿童孤独症核心家系800余个,建立孤独症遗传资源库。.全基因组关联研究两阶段设计的第一阶段研究,并开展了第二阶段的研究。 在第一阶段的研究中,首先进行了240个家系的全基因组SNP芯片的检验,经过严格的质量控制后,去除1个家系,239个家系纳入统计分析。采用PLINK软件和FBAT进行全基因组以家系为基础的关联研究,发现多个具有显著性意义的SNP位点。在第二阶段研究中,选取P <1E-05的10余个位点在在另外独立样本约569余个孤独症家系中进行全基因组关联研究结果的2期验证,研究发现位于SMARCA2 基因上游的rs3847228 与孤独症关联,而且另外一个位于NRXN3基因的SNP(单核苷酸多态性)位点也与孤独症关联(P<0.05)。SMARCA2 参与染色质的重塑,使其他转录因子结合到DNA上,发挥转录活性,继而启动其他基因的表达。既往研究报道SMARCA2 与精神分裂症关联。SMARCA2 本研究进行了SMARCA2的功能研究,发现干扰SMARCA2 影响神经元迁移。NRXN3是参与突触形成的分子,既往研究发现参与突触形成的分子NLGN3、NLGN4、SHANK3、SHANK2等与孤独症关联,提示孤独症患者可能存在突触的异常。突触是一个神经元与另一个神经元相接触的部位。因此,突触是神经元之间在功能上发生联系的部位,也是信息传递的关键部位。既往研究曾发现NRXN家族中的NRXN1 基因与孤独症关联,但尚未有报道NRXN3 基因与孤独症关联。通路分析也发现,参与神经发育、树突形成的通路与孤独症关联。研究结果已投稿并修回。.全基因组关联研究也为易感基因关联研究提供了宝贵的线索。既往研究仅针对RELN基因进行关联分析,尚无DAB1基因与孤独症关联的报道。本课题组进一步针对通路分析发现,RELN通路上的DAB1 基因与孤独症关联。继而以全基因组关联研究为线索,发现DISC1,ATP2B2 是孤独症的易感基因。对ASMT基因测序发现孤独症患者存在罕见突变。共发表论著6篇,其中SCI收录论著5篇。..
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No association of polymorphisms in the CDK5, NDEL1, and LIS1 with autism in Chinese Han population
CDK5、NDEL1 和 LIS1 多态性与中国汉族人群自闭症无关联
DOI:10.1016/j.psychres.2011.08.004
发表时间:2011-12
期刊:Psychiatry Research
影响因子:11.3
作者:Wang L, Li J, Jia M, Yue W, Ruan Y, Lu T, Zhang J,
通讯作者:Wang L, Li J, Jia M, Yue W, Ruan Y, Lu T, Zhang J,
DOI:--
发表时间:2012
期刊:中国神经精神疾病杂志
影响因子:--
作者:王力芳;卢天兰;李俊;郑凡凡;阮燕燕;贾美香;岳伟华;刘靖;张岱
通讯作者:张岱
Evidence for association between Disrupted-in-Schizophrenia 1 (DISC1) gene polymorphisms and autism in Chinese Han population: a family-based association study.
中国汉族人群精神分裂症中断1(DISC1)基因多态性与自闭症之间关联的证据:基于家庭的关联研究
DOI:10.1186/1744-9081-7-14
发表时间:2011-05-15
期刊:Behavioral and brain functions : BBF
影响因子:--
作者:Zheng F;Wang L;Jia M;Yue W;Ruan Y;Lu T;Liu J;Li J;Zhang D
通讯作者:Zhang D
The evidence for association of ATP2B2 polymorphisms with autism in Chinese Han population.
ATP2B2 多态性与中国汉族人群自闭症相关的证据
DOI:10.1371/journal.pone.0061021
发表时间:2013
期刊:PloS one
影响因子:3.7
作者:Yang W;Liu J;Zheng F;Jia M;Zhao L;Lu T;Ruan Y;Zhang J;Yue W;Zhang D;Wang L
通讯作者:Wang L
Sequencing ASMT identifies rare mutations in Chinese Han patients with autism.
ASMT 测序鉴定出中国汉族自闭症患者的罕见突变
DOI:10.1371/journal.pone.0053727
发表时间:2013
期刊:PloS one
影响因子:3.7
作者:Wang L;Li J;Ruan Y;Lu T;Liu C;Jia M;Yue W;Liu J;Bourgeron T;Zhang D
通讯作者:Zhang D
孤独症表型差异的分子遗传基础及其致病机制研究
- 批准号:--
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:55万元
- 批准年份:2021
- 负责人:王力芳
- 依托单位:
孤独症脑内高表达易感基因突变位点筛选及致病机制研究
- 批准号:81971283
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:55.0万元
- 批准年份:2019
- 负责人:王力芳
- 依托单位:
孤独症相关miRNA的遗传筛选及其调控机制研究
- 批准号:81671363
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:52.0万元
- 批准年份:2016
- 负责人:王力芳
- 依托单位:
孤独症疾病相关突变位点高通量筛选及致病机制研究
- 批准号:81471383
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:80.0万元
- 批准年份:2014
- 负责人:王力芳
- 依托单位:
国内基金
海外基金
