中印区哈摇蚊属群DNA条形码及分子系统发育研究(双翅目:摇蚊科)

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31101653
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    23.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0402.动物系统与分类
  • 结题年份:
    2014
  • 批准年份:
    2011
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2012-01-01 至2014-12-31

项目摘要

利用中国研究材料上的优势,结合现代系统发育研究理论,采用比较形态学和分子系统学分析相结合的研究方式,开展中印区哈摇蚊属群DNA条形码及分子系统发育研究。其DNA条形码研究将为摇蚊科昆虫筛选出合适的分子标记,为建立摇蚊科昆虫DNA条形码数据库做好铺垫。系统发育分析将探求哈摇蚊属群的单系性以及各属之间的系统发育关系,构建其系统发育谱系,理清该类群分类系统的"脉络"。最终提供该类群在摇蚊科的系统发育和分类地位以及与邻近属群或属之间的系统发育关系,追溯该类群的起源和进化演变历史。求证全球淡水动物地理区划等国际上目前关注的问题。预期新见解的提出将解决长期悬而未决的哈摇蚊属群属级阶元系统发育上脉络不清的难题,为合理制定世界摇蚊科分类系统提供重要依据。

结项摘要

DNA条形码已经应用于双翅目多个类群的种类鉴定和系统发育分析,但国内关于摇蚊科DNA条形码的研究鲜有报道。本研究开展了中印区哈摇蚊属群COI基因DNA条形码和属间分子系统发育分析的研究。分析了哈摇蚊属群892个样本长度为658bp的COI序列,得到如下初步结论: COI氨基酸序列可以用来作为摇蚊科昆虫种级鉴定的分子标记。序列特征分析结果显示COI基因A+T含量(67%)明显高于C+G含量(33%),表现出明显的碱基偏倚性,这与大多数昆虫线粒体DNA基因具有明显的一致性。表达产生的氨基酸在组成上苯丙氨酸(F)使用量最高,其次是异亮氨酸(I),再次是亮氨酸(L),表达产生的氨基酸在组成上有一定的偏向性。针对形态变异较大的软铗小摇蚊(Microchironomus tener)开展了种内遗传距离分析,结果表明虽然软铗小摇蚊在体色及肛尖等结构上种间差异较大,但从分子水平上分析该种的遗传距离都在2%以内,属于种内范畴(3%)。针对形态学鉴定较困难的隐摇蚊属(Cryptochironomus)雄成虫开展了种间和种内遗传距离分析,结果表明最大种间遗传距离为15.6%,最小种间遗传距离为4.9%,最小种内遗传距离为0.07%,最大种内遗传距离为1.85%,分子标记COI能很好的区分形态学相近种及近缘种。在全序列分析的基础上,使用MEGA5.0软件构建了基于 Kimura-2-parameter 模型最大简约法(MP) 和邻接法(NJ)的哈摇蚊属群属间分子系统发育树,两种构建方法结果都表明哈摇蚊属群为单系群;Paracladopelma、Saetheria、Cladopelma、Cryptochironomus、Microchironomus、Parachironomus、Cyphomella和Robackia聚为一支,而Cryptotendipes、Harnischia、Olecryptotendipes、Demicryptochironomus聚为一支。Paracladopelma与Saetheria,Microchironomus与Parachironomus,Cryptotendipes与Harnischia各互为姐妹群。COI氨基酸序列可以用来作为摇蚊科属级高级阶元系统发育研究的分子标记。

项目成果

期刊论文数量(5)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
中印区克鲁斯摇蚊属系统学研究(双翅目:摇蚊科)
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
    Acta Zootaxonomica Sinica
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    闫春财;王新华;卜文俊;陈之光
  • 通讯作者:
    陈之光
spanA new species in the genus Paracladopelma Harnisch from China (Diptera: Chironomidae)/span
中国Parcladopelma Harnisch属一新种(双翅目:摇蚊科)
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
    Entomotaxonomia
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    YAN Chuncai;Wang Xinhua;Bu Wenjun
  • 通讯作者:
    Bu Wenjun
spanSaetheria Jackson from the Sino-Indian Region(Diptera: Chironomidae)/span
中印地区的 Saetheria Jackson(双翅目:摇蚊科)
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2011
  • 期刊:
    Zootaxa
  • 影响因子:
    0.9
  • 作者:
    YAN Chuncai;Ole Saether;Wang Xinha
  • 通讯作者:
    Wang Xinha
spanParachironomus Lenz from China and Japan (Diptera: Chironomidae)/span
来自中国和日本的Parachironomus Lenz(双翅目:摇蚊科)
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    ZooKeys
  • 影响因子:
    1.3
  • 作者:
    YAN Chuncai;Jiao Yan, Li Jiang, Qin Guo, Ting Liu, Xinyu Ge;Xinhua Wang;Bao ping PAN
  • 通讯作者:
    Bao ping PAN
spanTwo new species of Olecryptotendipes Zorina, 2007 from China (Diptera, Chironomidae)/span
中国油螟二新种,2007年(双翅目,摇蚊科)
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
    ZooKeys
  • 影响因子:
    1.3
  • 作者:
    YAN Chuncai;Wang Xinhua, Bu Wenjun
  • 通讯作者:
    Wang Xinhua, Bu Wenjun

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    --
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    --
  • 发表时间:
    --
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    --
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

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本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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