QM/MM-FEP法研究亚铁螯合酶催化卟啉金属化反应机理
批准号:
90608012
项目类别:
重大研究计划
资助金额:
30.0 万元
负责人:
沈勇
依托单位:
学科分类:
蛋白质、多肽与酶生物化学
结题年份:
2009
批准年份:
2006
项目状态:
已结题
项目参与者:
赖瑢、李俊、陈锦灿、钱力、绪连彩、廖思燕
中文摘要
以枯草杆菌(Bacillus subtilis)的亚铁螯合酶与N-methylmesoporphyrin(N-MeMP)共聚体的晶体结构为初始模型,建立QM/MM计算模型。通过QM/MM计算,确定亚铁离子插入卟啉环的通道、与亚铁离子配位的氨基酸残基及溶剂分子的配位数;解释配位的氨基酸残基在卟啉金属化过程中的作用;模拟金属离子分别与原卟啉IX上四个N原子结合过程以及两个N原子上H的脱除过程,寻找最佳
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3D-QSAR and docking studies of quinazoline derivatives with the inhibitory activity toward NF-kappa B
具有 NF-κ B 抑制活性的喹唑啉衍生物的 3D-QSAR 和对接研究
DOI:
--
发表时间:
--
期刊:
Qsar & Combinatorial Science
影响因子:
--
作者:
[Wang, Ya-Xue, Chen, Tao-Ju, Shen, Yong, Zheng, Kang-Cheng, Qian, Li, Chen, Jin-Can, Wu, Xiao-Tian]
通讯作者:
Wu, Xiao-Tian
DOI:
10.1016/j.jinorgbio.2009.09.013
发表时间:
2009-12
期刊:
Journal of inorganic biochemistry
影响因子:
3.9
作者:
[Yaxue Wang;Yong Shen;U. Ryde]
通讯作者:
Yaxue Wang;Yong Shen;U. Ryde
DOI:
10.1360/cjcp2007.20(2).135.5
发表时间:
2007-04
期刊:
Chinese Journal of Chemical Physics
影响因子:
1
作者:
[Jin-Can Chen;Yong Shen;Li Qian;Lanmei Chen;K. Zheng]
通讯作者:
Jin-Can Chen;Yong Shen;Li Qian;Lanmei Chen;K. Zheng
3D-QSAR AND DOCKING STUDIES OF NOVEL QUINAZOLINE ANALOGUES AS ORAL INHIBITORS TOWARDS AP-1 AND NF-kappa B
新型喹唑啉类似物作为 AP-1 和 NF-kappa B 口服抑制剂的 3D-QSAR 和对接研究
DOI:
--
发表时间:
--
期刊:
Journal of Theoretical & Computational Chemistry
影响因子:
2.4
作者:
[Liao, Si-Yan, Miao, Ti-Fang, Qian, Li, Shen, Yong, Zheng, Kang-Cheng, Lu, Hai-Liang]
通讯作者:
Lu, Hai-Liang
DOI:
--
发表时间:
--
期刊:
计算机与应用化学
影响因子:
--
作者:
[钱力, 沈勇, 王亚学, 郑康成]
通讯作者:
郑康成
共 6 条
KR2变异体传导钾、铯等阳离子传导机制研究及高效高选择性KR2变异体设计
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批准号:--
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项目类别:省市级项目
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资助金额:10.0万元
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批准年份:2021
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负责人:沈勇
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依托单位:
漆酶介体系统降解非酚类卤代农药的机理研究与介体分子设计
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批准号:21577179
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项目类别:面上项目
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资助金额:30.0万元
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批准年份:2015
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负责人:沈勇
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依托单位:
基于物种根系竞争的南亚热带森林群落构建机制
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批准号:31500338
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项目类别:青年科学基金项目
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资助金额:23.0万元
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批准年份:2015
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负责人:沈勇
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依托单位:
国内基金
海外基金