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QM/MM-FEP法研究亚铁螯合酶催化卟啉金属化反应机理
结题报告
批准号：
90608012
项目类别：
重大研究计划
资助金额：
30.0 万元
负责人：
沈勇
依托单位：
中山大学
学科分类：
C0505.蛋白质、多肽与酶生物化学
结题年份：
2009
批准年份：
2006
项目状态：
已结题
项目参与者：
赖瑢、李俊、陈锦灿、钱力、绪连彩、廖思燕
关键词：
QM/MM..FEP亚铁螯合酶原卟啉IX
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中文摘要
以枯草杆菌（Bacillus subtilis）的亚铁螯合酶与N-methylmesoporphyrin（N-MeMP）共聚体的晶体结构为初始模型，建立QM/MM计算模型。通过QM/MM计算，确定亚铁离子插入卟啉环的通道、与亚铁离子配位的氨基酸残基及溶剂分子的配位数；解释配位的氨基酸残基在卟啉金属化过程中的作用；模拟金属离子分别与原卟啉IX上四个N原子结合过程以及两个N原子上H的脱除过程,寻找最佳
英文摘要
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3D-QSAR and docking studies of quinazoline derivatives with the inhibitory activity toward NF-kappa B
具有 NF-κ B 抑制活性的喹唑啉衍生物的 3D-QSAR 和对接研究
DOI：--
发表时间：--
期刊：Qsar & Combinatorial Science
影响因子：--
作者：Wang, Ya-Xue;Chen, Tao-Ju;Shen, Yong;Zheng, Kang-Cheng;Qian, Li;Chen, Jin-Can;Wu, Xiao-Tian
通讯作者：Wu, Xiao-Tian
QM/MM study of the insertion of metal ion into protoporphyrin IX by ferrochelatase.
DOI：10.1016/j.jinorgbio.2009.09.013
发表时间：2009-12
期刊：Journal of inorganic biochemistry
影响因子：3.9
作者：Yaxue Wang;Yong Shen;U. Ryde
通讯作者：Yaxue Wang;Yong Shen;U. Ryde
3D-QSAR of Benzothiazole Derivatives as Potent Anticancer Agents
DOI：10.1360/cjcp2007.20(2).135.5
发表时间：2007-04
期刊：Chinese Journal of Chemical Physics
影响因子：1
作者：Jin-Can Chen;Yong Shen;Li Qian;Lanmei Chen;K. Zheng
通讯作者：Jin-Can Chen;Yong Shen;Li Qian;Lanmei Chen;K. Zheng
3D-QSAR AND DOCKING STUDIES OF NOVEL QUINAZOLINE ANALOGUES AS ORAL INHIBITORS TOWARDS AP-1 AND NF-kappa B
新型喹唑啉类似物作为 AP-1 和 NF-kappa B 口服抑制剂的 3D-QSAR 和对接研究
DOI：--
发表时间：--
期刊：Journal of Theoretical & Computational Chemistry
影响因子：2.4
作者：Liao, Si-Yan;Miao, Ti-Fang;Qian, Li;Shen, Yong;Zheng, Kang-Cheng;Lu, Hai-Liang
通讯作者：Lu, Hai-Liang
Theoretical studies on pyrimidine substituent derivatives as dual inhibitors of AP-1 and NF-κB
嘧啶取代基衍生物作为AP-1和NF-κB双重抑制剂的理论研究
DOI：10.1007/s00894-009-0609-8
发表时间：2010-06
期刊：Journal of Molecular Modeling
影响因子：2.2
作者：沈勇
通讯作者：沈勇
KR2变异体传导钾、铯等阳离子传导机制研究及高效高选择性KR2变异体设计
  • 批准号：
    --
  • 项目类别：
    省市级项目
  • 资助金额：
    10.0万元
  • 批准年份：
    2021
  • 负责人：
    沈勇
  • 依托单位：
    中山大学
漆酶介体系统降解非酚类卤代农药的机理研究与介体分子设计
  • 批准号：
    21577179
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    30.0万元
  • 批准年份：
    2015
  • 负责人：
    沈勇
  • 依托单位：
    中山大学
基于物种根系竞争的南亚热带森林群落构建机制
  • 批准号：
    31500338
  • 项目类别：
    青年科学基金项目
  • 资助金额：
    23.0万元
  • 批准年份：
    2015
  • 负责人：
    沈勇
  • 依托单位：
    中山大学
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