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漆酶介体系统降解非酚类卤代农药的机理研究与介体分子设计
结题报告
批准号:
21577179
项目类别:
面上项目
资助金额:
30.0 万元
负责人:
沈勇
依托单位:
学科分类:
B0601.理论环境化学
结题年份:
2017
批准年份:
2015
项目状态:
已结题
项目参与者:
余惠娟、吴景恒、侯成、徐剑桥、郑娟、丁小妹、周艺威、丁亚娟
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中文摘要
卤代农药使用广泛,其降解技术还不成熟,特别是非酚类卤代农药不能使用常用的微生物降解法(如漆酶)直接降解。虽然漆酶介体系统(Laccase Mediator System,LMS)能够把漆酶的底物范围扩大到一些非酚类的底物,然而已发现的介体对非酚类卤代农药如敌草隆、利谷隆、敌稗无明显激活漆酶氧化效果的作用。因而设计高效的漆酶介体对生物降解非酚类卤代农药具有十分重要的意义。目前由于对LMS作用机制的相关研究还不足够,难以根据反应特点设计对非酚类卤代底物有效的介体。本项目拟通过理论计算特别是QM/MM计算探索LMS催化机理,为设计漆酶介体提供可靠的参考依据。结合QSPR方法找出影响降解性能的因素,设计出高效的漆酶反应介体,并通过实验活性检测,筛选出环境友好的漆酶催化作用介体,为微生物高效专一降解非酚类卤代农药开创一条新的途径。
英文摘要
Degradation of widely used amides pesticides is a problem especially for non-phenolic amides pesticides which cannot be microbially degraded by common enzymes such as laccases. Although the substrate of laccase can be expanded to some non-phenolic compounds by laccase mediator system (LMS), current mediators reveal low activation on non-phenolic amides pesticides such as diuron, linuron and propanil in LMS. It is significant to design mediators for biodegradation of non-phenol amides pesticides. Since mechanism of LMS is not completely clear, it is difficult to design efficient mediators for non-phenolic amides substrate. In this project, theoretical study, especially QM/MM study, is employed for the exploration of catalytic mechanism of laccase to give further insight into LMS. QSPR method is utilized to find the significant structure factors which have important effect on LMS degradation, and to help designing mediators. Eco-friendly mediators for microbial degradation of non-phenolic amides pesticides are expected to be found by experimental screening of mediators.
漆酶介体系统(Laccase Mediator System,LMS)虽然能降解部分非酚类的底物,但已发现的介体对非酚类卤代农药如敌草隆、利谷隆、敌稗无明显激活漆酶氧化效果的作用。因而设计高效的漆酶介体对生物降解非酚类卤代农药具有十分重要的意义。本项目通过理论计算特别是QM/MM计算探索LMS催化机理,为设计漆酶介体提供可靠的参考依据。结合QSPR方法找出影响降解性能的因素,设计出高效的漆酶反应介体,并通过实验活性检测,筛选出环境友好的漆酶催化作用介体,为微生物高效专一降解非酚类卤代农药开创一条新的途径。.项目选用乙酰丁香酮和丁香醛等作为介体,在漆酶的氧化部位做了对接研究;确定了与介体分子结合的氨基酸残基,结合分子动力学模拟,确定了稳定的结合模式。建立以 T1 Cu 与乙酰丁香酮或丁香醛等介体及周围残基为量化部分的 QM/MM计算模型。针对活性三铜中心不同转移电子数,模拟氧化反应过程,确定了反应中间态,确定了最佳反应途径,阐明了影响反应快慢的关键氨基酸残基及介体分子结合部位及构象; 计算了不同介体结合下的漆酶催化的氧化还原电位及电荷传递过程,为设计介体分子建立了理论依据。根据催化机理计算结果,通过基于非线性模型的特征选择算法选择关键分子描述符,建立酶与介体结合的活性预测模型,设计新的介体分子,预测设计分子的活性性质,通过QM/MM计算模拟其降解效率,遴选出预测活性较高及QM/MM计算活化能较低的分子作为下一步筛选为及合成的候选分子。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
Human Ferrochelatase: Insights for the Mechanism of Ferrous Iron Approaching Protoporphyrin IX by QM/MM and QTCP Free Energy Studies
人铁螯合酶:通过 QM/MM 和 QTCP 自由能研究深入了解亚铁接近原卟啉 IX 的机制
DOI:10.1021/acs.jcim.6b00216
发表时间:2016-11
期刊:Journal of Chemical Information and Modeling
影响因子:5.6
作者:Wu Jingheng;Wen Sixiang;Zhou Yiwei;Chao Hui;Shen Yong
通讯作者:Shen Yong
KR2变异体传导钾、铯等阳离子传导机制研究及高效高选择性KR2变异体设计
  • 批准号:
    --
  • 项目类别:
    省市级项目
  • 资助金额:
    10.0万元
  • 批准年份:
    2021
  • 负责人:
    沈勇
  • 依托单位:
基于物种根系竞争的南亚热带森林群落构建机制
  • 批准号:
    31500338
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    23.0万元
  • 批准年份:
    2015
  • 负责人:
    沈勇
  • 依托单位:
QM/MM-FEP法研究亚铁螯合酶催化卟啉金属化反应机理
  • 批准号:
    90608012
  • 项目类别:
    重大研究计划
  • 资助金额:
    30.0万元
  • 批准年份:
    2006
  • 负责人:
    沈勇
  • 依托单位:
国内基金
海外基金