课题基金 / 基金详情

VEGF信号通路的系统生物学研究

批准号:
91539109
项目类别:
重大研究计划
资助金额:
80.0 万元
负责人:
张冰
依托单位:
学科分类:
心肌损伤、修复、重构和再生
结题年份:
2018
批准年份:
2015
项目状态:
已结题
项目参与者:
王娜、张文君、路兆宁、陈嘉焕

项目摘要

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项目成果

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中文摘要
血管内皮生长因子(VEGF)对于血管的发育和病理重构具有至关重要的作用。然而其下游的信号传导及转录机制尚未得到系统研究。 本课题拟采用先进的二代测序技术结合生物信息学和系统生物学等方法对VEGF 通路中的信号转导途径,转录机制和RNA转录组进行全面扫描和网络整合,为系统认识VEGF信号传导的机制,治疗血管相关疾病提供理论依据和分子靶标。
英文摘要
Vascular Endothelial Growth Factor (VEGF) is a central factor regulating vascular development and pathological remodeling. However, its downstream signal transduction and intra-nuclear transcription lack systematic interrogation. To resolve this question, in this study,we will employ multiple disciplinary approaches including next-generation sequencing, bioinformatics and systematic biology to gain a complete insight of intracellular signal, transcriptional regulation and transcriptome, and integrate them into a entire molecular network. The completion of this project will significantly advance the current understanding of VEGF signal pathway and potentially provide new targets for curative interference.
细胞行为受到表观遗传和转录机制的精确调节。但对胞外信号如何通过重塑遗传和转录机制调节基因表达,并进一步控制细胞的行为仍然缺乏系统的研究。在已建立的VEGF刺激血管新生模型的基础上,我们采用多组学方法结合生物信息学的方法, 在全基因组层面,对表观遗传修饰和转录因子的动态变化和相互作用机制进行了全面的阐述。我们发现受VEGF调控的基因, 其启动子区域内的正向表观遗传修饰如:H3K27ac, H3K4me3和H3K4me2的信号相对较强, 而在信号变化比较剧烈的启动子区, 则没有富集。短时间VEGF刺激引起了全基因组范围内增强子,包括超级启动子的信号变化,这些动态变化与VEGF调控的差异基因的表达有着密切的联系。 我们还进一步发现转录因子的全基因组变化是导致增强子变化进而影响基因表达的重要原因。 结合动态表达基因、动态增强子和转录因子信息,我们构建了控制血管新生的转录调控网络。通过MARINA对网络的分析, 我们首次揭示小MAF转录因子(small MAF, 主要包括MAFK, MAFF和MAFG)是其中的关键转录因子。 进一步功能实验证实:MAFF和MAFG而非MAFK对与血管新生基因的转录以及血管内皮细胞的增殖、迁移以及网络形成具有显著的促进作用。总之,这些结果揭示细胞外信号压力可以短时间内大范围重塑细胞内表观遗传和转录的机制,进而操控特定细胞的行为和功能。相关文章已被Genome Res接受。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
VEGF amplifies transcription through ETS1 acetylation to enable angiogenesis.
VEGF 通过 ETS1 乙酰化放大转录以促进血管生成
DOI: 10.1038/s41467-017-00405-x
发表时间: 2017-08-29
期刊: Nature communications
影响因子: 16.6
作者: [Chen J, Fu Y, Day DS, Sun Y, Wang S, Liang X, Gu F, Zhang F, Stevens SM, Zhou P, Li K, Zhang Y, Lin RZ, Smith LEH, Zhang J, Sun K, Melero-Martin JM, Han Z, Park PJ, Zhang B, Pu WT]
通讯作者: Pu WT
A dynamic and integrated epigenetic program at distal region orchestrates transcriptional responses to VEGFA.
远端区域的动态综合表观遗传程序协调对 VEGFA 的转录反应。
DOI: --
发表时间: --
期刊: Genome Res.
影响因子: --
作者: [Shiyan Wang, Jiahuan Chen, Sara P. Garcia, Xiaodong Liang, Fang Zhang, Pengyi Yan, Huijing Yu, Weiting Wei, Zixuan Li, Jingfang wang, Huangying Le, Zeguang Han, Xusheng Luo, Daniel S. Day, Sean M. Stevens, Yan Zhang, Peter J. Park, Zhi-jie Liu, Kun Sun, Guo-cheng Yuan, Willi]
通讯作者: Willi
Depletion of polycomb repressive complex 2 core component EED impairs fetal hematopoiesis.
多梳抑制复合物 2 核心成分 EED 的耗竭会损害胎儿造血功能
DOI: 10.1038/cddis.2017.163
发表时间: 2017-04-13
期刊: Cell death & disease
影响因子: 9
作者: [Yu W, Zhang F, Wang S, Fu Y, Chen J, Liang X, Le H, Pu WT, Zhang B]
通讯作者: Zhang B
LARP7调节血管内皮向间充质细胞转化的机制研究
  • 批准号:
    31872836
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    59.0万元
  • 批准年份:
    2018
  • 负责人:
    张冰
  • 依托单位:
ETS1促转录停滞释放和血管新生的分子机制研究
  • 批准号:
    31671503
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    60.0万元
  • 批准年份:
    2016
  • 负责人:
    张冰
  • 依托单位:
国内基金
海外基金