Sp1/Krüppel样转录因子在人类胚胎干细胞向红细胞分化中的作用机制

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

项目摘要

Sp1/Krüppel样因子(KLFs)是一组与真核细胞转录调控密切相关的锌指蛋白。它们通过调控大量富含GC启动子基因的表达，参与调节细胞增殖、分化、凋亡，以及肿瘤的发生、转移等诸多生理和病理过程。EKLF (Erythroid Krüppel-like factor) 即KLF1，是最早确定的KLFs家族成员，它通过调控?-珠蛋白的基因转录在红细胞系统的发育及分化过程中起着重要作用。本课题组以往利用高通量的测序平台，已经获得了人类胚胎干细胞及其定向分化的红细胞中的全基因组DNase I图谱。初步的研究表明：在KLFs家族成员所在的基因编码、或非编码区域内，存在着许多与红细胞分化有关的调控序列。本课题将在此工作基础之上，进一步研究与胚胎干细胞发育和红细胞分化相关的KLFs家族成员及其调控序列的生物学功能。

结项摘要

Sp1/Krüppel样因子(KLFs)是一组与真核细胞转录调控密切相关的锌指蛋白。它们通过调控大量富含GC启动子基因的表达，参与调节细胞增殖、分化、凋亡，以及肿瘤的发生、转移等诸多生理和病理过程。EKLF(Erythroid Krüppel-like factor)即KLF1，是最早确定的KLFs家族成员，它通过调控Beta-珠蛋白的基因转录在红细胞系统的发育及分化过程中起着重要作用。.染色体DNA对DNase I的敏感性是非常重要的表观遗传学指标，活跃转录基因所在区域的染色质结构会处于相对松散的状态，更易于被DNase I消化，因此被称为DNase I超敏感位点(DNase I Hypersensitive Sites, DHSs)。DHSs区域往往是低甲基化区，核小体结构缺失或异常。多种顺式调控元件已在DHSs区域被发现。本课题组利用高通量的测序平台，已经获得了人类胚胎干细胞及其定向分化的红细胞中的全基因组DNase I图谱。通过系统的生物信息学研究，在从上游70kb到下游20kb的KLFs基因区域内筛选确定了33个与红系分化相关的DHSs。荧光素酶报告基因分析发现22个DHSs能够激活通用启动子minP，18个DHSs能够激活基因特异性KLF启动子，其中12个被进一步鉴定为红系特异的KLF增强子调控序列。利用生物信息学软件确定了上述12个红系特异增强子含有共同序列(motif)，分析了可潜在结合于motif的转录因子。利用DNA凝胶阻滞试验(EMSA) 证明红系特异转录因子复合物与这些调控序列的结合特性。利用染色质免疫沉淀(ChIP)试验验证了部分KLFs成员参与了红系分化相关珠蛋白基因的调控。.根据课题需要，我们还初步研究了KLF3在斑马鱼早期造血过程中的作用。整胚原位杂交结果表明KLF3在斑马鱼原始造血过程中表达，KLF3表达水平的降低会引起红系特异性转录因子GATA-1表达水平的下降。KLF3在斑马鱼血管发育突变体中的表达下降，暗示KLF3可能参与调控斑马鱼的血管发育。.本项目不仅仅发现了与红细胞分化和发育相关的新的调控序列和调控分子，更重要的是，本研究系统和流程的建立加速了高通量测序技术的广泛应用，有助于其他研究组更加有效地获得和利用表观遗传信息，为今后的功能基因组研究奠定坚实的基础。

项目成果

期刊论文数量（5）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
Sp1/Krüppel样因子的研究进展
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    遗传
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    熊倩;阮修艳;方向东;XIONG Qian1,2, RUAN Xiu-Yan1, FANG Xiang-Dong1 1.K;2.Graduate University of Chinese Academy of Scienc
  • 通讯作者：
    2.Graduate University of Chinese Academy of Scienc
位点控制区(LCR)调控基因表达的研究进展
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    生命科学
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    王海;阮修艳;方向东;WANG Hai,RUAN Xiu-yan,FANG Xiang-dong~* (Key Labor
  • 通讯作者：
    WANG Hai,RUAN Xiu-yan,FANG Xiang-dong~* (Key Labor
Epigenetic modifications and chromosome conformations of the beta globin locus throughout development.
整个发育过程中β珠蛋白位点的表观遗传修饰和染色体构象。
  • DOI：
    10.1007/s12015-012-9355-x
  • 发表时间：
    2013-08
  • 期刊：
    STEM CELL REVIEWS AND REPORTS
  • 影响因子：
    4.8
  • 作者：
    Chang, Kai-Hsin;Fang, Xiangdong;Wang, Hao;Huang, Andy;Cao, Hua;Yang, Yadong;Bonig, Halvard;Stamatoyannopoulos, John A.;Papayannopoulou, Thalia
  • 通讯作者：
    Papayannopoulou, Thalia
KLFs对珠蛋白基因表达和红系分化的调控作用
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    中国生物化学与分子生物学报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    熊倩;张昭军;方向东;XIONG Qian1),2),ZHANG Zhao-Jun1),FANG Xiang-Dong1);2) Graduate University of Chinese Academy of Scien
  • 通讯作者：
    2) Graduate University of Chinese Academy of Scien
染色质构象调控真核基因的表达
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2011
  • 期刊：
    遗传
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    亓合媛;张昭军;李雅娟;方向东
  • 通讯作者：
    方向东

数据更新时间：{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI：
    {{ item.doi || "--"}}
  • 发表时间：
    {{ item.publish_year || "--" }}
  • 期刊：
    {{ item.journal_name }}
  • 影响因子：
    {{ item.factor || "--"}}
  • 作者：
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者：
    {{ item.author }}

数据更新时间：{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者：
    {{ item.authors }}

数据更新时间：{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者：
    {{ item.authors }}

数据更新时间：{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者：
    {{ item.authors }}

数据更新时间：{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者：
    {{ item.authors }}

数据更新时间：{{ patent.updateTime }}

其他文献

基于新顶压法规的仿真精度分析与优化
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2018
  • 期刊：
    现代制造工程
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    李健;方向东;陈梓铭;徐小旭;刘志文;李落星
  • 通讯作者：
    李落星
表观遗传学在法医学中的应用研究进展
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2012
  • 期刊：
    法医学杂志
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    杨雅冉;王鹏翔;方向东;严江伟
  • 通讯作者：
    严江伟
不同日龄丝羽乌骨鸡器官组织学结构发育变化
  • DOI：
    10.16372/j.issn.1004-6364.2019.04.011
  • 发表时间：
    2019
  • 期刊：
    中国家禽
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    刘志伟;丘伟巍;崔磊;李东;杨永平;方向东;阮征;彭克美
  • 通讯作者：
    彭克美
基因编辑在镰状细胞贫血症治疗中的研究进展
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2018
  • 期刊：
    发育医学电子杂志
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    肖茹丹;任云晓;张昭军;方向东
  • 通讯作者：
    方向东
KLF1和KLF9对K562细胞红系分化的协同调控作用
  • DOI：
    10.16288/j.yczz.18-174
  • 发表时间：
    2018
  • 期刊：
    遗传
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    任岚;肖茹丹;张倩;娄晓敏;张昭军;方向东
  • 通讯作者：
    方向东

其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI：
    {{ item.doi || "--" }}
  • 发表时间：
    {{ item.publish_year || "--"}}
  • 期刊：
    {{ item.journal_name }}
  • 影响因子：
    {{ item.factor || "--" }}
  • 作者：
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者：
    {{ item.author }}
empty
内容获取失败，请点击重试
重试联系客服
title开始分析
查看分析示例
此项目为已结题，我已根据课题信息分析并撰写以下内容，帮您拓宽课题思路：

AI项目思路

AI技术路线图

方向东的其他基金

NEAT1通过介导细胞自噬调控终末红系分化的作用机制研究
  • 批准号：
    82270126
  • 批准年份：
    2022
  • 资助金额：
    52.00 万元
  • 项目类别：
    面上项目
NEAT1通过介导细胞自噬调控终末红系分化的作用机制研究
  • 批准号：
  • 批准年份：
    2022
  • 资助金额：
    52 万元
  • 项目类别：
    面上项目
维生素C调控红系分化的分子机制研究
  • 批准号：
  • 批准年份：
    2020
  • 资助金额：
    55 万元
  • 项目类别：
    面上项目
染色质构象调控lncRNA在造血干细胞红系分化中的作用机制研究
  • 批准号：
    81670109
  • 批准年份：
    2016
  • 资助金额：
    57.0 万元
  • 项目类别：
    面上项目
转录因子KLFs调控干细胞红系分化的分子网络机制
  • 批准号：
    31471115
  • 批准年份：
    2014
  • 资助金额：
    88.0 万元
  • 项目类别：
    面上项目

相似国自然基金

{{ item.name }}
  • 批准号：
    {{ item.ratify_no }}
  • 批准年份：
    {{ item.approval_year }}
  • 资助金额：
    {{ item.support_num }}
  • 项目类别：
    {{ item.project_type }}

相似海外基金

{{ item.name }}
{{ item.translate_name }}
  • 批准号：
    {{ item.ratify_no }}
  • 财政年份：
    {{ item.approval_year }}
  • 资助金额：
    {{ item.support_num }}
  • 项目类别：
    {{ item.project_type }}
{{ showInfoDetail.title }}

作者：{{ showInfoDetail.author }}

知道了

AI项目解读示例

课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
关闭
close
客服二维码