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碳青霉烯类抗生素压力下OXA-23质粒与鲍曼不动杆菌基因组协同进化机制
结题报告
批准号:
31970128
项目类别:
面上项目
资助金额:
56.0 万元
负责人:
华孝挺
依托单位:
学科分类:
病原细菌学
结题年份:
2023
批准年份:
2019
项目状态:
已结题
项目参与者:
华孝挺
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中文摘要
鲍曼不动杆菌通过基因组突变及从外界获得耐药基因快速产生包括碳青霉烯类在内的几乎所有抗菌药物耐药,给全球抗感染治疗带来重大挑战。在我国鲍曼不动杆菌最主要的碳青霉烯耐药机制为获得OXA-23耐药基因,然而OXA-23基因在碳青霉烯耐药鲍曼不动杆菌(CRAB)中优势地位如何形成尚不明确,尤其是极易快速传播的质粒介导OXA-23基因。前期研究已获得携带OXA-23质粒的体外突变株和双拷贝质粒株。本研究拟将携带OXA-23质粒转入鲍曼不动杆菌标准株和临床分离株,在碳青霉烯抗生素压力下进行体内外传代获得更多突变株,通过比较基因组研究,发现调控进化的关键突变位点;结合上位效应、转录组和代谢组学,阐明关键突变位点在协同进化中的作用;通过携带OXA-23双拷贝质粒鲍曼不动杆菌在多种条件下耐药性、适应性和转录组学研究,揭示OXA-23双拷贝质粒在鲍曼不动杆菌协同进化中的作用。为CRAB耐药控制提供全新策略。
英文摘要
Acinetobacter baumannii rapidly develops almost all antimicrobial resistance, including carbapenems, through genomic mutations and acquired resistance gene, posing significant challenges to global anti-infective treatment. The most important carbapenem resistance mechanism in Acinetobacter baumannii in China is to obtain OXA-23 resistance gene, but how the dominant position of OXA-23 gene is formation in carbapenem-resistant A. baumannii (CRAB), that is still unclear, especially for OXA-23 plasmids that are highly prone to rapid spread. Previous studies have obtained in vitro mutant carrying the OXA-23 plasmid and double copy OXA-23 plasmid strains. This study intends to transfer the OXA-23 plasmid into the standard strain and clinical isolate of A. baumannii, and obtain more mutants in vitro and in vivo under the pressure of carbapenem antibiotics, through comparative genomic studies, found key evolution regulation mutation sites; using epistasis, transcriptome, and metabolomics to elucidate the role of key mutations in co-evolution; study resistance, fitness and transcriptomics by carrying the OXA-23 double-copy plasmid A. baumannii under a variety of conditions revealed the role of the OXA-23 double copy plasmid in the co-evolution of A. baumannii. Provide a new strategy for CRAB resistance control.
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
BacAnt: A Combination Annotation Server for Bacterial DNA Sequences to Identify Antibiotic Resistance Genes, Integrons, and Transposable Elements.
BACANT:细菌DNA序列的组合注释服务器,以鉴定抗生素耐药性基因,整合元和转座元件。
DOI:10.3389/fmicb.2021.649969
发表时间:2021
期刊:Frontiers in microbiology
影响因子:5.2
作者:Hua X;Liang Q;Deng M;He J;Wang M;Hong W;Wu J;Lu B;Leptihn S;Yu Y;Chen H
通讯作者:Chen H
DOI:10.1016/j.lanwpc.2023.100780
发表时间:2023-08
期刊:LANCET REGIONAL HEALTH-WESTERN PACIFIC
影响因子:7.1
作者:Doughty, Emma L.;Liu, Haiyang;Moran, Robert A.;Hua, Xiaoting;Ba, Xiaoliang;Guo, Feng;Chen, Xiangping;Zhang, Linghong;Holmes, Mark;van Schaik, Willem;Mcnally, Alan;Yu, Yunsong
通讯作者:Yu, Yunsong
DOI:10.1093/bib/bbac521
发表时间:2023
期刊:Briefings in Bioinformatics
影响因子:--
作者:Mengjie Shao;Nanjiao Ying;Qian Liang;Nan Ma;Sebastian Leptihn;Yunsong Yu;Huan Chen;Chengzhi Liu;Xiaoting Hua
通讯作者:Xiaoting Hua
Novel tigecycline resistance mechanisms in Acinetobacter baumannii mediated by mutations in adeS, rpoB and rrf.
由adeS、rpoB和rrf突变介导的鲍曼不动杆菌新的替加环素耐药机制
DOI:10.1080/22221751.2021.1948804
发表时间:2021-12
期刊:Emerging microbes & infections
影响因子:13.2
作者:Hua X;He J;Wang J;Zhang L;Zhang L;Xu Q;Shi K;Leptihn S;Shi Y;Fu X;Zhu P;Higgins PG;Yu Y
通讯作者:Yu Y
DOI:10.1093/jac/dkaa389
发表时间:2021-01-01
期刊:JOURNAL OF ANTIMICROBIAL CHEMOTHERAPY
影响因子:5.2
作者:Hua, Xiaoting;Moran, Robert A.;Yu, Yunsong
通讯作者:Yu, Yunsong
鲍曼不动杆菌甲基化酶Trm介导依拉环素耐药新机制
  • 批准号:
    32270183
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    54万元
  • 批准年份:
    2022
  • 负责人:
    华孝挺
  • 依托单位:
鲍曼不动杆菌头孢地尔异质性耐药机制研究
  • 批准号:
    32111530123
  • 项目类别:
    国际(地区)合作与交流项目
  • 资助金额:
    9.9万元
  • 批准年份:
    2021
  • 负责人:
    华孝挺
  • 依托单位:
鲍曼不动杆菌噬菌体治疗的分子机制研究
  • 批准号:
    --
  • 项目类别:
    国际(地区)合作与交流项目
  • 资助金额:
    39万元
  • 批准年份:
    2020
  • 负责人:
    华孝挺
  • 依托单位:
鲍曼不动杆菌体内适应性和耐药性进化趋势及机制
  • 批准号:
    31770142
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    55.0万元
  • 批准年份:
    2017
  • 负责人:
    华孝挺
  • 依托单位:
万古霉素耐药肠球菌依赖于错配修复途径的点突变机制研究
  • 批准号:
    81101284
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    22.0万元
  • 批准年份:
    2011
  • 负责人:
    华孝挺
  • 依托单位:
国内基金
海外基金