"内共生学说"认为叶绿体起源于蓝藻，线粒体起源于α-Protobacteria，内共生过程中细胞器丢失了不必需的基因，并且相当量的基因转移到核基因组中。丢失或向核内转移大量基因以及核编码蛋白重新搬运回内共生细胞器后，叶绿体和线粒体的代谢网络结构与其祖先细胞相比发生了怎样的变化？这种变化对细胞器的功能特化、系统的稳健性及适应性有哪些影响？以往的研究大多通过基因组或蛋白质组的信息分析内共生过程中基因的丢失、转移和改变，还未见从代谢网络的系统观点揭示内共生过程中进化机制及适应性的研究。本项目利用现有数据库和文献信息重构叶绿体与蓝藻、线粒体与α-Protobacteria的代谢网络，比较拓扑结构的相同和不同，发现水平基因转移模式，阐明网络进化机制，揭示代谢网络结构的变化对系统稳健性和适应性的影响，对于更深入理解内共生过程中的进化机制具有重要价值，对于从系统生物学水平研究物种进化具有重要的理论意义。