MII-Y-STR单倍型遗传结构与Y染色体单倍群关联性的法医学祖先推断探索研究
结题报告
批准号:
81601651
项目类别:
青年科学基金项目
资助金额:
18.0 万元
负责人:
边英男
学科分类:
H2502.法医物证学及法医人类学
结题年份:
2019
批准年份:
2016
项目状态:
已结题
项目参与者:
柳燕、赵琪、李敏、朱如心
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中文摘要
案件现场生物检材的个体祖先来源推断是法医学研究前沿之一。Y染色体单倍群是推断男性个体祖先来源的重要手段。目前通过繁复的SNP分型来判定Y染色体单倍群的方法严重地限制了Y染色体单倍群在法医学中的应用。我们前期的研究结果提示,通过Y-STR单倍型可以预测样本Y染色体单倍群并用于祖先推断。因此,本课题旨在以我们提出的高信息性独立型Y-STR标记(MII-Y-STR)为基础,对MII-Y­STR单倍型遗传结构与Y染色体单倍群的关联性进行研究,继而开展其用于法医学祖先推断的探索研究,包括:1)筛选适于单倍群预测的MII-Y-STRs;2)阐明MII-Y-STR单倍型遗传结构与Y染色体单倍群的关联性,并构建Y染色体单倍群预测模型和算法;3)在人群MII-Y-STR单倍型遗传结构和Y染色体单倍群关联数据的基础上,对预测模型进行验证和法医学评价,为法医学生物检材个体祖先推断提供新技术。
英文摘要
One of the cutting-edge of science research for forensic genetics is to infer ethnic origin or bio-geographical ancestry of DNA samples in the scene of a crime. Y chromosome SNP haplogroups could provide important information for tracing the male line of descent. One of the challenges for forensic geneticists is the cost and time typically needed to genotype an appropriate number of SNPs to assign a given Y chromosome to a haplogroup. Our previous researches have indicated that the haplogroup information of a given Y chromosome predicted by its STR haplotypes could be used to inferred the ethnic origin or bio-geographical ancestry of DNA samples. The aim of this project is to realize this possibility by constructing a suite of modern machine learning algorithms which can automatically classify and predict haplogroups based on allelic data from a suite of Y-STRs. To achieve this aim we will, firstly, explore the maximally informative independent Y-STR markers (MII-Y-STRs) in Y chromosome as candidates for haplogroup prediction, and clarify the relationships between MII-Y-STR haplotypes and Y chromosome haplogroups. Then, the adaptability of the haplogroup prediction method for forensic genetics will be evaluated.
案件现场生物检材的个体祖先来源推断是法医学研究前沿之一。Y染色体单倍群是推断男性个体祖先来源的重要手段。目前通过繁复的SNP分型来判定Y染色体单倍群的方法严重地限制了Y染色体单倍群在法医学中的应用。本研究的目标是找到群体间差异显著、信息含量高且相互独立的高信息性独立型Y-STR标记(maximally informative & independent marker,MII-Y-STR),并对其进行适当组合,提高了单倍群预测精准度和效率,为基于Y-STR单倍型的Y染色体单倍群预测提供了有益探索,为相关试剂盒的开发提供新的参考信息。本课题实现的研究目标,包括:1)筛选了适合于Y染色体单倍群预测的MII-Y-STR标记;2)明确了MII-Y-STR单倍型遗传结构与Y染色体单倍群之间的关联性;3)构建了基于MII-Y-STR单倍型遗传结构的Y染色体单倍群预测模型并对其用于法医学祖先推断进行了探索和评价。
期刊论文列表
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DOI:--
发表时间:2018
期刊:法医学杂志
影响因子:--
作者:李亚男;李敏;姜磊;栾晓辉;梁娜;徐倩男;张家硕;唐铭池;边英男;陈丽琴
通讯作者:陈丽琴
DOI:10.1016/j.fsigss.2019.10.201
发表时间:2019-12
期刊:Forensic Science International: Genetics Supplement Series
影响因子:--
作者:Min Li;Tingzhi Que;Yilun Zhang;Lei Huang;Jinlin Li;Meng Meng;Chengtao Li;Yingnan Bian
通讯作者:Yingnan Bian
DOI:--
发表时间:2019
期刊:中国司法鉴定
影响因子:--
作者:姜磊;徐倩楠;朱如心;盛翔;李莉
通讯作者:李莉
A study of the genetic diversity in the Heze Han population using a novel genotyping system based on 24 Y-chromosomal STR loci
利用基于 24 个 Y 染色体 STR 位点的新型基因分型系统研究菏泽汉族人群遗传多样性
DOI:10.1016/j.fsigss.2017.09.047
发表时间:2017-12-01
期刊:FORENSIC SCIENCE INTERNATIONAL GENETICS SUPPLEMENT SERIES
影响因子:--
作者:Li, Min;Que, Tingzhi;Li, Chengtao
通讯作者:Li, Chengtao
DOI:--
发表时间:2019
期刊:中国司法鉴定
影响因子:--
作者:孟孟;张轶轮;李敏;刘二珍;刘照俊;李成涛;沈星辉;边英男
通讯作者:边英男
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