急性髓系白血病普遍依赖JMJD1C生存的功能机制研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81870122
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    57.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H0809.白血病
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2018
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2019-01-01 至2022-12-31

项目摘要

Acute Myeloid Leukemia (AML) is a type of highly heterogeneous malignancy, characterized by the rapid growth of abnormal cells that accumulate in blood system and interfere with normal blood homeostasis. Advances in AML treatment have resulted in improved remission and cure rates, but much work still remains to be done for effective treatment. Our previous studies found that different types of AML with various genetic backgrounds showed universal reliance on an epigenetic factor, JMJD1C. However, the mechanism behind it is still unclear. Based on our previous studies and preliminary results, in many AML cells, including t(8,21) AML, several transcription factors could recruit JMJD1C to chromatin through physical interactions. Therefore, we hypothesize that there is a universal transcriptional program that controls the survival of AML cells with different genetic backgrounds. In order to validate our hypothesis, we designed a series of biochemical, molecular and cellular biology experiments to identify key components of the universal transcriptional program, including upstream transcription factors and downstream target genes. The identification of such a transcriptional program and the investigation of the functional mechanism behind it, can help us understand the common survival mechanism of different AML cells, and this can thereby help identify potential universal therapeutic targets for treatment of different types of AML.
急性髓系白血病(AML)是一种具有高度异质性的癌症,表现为癌细胞快速增长并在造血系统内积累,干扰正常造血平衡。几十年来白血病的治疗一直没有显著性进展,因此急需一些新的有效的治疗方法。我们前期的研究发现不同遗传背景的AML对表观遗传分子JMJD1C具有普遍依赖性,但这其中的依赖机理我们仍不清楚。我们的前期研究和预实验结果显示,在包括t(8,21)AML等多种AML细胞中,JMJD1C通过和一些转录因子的相互作用被招募到基因组上并调节癌症基因表达。因此,我们推测在不同AML中存在一个通用的转录程序可以介导不同AML细胞生存。为了验证我们的猜想,本研究设计了一系列的生化分子和细胞生物学实验,希望鉴定到通用转录程序的关键组分,包括上游转录因子和下游靶基因。通过对转录程序在维持各类型AML细胞中功能机制的研究,来帮助理解不同AML细胞生存维持的共同机制并可以为不同AML的治疗提供潜在的共同靶标。

结项摘要

急性髓系白血病(AML)是一种具有高度异质性的癌症,表现为癌细胞快速增长并在造血系统内积累,干扰正常造血平衡。白血病的致癌机理研究虽然近些年来进步很多,但是治疗手段还未有显著性改进,因此急需一些新的有效的治疗靶标。我们前期的研究发现不同遗传背景的AML对表观遗传分子JMJD1C具有普遍依赖性,但这其中的依赖机理我们仍不清楚。本项目通过一系列分子生物学,生物化学方法,结合高通量测序手段,鉴定出白血病转录因子RUNX1是各种不同遗传背景的白血病细胞依赖JMJD1C的关键因素,并且阐述了RUNX1和JMJD1C在不同类型白血病中激活基因表达的分子机制。本项目首先结合IP-质谱和ChIP-seq等手段,鉴定了RUNX1为在不同白血病背景下招募JMJD1C至染色质的转录因子;然后通过CRISPR-Cas9 结构域筛选鉴定JMJD1C的N端对于白血病生存至关重要;然后证实在不同AML细胞系中,JMJD1C与RUNX1直接相互作用,且共同表达AML所需的转录谱;最后,我们发现JMJD1C的N端具有液-液相变的能力,且通过此能力与RUNX1介导下游靶基因的表达。在四年内,本课题组完成了申请书中的研究目标,且在资助期内受此项目的支持发表3篇通讯作者文章。另外还有一篇关于JMJD1C的文章正在撰写投稿过程中。 本研究通过鉴定各类遗传背景的AML依赖的通用转录程序来探索各类AML对JMJD1C的依赖机理,鉴定到新的临床制药的靶蛋白RUNX1和下游靶基因。这项研究帮助理解不同AML细胞生存维持的共同机制并可以为不同AML的治疗提供潜在的共同靶标。

项目成果

期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Defining pervasive transcription units using chromatin RNA-sequencing data.
使用染色质 RNA 测序数据定义普遍转录单位。
  • DOI:
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  • 发表时间:
    2022-06-17
  • 期刊:
    STAR protocols
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
  • 通讯作者:
LYL1 facilitates AETFC assembly and gene activation by recruiting CARM1 in t(8;21) AML.
LYL1 通过在 t(8;21) AML 中招募 CARM1 来促进 AETFC 组装和基因激活。
  • DOI:
    10.1073/pnas.2213718119
  • 发表时间:
    2022-10-18
  • 期刊:
    PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA
  • 影响因子:
    11.1
  • 作者:
    Chen, Qian;Cevher, Murat A.;Jiang, Qi;Wang, Saisai;Sun, Xiaojian;Roeder, Robert G.;Chen, Mo
  • 通讯作者:
    Chen, Mo

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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