本项目首先利用染色体基因组荧光原位杂交技术分析百合材料，明确了它们染色体倍性和基因组构成，从中筛选和培育出共20余个异源三倍体百合，它们的基因组构成为:LAA，LLA，OTO和OTT；然后利用LAA和OTO百合作母本和二倍体或四倍体杂交获得了大量的非整倍体后代，该结果表明这些三倍体百合尽管雄性不育，但作母本可以产生有功能的配子，支持了“胚乳中5个相同的基因组是百合胚乳发育和杂交成功关键”的百合育种新理论。同时我们用基因组荧光原位杂交技术分析了亲本和后代的基因组构成，后代结果表明了通过三倍体百合得到不同程度外源基因渗入，引起后代较大变异，这一点也从一些开花的非整倍体得到证实。为了分析外源基因如何对性状发生作用，本项目构建了铁炮百合的DNA文库，并对其中的288个克隆进行了测序，下一步是从这些克隆中筛选出染色体标记，从而将外源基因与性状表达关联在一起。