应用基因组学方法研究东北嫩江流域青铜时代古人群组成与来源

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基本信息

  • 批准号:
    41472024
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    90.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    D0201.古生物、古人类和古生态学
  • 结题年份:
    2018
  • 批准年份:
    2014
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2015-01-01 至2018-12-31

项目摘要

Nenjiang region is one of the cradle of human civilization and ancient ethnic groups in Northeast Asia. The archeaological study showed that the ancient human in this region created regional culture with obvious geographical characteristics and developed an integrated early culture sequence. The compositions and sources of ancient population who created this civilization are still unclear, and the origin of ancient ethnic groups has been a hot topic of multidisciplinary debate.Based on the study of ancient population lived in the middle plain and Weat Liao River Region in the Southern of northeat China, we collected the ancient samples from the archeaological sites belonged to the Hanshu Culture, which is the heyday in the Bronze Age, and has explicit ethnic property. The ancient human mitochondrial and Y chromosome genome will be tested by the genomic techniques in order to determine the high-resolution maternal and paternal lineages; reconstruct the phylogenetic relationship among ancient and extant populations in Nenjiang region and surrounding areas, and ultimately speculation the source of ancient nenjiagn region population. The study can offer important informatoin to explore the formation and development of prehistorical culture, origin of regional ethnic groups and evolution, and formation and differentiation of extant human populations in the Nenjiang region.
嫩江流域是东北亚重要的古文明起源地之一,也是多个古民族的发祥地。考古学研究表明该流域具有鲜明的自身文化传统和完整的早期文化发展序列,但对于创造这一文明的古人类的组成和来源研究却是空白,同时东北古民族的族源问题也一直是多学科争论的热点。本研究在已有的中原和东北南部西辽河地区古人群研究的基础上,以嫩江流域青铜文化发展鼎盛阶段且具有明确民族属性的汉书文化墓葬出土的古人类样本为研究对象,使用新一代测序技术,结合自行设计的捕获方法,测定古样本的线粒体基因组和Y染色体非重组区全序列,以确定高分辨率的古人群母系和父系组成谱系;重建青铜时代嫩江流域与同一时期周边考古文化人群以及该流域现存人群的系统发生关系;探明古人群的组成成分与来源;为探讨嫩江流域史前文化的形成与发展、该地域古民族的起源以及现存人群的形成与分化奠定基础。

结项摘要

嫩江流域是东北亚重要的古文明起源地之一,也是多个古民族的发祥地。考古学研究表明该流域具有鲜明的自身文化传统和完整的早期文化发展序列,但对于创造这一文明的古人类的组成和来源研究却是空白,同时东北古民族的族源问题也一直是多学科争论的热点。.本研究在已有的中原和东北南部西辽河地区古人群研究的基础上,使用新一代测序技术,结合自行设计的捕获方法,从吉林大安后套木嘎遗址中石器至铁器时代104例样本中成功获得了20个样本的全基因组数据,其中中石器时代样本的测序深度为34X,为后续的古DNA研究提供了高质量的参考基因组。全基因组主成分分析结果显示后套木嘎不同时期的人群内部以及与同一地理区域的现代人群(如鄂伦春和赫哲)能够很好的聚类,说明自中石器时代起,嫩江流域人群的基因结构并没有发生大的变化,人群表现出非常强的遗传连续性。应用f3-statistics对人群的基因流动进行检测,与主成分分析的结果一致,嫩江流域古代与现代人群表现出很强的基因流。应用f4-statistics和人群混合度分析(Admixture)也得到了相似的结果。.研究表明嫩江流域由于其独特的地理位置和环境以及丰富的渔业、林业资源为当地人狩猎-采集-渔猎的生活方式提供了丰富的食物来源, 从中石器时代至今,尽管嫩江流域南部紧邻的辽河地区人群受到了南方农业人群向北方的大规模扩张的影响,嫩江流域不同时期人群结构并没有发生明显改变一直保持着高度的遗传联系性。本项目重建嫩江流域从中石器至早期铁器时代古代人类以及其与该流域现存人群的系统发生关系;阐明了古人群的组成成分与来源;为探讨嫩江流域史前文化的形成与发展、该地域古民族的起源以及现存人群的形成与分化奠定基础。

项目成果

期刊论文数量(1)
专著数量(0)
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会议论文数量(2)
专利数量(1)

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  • 作者:
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  • 通讯作者:
    王海晶

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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