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GPI-LU亚家族蛋白的结构研究

批准号:
31670739
项目类别:
面上项目
资助金额:
63.0 万元
负责人:
黄明东
依托单位:
学科分类:
结构生物学
结题年份:
2020
批准年份:
2016
项目状态:
已结题
项目参与者:
袁彩、江龙光、胡萍、蒋利宾、林华建、陈亚玉

项目摘要

结项摘要

项目成果

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中文摘要
Ly-6/uPAR(LU)结构域家族成员是二硫键保守的三指状蛋白。含GPI锚的GPI-LU亚家族成员主要在细胞黏连和信号传导方面起作用,与人类疾病紧密相关。由于蛋白后翻译修饰的复杂性及结构的灵活性,这类蛋白的X射线结构测定比较困难,目前关于这类蛋白的结构研究尚少。作为无胞内结构域的蛋白,它们如何通过二聚体介导胞外信号的传导?它们如何与配体相互作用、这种相互作用是否诱导GPI-LU的构象变化?这些问题都有待结构信息进行解决。本申请拟研究这类蛋白中C4.4A、LYPD4、TEX101、Haldisin和CD177的原子水平结构、CD59和uPAR的同源二聚体结构,及CD177与配体的复合物结构。本申请将有助于深入了解这类蛋白发挥功能的分子基础,为以这类蛋白为靶点的药物设计提供理论支持。目前,我们已解析了uPAR二聚体的晶体结构,并获得了C4.4A的晶体,以上工作为本项目的顺利完成奠定了基础。
英文摘要
Ly-6/uPAR (LU) domain is also named three-fingered domain based on its topology and is highly conserved in its disulfide bonding pattern. Glycophosphatidylinositol (GPI)-anchored LU domain-containing cell receptors play important roles in cell adhesion and signaling. The structural information of this family is scarce due to the protein complexity from post-translational modifications and the structural flexibility, which poses challenges for structural biology study. It is not fully understood how do the LU-domains connect to each other, how the receptors mediate signaling through their dimerization, and how do the receptors interact with their ligands. This application proposes to determine the structures of a number of GPI-LU ectodomains: C4.4A, LYPD4, TEX101 and CD177, the complex between CD177 and its ligand, and the homodimers of CD59 and uPAR. As the preliminary results, the applicant has determined the structure of uPAR dimer and obtained the crystals of C4.4A, laying out a foundation for the success of this proposal.
Ly-6/uPAR(LU)结构域家族主要由一类二硫键高度保守的三指状蛋白组成。LU 家族成员表达在各种不同的组织中,在不同的生理过程中起作用,例如免疫调节功能、神经受体兴奋性调节以及细胞粘附与迁移调节等。其中含GPI锚的GPI-LU亚家族成员主要在细胞黏连和信号传导方面起作用,与人类疾病紧密相关。由于蛋白后翻译修饰的复杂性以及结构的灵活性,这类蛋白的晶体结构解析工作一直以来比较困难,目前关于这类蛋白的结构研究尚少。作为无胞内结构域的蛋白,它们如何通过二聚体介导胞外信号的传导?它们如何与配体相互作用、这种相互作用是否诱导GPI-LU的构象变化?这些问题都有待结构信息进行解决。在本项目研究中,利用X-射线晶体衍射技术为主要研究手段,结合其他生物化学和生物物理方法。我们重点研究了LU结构域家族中的C4.4A和uPAR等蛋白的原子水平结构及它们与配体的相互作用。我们成功获得了首个含有两个LU结构域的人源C4.4A晶体结构,揭示其有别于三LU结构域蛋白uPAR的二聚化结构模式,并基于其与抗体的结构,结合分子对接推测了C4.4A与配体AGR2相互作用方式。另外,我们成功在体外重构了uPAR二聚体并解析其晶体结构,发现N端的domain swapping对其二聚起到关键的作用。我们对形成domain swapping关键的hinge处氨基酸进行了一系列的突变,并且对突变体在细胞表面的二聚程度、对ATF的结合差异及在膜上的分布进行了研究,进一步验证了我们的三维结构。同时我们还发现uPAR二聚体可以明显促进细胞的增殖。此外,我们还拓展了GPI-LU亚家族蛋白的诊疗和重组表达中的应用。这些为全面了解GPI-LU亚家族蛋白的生物学作用奠定了基础,也将为以这类蛋白为靶点的药物设计提供理论支持,完成了本项目预定研究目标。截止目前为止本课题组依托该项目资助,目前已经发表相关研究性学术论文30篇,并申请了多项发明专利。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
Expression and crystallographic studies of the D1D2 domains of C4.4A, a homologous protein to the urokinase receptor
C4.4A(尿激酶受体同源蛋白)D1D2 结构域的表达和晶体学研究
DOI: 10.1107/s2053230x17009748
发表时间: 2017
期刊: Acta Crystallographica Section F-Structural Biology Communications
影响因子: 0.9
作者: [Chen Shanli, Lin Lin, Yuan Cai, Gardsvoll Henrik, Kriegbaum Mette C., Ploug Michael, Huang Mingdong]
通讯作者: Huang Mingdong
Improved therapeutic efficacy of quercetin-loaded polymeric nanoparticles on triple-negative breast cancer by inhibiting uPA.
通过抑制 uPA 提高槲皮素负载聚合物纳米颗粒对三阴性乳腺癌的治疗效果
DOI: 10.1039/d0ra04231e
发表时间: 2020-09-16
期刊: RSC advances
影响因子: 3.9
作者: []
通讯作者:
A novel ELISA for the detection of active form of plasminogen activator inhibitor-1 based on a highly specific trapping agent
一种基于高度特异性捕获剂的新型 ELISA,用于检测活性形式的纤溶酶原激活剂抑制剂-1
DOI: 10.1016/j.aca.2018.12.005
发表时间: 2019
期刊: Analytica Chimica Acta
影响因子: 6.2
作者: [Shang L, Xue G. P, Gong L. H, Zhang Y. X, Peng S. Z, Yuan C, Huang M. D.]
通讯作者: Huang M. D.
Enhanced anti-microbial effect through cationization of a mono-triazatricyclodecane substituted asymmetric phthalocyanine
通过单三氮杂三环癸烷取代的不对称酞菁的阳离子化增强抗菌效果
DOI: 10.1016/j.jinorgbio.2018.10.001
发表时间: 2018
期刊: Journal of Inorganic Biochemistry
影响因子: 3.9
作者: [Lin H. J, Chen J. C, Zhang Y. X, Ulla A, Liu J. Y, Lin F, Jiang L. G, Huang M. D.]
通讯作者: Huang M. D.
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    纤溶酶原激活物的蛋白分子改造及其在脑梗塞治疗中的应用
    • 批准号:
      32371312
    • 项目类别:
      面上项目
    • 资助金额:
      50万元
    • 批准年份:
      2023
    • 负责人:
      黄明东
    • 依托单位:
    基于结构的新型血清白蛋白改造及其应用
    • 批准号:
      22077016
    • 项目类别:
      面上项目
    • 资助金额:
      63.0万元
    • 批准年份:
      2020
    • 负责人:
      黄明东
    • 依托单位:
    国内基金
    海外基金