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长链非编码RNA HOTAIRM1在结直肠癌中的功能研究
结题报告
批准号:
81201557
项目类别:
青年科学基金项目
资助金额:
23.0 万元
负责人:
张红河
依托单位:
学科分类:
H1802.肿瘤发生
结题年份:
2015
批准年份:
2012
项目状态:
已结题
项目参与者:
李小波、方维佳、汪静宇、王昊、唐锦龙、叶美华
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中文摘要
长链非编码RNA不仅参与了细胞周期、分化、凋亡和衰老,以及细胞间或细胞内核浆运输等细胞学过程,而且还具有表观遗传学调控、转录调节、转录后及翻译调节染色质重塑等重要的分子生物功能。HOTAIRM1是最近新发现的一条长链非编码RNA,本课题组先期实验结果表明HOTAIRM1在结直肠癌中表达明显降低,并且将HOTAIRM1干扰后细胞增殖增加,但其在肿瘤中的生物学机制仍不明确,因此本研究以结直肠癌为疾病模型,以HOTAIRM1为靶点,拟采用表达载体或RNA干扰技术确定其在结直肠癌细胞中的生物学功能;利用MSP和BSP等技术研究HOTAIRM1自身表达是否受甲基化调控及特异性甲基化位点;订制HOX基因簇的低密度芯片,筛选HOXAIRM1下游相关的HOX基因簇成员,采用功能缺失或增补实验进一步明确HOTAIRM1通过HOX基因簇发挥生物学功能;本项目的完成将为结直肠癌的发生发展阐释全新机制。
英文摘要
Long noncoding RNAs (lncRNAs) play intrinsic roles as RNA, which may participate in various biological processes through distinct mechanisms. For example, lncRNAs have been implicated in cell cycle control, cell differentiation and apoptosis, while others are involved in epigenetic silencing, transcriptional and translational control, and splicing regulation. Therefore, there is a powerful suggestive link between lncRNAs and disease. But the role of lncRNA in malignant tumor remains unknown. HOTAIRM1 is a novel lncRNA, which was identified recently.We found its expression in colorectal cancer was significantly down regulated. Furthermore, we want to eluciate the biological function of HOTAIRM1 in colorectal cancer by ectopic expression or knockdown of HOTAIRM1. And whether the HOXAIRM1 expression is regulated by aberrant DNA methylation will be studied by MSP and BSP. Otherwise we also want to describe that HOX cluster is the down stream target of HOTAIRM1. Taken together, completion of the study will clarify a new regulation pathway and carcinogenesis mechnism in colorectal cancer and may highlight promising targets of diagnostic and therapeutic value for colorectal cancer in the future.
长链非编码RNA不仅参与了细胞周期、分化、凋亡和衰老,以及细胞间或细胞内核浆运输等细胞学过程,而且还具有表观遗传学调控、转录调节、转录后及翻译调节染色质重塑等重要的分子生物功能。HOTAIRM1是最近新发现的一条长链非编码RNA,本课题组采用逆转录荧光定量PCR方法检测了109例结直肠癌组织和配对正常结直肠粘膜组织样本中HOTAIRM1的表达,发现HOTAIRM1在结直肠癌中的表达明显低于正常对照组织,而HOTAIRM1的表达与患者年龄、性别、肿瘤大小、部位以及TNM分级等临床病理特征无关。收集150例结直肠癌患者和101例健康对照的血浆标本,将其随机分为训练组和确认组,使用巢氏荧光PCR检测血浆中HOTAIRM1水平。采用logistic回归和ROC曲线分析在训练组中确定诊断结直肠癌的临界值为0.003(CRC≤0.003);在确认组该临界值诊断结直肠癌的灵敏度为64.00%,特异度为76.50%。与目前常用的肿瘤标志物比较,HOTAIRM1诊断结直肠癌的能力与CEA相似,但高于CA125和CA199;将HOTAIRM1与CEA联合使用诊断结直肠癌灵敏度可以提高到84%,而且结直肠癌患者血浆中HOTAIRM1水平与患者年龄、性别、肿瘤大小、部位以及TNM分级等临床病理特征无关,因此血浆中HOTAIRM1水平下降是结直肠癌独立的诊断指标。我们在结直肠癌细胞系中过表达和干扰HOTAIRM1的表达发现HOTAIRM1具有抑制结直肠癌细胞增殖的功能,芯片筛选其下游靶基因结果表明HOTAIRM1通过ECM受体信号相关通路抑制了结直肠癌的发生发展。本项目发现HOTAIRM1可能成为结直肠癌的全新诊断分子标志物而且为阐释结直肠癌发生发展的全新机制奠定了理论基础。
期刊论文列表
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The H6D genetic variation of GDF15 is associated with genesis, progress and prognosis in colorectal cancer
GDF15的H6D遗传变异与结直肠癌的发生、进展和预后相关
DOI:--
发表时间:2015
期刊:Pathol Res Pract
影响因子:--
作者:来茂德
通讯作者:来茂德
The H6D genetic variation of GDFI 5 is associated with genesis, progress and prognosis in colorectal cancer
GDF15的H6D遗传变异与结直肠癌的发生、进展和预后相关。
DOI:10.1016/j.prp.2015.08.004
发表时间:2015-01-01
期刊:PATHOLOGY RESEARCH AND PRACTICE
影响因子:2.8
作者:Wang, Jingyu;Li, Wenfeng;Lai, Maode
通讯作者:Lai, Maode
GDF15 promotes EMT and metastasis in colorectal cancer.
GDF15促进结直肠癌的EMT和转移
DOI:10.18632/oncotarget.6205
发表时间:2016-01-05
期刊:Oncotarget
影响因子:--
作者:Li C;Wang J;Kong J;Tang J;Wu Y;Xu E;Zhang H;Lai M
通讯作者:Lai M
Diagnostic and Prognostic Value of microRNA-21 in Colorectal Cancer: An Original Study and Individual Participant Data Meta-analysis
microRNA-21 在结直肠癌中的诊断和预后价值:一项原始研究和个体参与者数据荟萃分析。
DOI:10.1158/1055-9965.epi-14-0598
发表时间:2014-12-01
期刊:CANCER EPIDEMIOLOGY BIOMARKERS & PREVENTION
影响因子:3.8
作者:Zhang, Honghe;Li, Peiwei;Wu, Yihua
通讯作者:Wu, Yihua
5-Hydroxymethylcytosine and disease.
5-羟甲基胞嘧啶与疾病。
DOI:10.1016/j.mrrev.2014.09.003
发表时间:2014-10
期刊:Mutat Res Rev Mutat Res
影响因子:--
作者:Wang, Jingyu;Tang, Jinlong;Lai, Maode;Zhang, Honghe
通讯作者:Zhang, Honghe
环状RNA-circRHOBTB3在结直肠癌转移中的作用及调控机制研究
  • 批准号:
    --
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    54.7万元
  • 批准年份:
    2021
  • 负责人:
    张红河
  • 依托单位:
结直肠癌肝转移过程中AMER1的作用机制及干预研究
  • 批准号:
    LZ21H160001
  • 项目类别:
    省市级项目
  • 资助金额:
    0.0万元
  • 批准年份:
    2020
  • 负责人:
    张红河
  • 依托单位:
GLTSCR1通过调控转录延伸抑制结直肠癌转移的机制研究
  • 批准号:
    81871937
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    60.0万元
  • 批准年份:
    2018
  • 负责人:
    张红河
  • 依托单位:
长链非编码RNA LINC00152在结直肠癌转移中的作用机制研究
  • 批准号:
    81672730
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    58.0万元
  • 批准年份:
    2016
  • 负责人:
    张红河
  • 依托单位:
国内基金
海外基金