广义散斑壳属真菌分类与系统发育学研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31500019
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    22.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0101.微生物多样性、分类与系统发育
  • 结题年份:
    2018
  • 批准年份:
    2015
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2016-01-01 至2018-12-31

项目摘要

Lophodermium sensu lato is an important group of fungus resources in the world, including Lophodermium Chevall. and Terriera B. Erikss. It was concerned by mycologists and plant conservationists worldwide for most of its members can result in kinds of plant diseases and often cause serious economic losses. Terriera has a controversial taxonomic status since it was divided from Lophodermium, and the classification of two genera species and their following classes were also disordered. In this item, ITS rDNA, mtSSU rDNA, nLSU rDNA gene will be selected to construct multi-gene phylogenetic trees. The rationality of establishment Terriera will be verified. And the phylogenetic relationship between the two genera will be analyzed by related molecular and phenotypic characteristics. Meanwhile, the influence of hosts and geographical distribution to phylogenetic relationships of Lophodermium sensu lato will be analyzed, and phylogenetic trees of these two genus which can reflect the natural evolution will be constructed. In addition, the connection of molecular and phenotypic characteristics that reflect the relationships of intergenara, interspecies, intervarieties and intraspecies will be studied, some complicated problems of traditional taxonomy based on phenotypic characters will be clarified, the taxonomic status of some doubtful species will be cleared, and new species resources will be found. This study will be a good foundation for expounding the natural and reasonable multigene phylogenetics of Rhytismatales.
广义散斑壳属包括散斑壳属和特里尔盘菌属,是世界菌物资源的重要类群,其多数成员能引起各类植物病害,造成严重经济损失,故一直被各国真菌学家和植物保护学家所关注。特里尔盘菌属自散斑壳属中划分出来后,其分类地位始终存在争议,二属种及其以下阶元的分类也较为混乱。本项目拟在经典分类基础上,结合ITS rDNA、mtSSU rDNA和nLSU rDNA基因构建多基因系统进化树,以验证特里尔盘菌属确立的合理性,同时分析寄主、地理分布等因素对该菌系统发育关系的影响,进而阐述反映自然演化的散斑壳属与特里尔盘菌属的系统发育关系;综合有关分子性状和表型类群特征探讨二属内种间、变种间及种内亲缘关系,以澄清基于表型性状的传统分类中存在的问题,明确一些疑难种的分类地位,充分发掘新物种资源。本研究将为阐明自然、合理的斑痣盘菌目多基因系统发育关系打下良好的基础。

结项摘要

广义散斑壳属包括散斑壳属和特里尔盘菌属,是世界菌物资源的重要类群,其多数成员能引起各类植物病害,造成严重经济损失,故一直被各国真菌学家和植物保护学家所关注。特里尔盘菌属自散斑壳属中划分出来后,其分类地位始终存在争议,二属种及其以下阶元的分类也较为混乱。本项目在经典分类基础上,结合ITS rDNA、nLSU rDNA和mtSSU rDNA基因构建多基因系统进化树,以阐明广义散斑壳属的系统发育关系、验证特里尔盘菌属确立的合理性,并解决传统分类中存在的问题。已取得的主要成果如下:对我国8省有代表性的林区,进行广义散斑壳属菌物生态及生物学调查和标本采集,获得标本800余号、纯培养菌株约400号;采用目前较新颖、先进的分类体系,以形态解剖学、个体发育、生态和生物学性状等为综合依据,查明和报道了80余种,其中包括10个新种、中国新纪录属1个及10余个待发表新种。对本属80余种的400余号菌材料进行DNA提取,共测定了1000余条基因序列,构建了广义散斑壳属单基因、多基因系统发育树,从分子角度确定了特里尔盘菌属建属的合理性;特里尔盘菌属和严格意义上的散斑壳属可能均为多系起源属;广义散斑壳属内系统发育关系与其寄主植物具有较大的相关性,针叶树生种和阔叶树生种为两个相近类群;广义散斑壳属内系统发育关系与其地理分布具有一定的相关性。此外,对一些近似种和疑难种进行分子鉴定,对部分种的划分标准和有争议分类群建立的合理性进行了科学论证。此间发表研究论文10篇(其中SCI期刊论文7篇、国家重点期刊论文3篇),培养研究生2名。本研究在真菌学、植物保护学和环境监测与保护方面具重要的理论意义与应用价值,在国际相近研究领域将产生积极的影响。

项目成果

期刊论文数量(10)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
徐亚飞、彭凡、孟艳琼、林英任,卵叶樟上斑痣盘菌目一新种——海南齿裂菌
  • DOI:
    10.13346/j.mycosystema.150066
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    菌物学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    徐亚飞;彭凡;孟艳琼;林英任
  • 通讯作者:
    林英任
海南产齿裂菌属(斑痣盘菌目)一新种。2016,35(5):529-533。
  • DOI:
    10.13346/j.mycosystema.150031
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    菌物学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    吴远;陈玉霞;孟艳琼;林英任
  • 通讯作者:
    林英任
Coccomyces prominens sp. nov. (Rhytismataceae) on Rhododendron coeloneurum in China
突出球菌 sp.
  • DOI:
    10.5248/130.73
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    Mycotaxon
  • 影响因子:
    1
  • 作者:
    Xu Ya Fei Xu;Wu Yuan;Meng Yan Qiong;Wang Shi Juan;Lin Ying Ren
  • 通讯作者:
    Lin Ying Ren
Solella mirabilis sp. nov. on Saccharum arundinaceum from China
奇异索氏菌 sp.
  • DOI:
    10.5248/133.625
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    Mycotaxon
  • 影响因子:
    1
  • 作者:
    Shijuan Wang;Zhao Xing Yan;Tang Yan Ping;Ghulam Ali Bugt;Lin Ying Ren
  • 通讯作者:
    Lin Ying Ren
Terriera fici sp. nov. on Ficus vasculosa from Hainan Province, China
无花果梗
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    Mycotaxon
  • 影响因子:
    1
  • 作者:
    Yuan Wu;Ying-Ren Lin
  • 通讯作者:
    Ying-Ren Lin

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其他文献

皮下盘菌属的两个新分类单元
  • DOI:
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  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    菌物学报23(1): 11~13,2004.2
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    林英任;王士娟;何宇峰;叶光
  • 通讯作者:
    叶光
白皮松落针病病原菌生物学特性研究及ITS序列分析
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  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    安徽农业科学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    杨中周;王士娟;刘芳;郑倩;高小明;陈江琳;林英任
  • 通讯作者:
    林英任
在研期间发表的1新属、27新种、1
  • DOI:
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  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    发表的新分类单元和中国新记录科、属、种名录
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    林英任;侯成林;王士娟;刘和
  • 通讯作者:
    刘和
黄山风景区石栎属植物上斑痣盘菌种类研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    安徽农学通报17(3):39—40,2011. 5
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    王士娟;林英任
  • 通讯作者:
    林英任
基于rDNA-ITS序列的散斑壳属系统发育学初步研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    菌物学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    林英任;王士娟
  • 通讯作者:
    王士娟

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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