用“基因组编辑 ”工具-ZFN研究白血病DNMT3A突变的分子机制

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81200382
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    23.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H0809.白血病
  • 结题年份:
    2015
  • 批准年份:
    2012
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2013-01-01 至2015-12-31

项目摘要

DNMT3A mutation, as an independent risk factor strongly forecast the recurrence, is a fresh somatic cell acquired mutations found in acute myeloid leukemia (AML). The mutation gathers in the normal karyotype/acute myeloid leukemia (CN-AML), and the point mutation of arginine locating in 882 is the most common form. Because the specific molecular mechanism of the worse prognosis of leukemia is still not clear, different areas of large sample of acute myeloid leukemia retrospective studies reported various results in the gene expression profiles, methylation level and model by comparing the positive to the negative in DNMT3A mutation. The fundamental reason may origin from the genetic background and individual difference. From this point, we apply zinc finger nucleic acid enzyme technology to construct a vitro model with DNMT3A882 mutation, which base on a kind of cell line. Later, we intend to select cell clone with the DNMT3A mutations, and analyse the information from profiling chip and whole genome methylation chip. Then, looking for the related downstream controlling gene by in vivo and in vitro experiments, so as to recognize the special target related to DNMT3A mutations in the AML prognosis,and provide the new theoretical foundation to accurate stratification diagnosis and targeted therapy for AML.
DNMT3A突变,是一种在急性髓系白血病(AML)中新发现的体细胞获得性突变,作为强烈提示白血病复发的独立危险因素,主要聚集在中危/正常核型急性髓系白血病(CN-AML)中,而882精氨酸位点点突变是最常见的突变形式。鉴于其使白血病预后更差的具体分子机制尚不明晰,不同区域协作组进行了大样本急性髓系白血病的回顾性研究,结果表明DNMT3A突变阳性组与DNMT3A突变阴性组基因表达谱数据不尽相同,甲基化水平和模式不一,其根本原因可能归结于遗传背景及个体差异。因此,本项目用锌指核酸酶技术人工构建了DNMT3A882突变的细胞模型,拟运用表达谱芯片及全基因组甲基化芯片筛选DNMT3A突变模型中异常表达的基因,通过体内和体外实验寻找DNMT3A突变下游相关调控靶点,从而识别因DNMT3A突变导致AML较差预后的关键靶标,进而为准确进行AML分层诊断、DNMT3A的临床干预及靶向治疗提供新的理论基础。

结项摘要

DNMT3A突变是成人白血病患者中常见突变基因,发生率占据总发病人数的18~23%,其中62%-67.8% 的DNMT3A突变患者属于白血病FAB分型中的M4/M5 型,其中,DNMT3A R882位点是DNMT3A最为常见的突变位点之一。DNMT3A突变目前被认为是成人de novo AML患者的不良预后因素之一,然而,这一突变导致AML预后不良的具体机制尚不明确。本研究力图通过建立DNMT3A突变的细胞模型,研究DNMT3A突变对于AML疾病发生及进展的影响及其具体分子机制。. 本项目通过利用TALEN基因组编辑技术建立了携带有DNMT3A R882突变的细胞系,我们发现携带有突变DNMT3A基因的细胞系具有显著增强的细胞增殖能力。利用微阵列分析发现,DNMT3A突变的细胞系中参与谷胱甘肽合成的相关基因,包括CTH,PSPH,PSAT1以及半胱氨酸/谷氨酸转运体SLC7A11的表达量显著升高,并最终导致细胞内谷胱甘肽的含量上升。后续功能实验证实,携带DNMT3A R882突变的克隆具有显著显著增强的化疗药物耐药性以及更强的细胞存活能力。此外,本项目同时比较了携带DNMT3A R882突变及DNMT3A野生型的AML患者的初诊流式细胞学数据,发现DNMT3A R882突变AML患者相比于DNMT3A野生型AML患者的恶性克隆免疫表型具有显著增高的CD11c/CD14,干细胞标志CD34,髓系细胞表面标志cMPO显著降低;通过公共数据库进行微阵列数据生物信息学分析研究DNMT3A R882突变对AML恶性克隆的表达谱影响,发现DNMT3A R882突变患者表达谱中单核细胞分化基因MAFB显著高于DNMT3A 野生型患者。进一步研究发现,携带DNMT3A R882突变的AML患中,MAFB高表达者相比于低表达者具有更好的临床预后。. 本项目研究成果提示,DNMT3A R882突变在AML的发生中扮演重要角色,其影响恶性克隆细胞内GSH合成路径的新机制可作为未来治疗AML的新方向。此外,DNMT3A R882突变可通过影响恶性克隆的免疫学表型影响患者预后,这为今后进一步对DNMT3A突变的AML患者预后进行分层提供新的依据。

项目成果

期刊论文数量(4)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
IKAROS6is associated with BCR-ABL1and myeloid-associated antigens but indicates poor prognosis independently in Chinese adult B-cell acute lymphoblastic leukemia
IKAROS6 与 BCR-ABL1 和髓系相关抗原相关,但在中国成人 B 细胞急性淋巴细胞白血病中独立指示不良预后
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    Int J Clin Exp Med
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    肖敏
  • 通讯作者:
    肖敏
成年人T细胞急性淋巴细胞白血病中Ikaros6表达及其临床意义
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    白血病·淋巴瘤
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    肖敏
  • 通讯作者:
    肖敏
DNMT3A mutation analysis in adult patients with acute lymphoblastic leukemia
成人急性淋巴细胞白血病DNMT3A突变分析
  • DOI:
    10.1007/s11596-015-1434-1
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    Journal of Huazhong University of Science and Technology-Medical Sciences
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Yang, Li;Ding, Xiao-yi;Zhou, Jian-feng;Xiao, Min
  • 通讯作者:
    Xiao, Min

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  • 发表时间:
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  • DOI:
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  • 发表时间:
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  • 作者:
    肖敏;谢富纪
  • 通讯作者:
    谢富纪

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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