利用外显子捕获测序技术鉴定肥厚型心肌病新致病突变的研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81300074
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    23.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H02.循环系统
  • 结题年份:
    2016
  • 批准年份:
    2013
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2014-01-01 至2016-12-31

项目摘要

Hypertrophic cardiomyopathy is a common inherited heart disease and recognized to be an important cause of arrhythmias, sudden death and heart failure. Due to the limitations of traditional detection methods, so far pathogenic mutations remain unknown in 35% of patients with familial hypertrophic cardiomyopathy and 60% of sporadic patients. We performed targeted capture and high throughput sequencing for a case in a family with hypertrophic cardiomyopathy. No reported mutations were detected, and four novel single point variants were screened. These candidate pathogenic mutations will be validated in all members of the pedigree. If no variant will segerate with disease, further studies are needed to screen pathogenic mutation in this pedigree by performing whole-exome sequencing. After the novel mutation is identified, it will be validated in a large number of cases with family history and sporadic cases as well as the normal population, and genotype-phenotype correlation will be studied. The function of the novel mutation in the pathogenesis of hypertrophic cardiomyopathy will be explored by infecting recombinant adenovirus expression vector into cardiomyocytes and specifically silencing the mutation expression in cardiomyocytes. The purpose of this study is to look for and validate novel pathogenic mutation associated with hypertrophic cardiomyopathy and provide new targets for the prevention and treatment of hypertrophic cardiomyopathy.
肥厚型心肌病是一种常见的遗传性心脏疾病,是心律失常、猝死和心脏衰竭的重要原因。受传统检测方法的限制,目前有35%的肥厚型心肌病家系和60%的散发病例的致病突变尚未发现。我们前期工作对一个肥厚型心肌病大家系中的一例患者进行了目标基因的捕获测序,经分析后排除了已知致病突变的作用,同时筛选出4个可能导致该家系疾病的新突变位点。本课题将在该家系内全体成员中对这4个位点进行验证,如验证后未发现与疾病共分离的新致病突变,则对该家系成员进行全外显子测序以找到致病突变。确定致病突变后,选取大量汉族肥厚型心肌病家系患者、散发病例以及正常人群,验证致病突变在患者和正常人群中的分布,并且探讨该致病突变与患者临床表型的关系。利用携带该突变位点的基因的腺病毒载体转染心肌细胞及RNA干扰技术特异性沉默该基因突变位点的表达,探索该致病突变在肥厚型心肌病发病机制中的作用,为肥厚型心肌病的防治提供新思路。

结项摘要

肥厚型心肌病是一种常见的遗传性心脏疾病,是心律失常、猝死和心脏衰竭的重要原因。受传统检测方法的限制,目前有 35%的肥厚型心肌病家系和 60%的散发病例的致病突变尚未发现。我们前期工作对一个肥厚型心肌病大家系中的一例患者进行了目标基因的捕获测序,经分析后发现MYBPC3 Y842X位点是导致该家系的致病位点。MYBPC3 基因是HCM一个重要的致病基因,能解释35%的HCM患者。为了验证MYBPC3在中国肥厚型心肌病患者的致病情况,我们选取了114个肥厚型心肌病患者进行了验证,进行了包括MYBPC3在内的24个基因进行了目标基因的捕获测序,最后在25个患者中发现8个新突变和12个已知突变。同时也进行了基因型与表型的分析,发现带有两个突变和终止突变的患者与带有错义突变的患者相比显示严重临床表型,也验证了MYBPC3 p.Y842X是中国肥厚型心肌病患者的一个热点突变,呈现严重临床表型。成果于2015年以SCI文章的形式发表于Scientif ic Reports(Sci Rep. 2015 Jun 19;5:11411)上。同时,我们对患者也进行了24个目标基因的捕获测序,开展了中国肥厚型心肌病的致病突变谱研究,对基因型-临床表型的关系进行深入研究。经过上述研究未发现致病突变的家系进行全外显子捕获测序,并进行候选基因与心肌病相关性排序和候选基因功能富集,鉴定肥厚型心肌病候选新致病基因。后续研究利用Cas9技术制备热点突变MYBPC3 Y842X以及新致病基因的Knockin小鼠进行功能学的验证。

项目成果

期刊论文数量(4)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
目标基因捕获测序技术检测1例肥厚型心肌病致病基因突变
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    临床检验杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    郭俊;郑帅;王绿娅;杜杰
  • 通讯作者:
    杜杰
Screening Mutations of MYBPC3 in 114 Unrelated Patients with Hypertrophic Cardiomyopathy by Targeted Capture and Next-generation Sequencing.
通过靶向捕获和下一代测序筛查 114 名无关肥厚型心肌病患者的 MYBPC3 突变。
  • DOI:
    10.1038/srep11411
  • 发表时间:
    2015-06-19
  • 期刊:
    Scientific reports
  • 影响因子:
    4.6
  • 作者:
    Liu X;Jiang T;Piao C;Li X;Guo J;Zheng S;Zhang X;Cai T;Du J
  • 通讯作者:
    Du J
目标基因捕获测序技术鉴定肥厚型心肌病致病突变的研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    心肺血管病杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    朴春梅;李小燕;王绿娅;杜杰
  • 通讯作者:
    杜杰
高通量测序鉴定肥厚型心肌病患儿致病突变
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    新乡医学院学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    张晓萍;刘婷婷;王绿娅;杜杰
  • 通讯作者:
    杜杰

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低温煤焦油分子组成与加氢转化
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  • 作者:
    史权;徐春明;张亚和;刘旭霞;崔德春;郭小汾;龙银花;王锐
  • 通讯作者:
    王锐
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  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    心肺血管病杂志
  • 影响因子:
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  • 作者:
    刘婷婷;王月丽;李平;刘旭霞;王绿娅;杜杰
  • 通讯作者:
    杜杰
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  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    首都医科大学学报
  • 影响因子:
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  • 作者:
    朴春梅;刘旭霞;王绿娅;杜杰
  • 通讯作者:
    杜杰

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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