基因组内源性转录复制相撞模型的构建及其在染色体平衡易位发生中的作用研究
批准号:
81501264
项目类别:
青年科学基金项目
资助金额:
18.0 万元
负责人:
蒋璐频
依托单位:
学科分类:
H0419.胎儿相关性疾病与胎源性疾病
结题年份:
2018
批准年份:
2015
项目状态:
已结题
项目参与者:
姚宏、胡华、沈俊杰、单娟娟、董艳玲、胡斌、柯维萍
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中文摘要
染色体平衡易位是一种常见的染色体异常重组,常引起发育异常、流产、不孕不育等,但目前其发生原因及机制不清。结合文献报道和我们的前期研究发现:平衡易位断裂重组位点多数位于具有转录特性的基因编码区,而转录可通过与复制叉相撞,干扰复制延伸导致基因组不稳定性的产生。据此我们提出假设:转录复制相撞所致基因组不稳定性是介导平衡易位产生的重要原因。为此,我们拟采用CRISPR/Cas9基因打靶系统构建人基因组内源性基因转录复制相撞模型,进而通过体外CRISPR酶切体系,获得打靶基因完整片段,检测其分子量及构象变化得到转录干扰复制的直接证据;最后通过相关重组通路和重组类型的检测,证实转录复制相撞能够导致平衡易位的产生,为深入探讨两者间的关联及机制,以及转录复制相撞在相关疾病发生中的作用奠定基础。
英文摘要
Chromosomal balanced translocation (CBT) is a common chromosomal structural variation, which associated with abnormal development, abortion and infertility, but until now, the causes of CBT are still unknown. Previous studies and our experiment found that most CBT breakpoints locate in genes which get the feature of transcription. Transcription has been reported to induce genome instability through collision with replication by disturb the replicate extension, so we hypothesize the genome instability caused by collision of transcription and replication is a major cause of CBT. To verify the hypothesis, we plan to construct an endogenous TRC model in human cell line by CRISPR/Cas9 system, and use in vitro CRISPR enzyme digest system to get the full gene fragment to obtain the direct evidence of transcription-replication collision, then through detecting the type and passway of recombination to uncover the relationship and mechanism between TRC and CBT, and expect to provide theoretical basis in prevention and treatment of the CBT related diseases.
染色体平衡易位是一种常见的染色体异常重组,目前其发生原因及机制不清。结合文献报道和我们的前期研究发现:平衡易位断裂重组位点多数位于具有转录特性的基因编码区,转录可通过与复制叉相撞,干扰复制延伸导致基因组不稳定性的产生。我们提出假设:转录复制相撞所致基因组不稳定性是介导平衡易位产生的重要原因。本课题组采用CRISPR/Cas9基因打靶系统构建基因组内源性转录复制相撞模型,拟通过体外试验检测染色体重组类型和相关重组通路,证实转录复制相撞能够导致平衡易位的产生,并深入探讨两者间的关联及机制。目前已完成相关质粒构建,及打靶位点验证,并获得目标基因Nanog GFP荧光基因组原位标记的细胞系,通过相关体内外实验证实了基因组内源性基因打靶的可靠性与标记的准确性。目前,我们获得了转录复制相撞模型打靶正确单克隆细胞,为研究基因组内源性转录复制相撞提供了细胞模型与研究基础。进而,我们将优化打靶效率,提高单克隆细胞存活率,进行转录复制相撞验证及分子遗传学检测,最终揭示导致染色体平衡易位发生的分子机制。
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Nanog interaction with the androgen receptor signaling axis induce ovarian cancer stem cell regulation: studies based on the CRISPR/Cas9 system.
Nanog与雄激素受体信号轴的相互作用诱导卵巢癌干细胞调节:基于CRISPR/Cas9系统的研究
DOI:10.1186/s13048-018-0403-2
发表时间:2018-05-02
期刊:Journal of ovarian research
影响因子:4
作者:Ling K;Jiang L;Liang S;Kwong J;Yang L;Li Y;PingYin;Deng Q;Liang Z
通讯作者:Liang Z
Androgen/androgen receptor axis maintains and promotes cancer cell stemness through direct activation of Nanog transcription in hepatocellular carcinoma.
雄激素/雄激素受体轴通过直接激活肝细胞癌中的nanog转录来维持和促进癌细胞干性
DOI:10.18632/oncotarget.9192
发表时间:2016-06-14
期刊:Oncotarget
影响因子:--
作者:Jiang L;Shan J;Shen J;Wang Y;Yan P;Liu L;Zhao W;Xu Y;Zhu W;Su L;Chen J;Cheng F;Yao H;Xu H;Qian C;Liang Z
通讯作者:Liang Z
SOX17 基因3’-UTR 突变上调Wnt4/β-catenin通路在男性性反转发生中的作用及机制研究
- 批准号:81971369
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:53.0万元
- 批准年份:2019
- 负责人:蒋璐频
- 依托单位:
国内基金
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