应用宏基因二代测序技术分析宿主基因多态性及TLR2信号通路交互作用参与肺非结核分枝杆菌病（PNTM）人群易感性及发病机制的研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    81902107
  • 项目类别：
    青年科学基金项目
  • 资助金额：
    21.0万
  • 负责人：
    缪青
  • 依托单位：
    复旦大学
  • 学科分类：
    H2209.病原生物与感染研究新技术与新方法
  • 结题年份：
    2022
  • 批准年份：
    2019
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2020-01-01 至2022-12-31

项目摘要

With increasingly industrialization and sanitation improvement, the prevalence of non-tuberculosis mycobacteria(NTM) is surpassing tuberculosis. Available studies has shown that TLR2 pathway was induced by NTM, thus activating Th1 immune reaction cascade. However, the mechanism is not able to explain the individualized clinical feature. Present study based on metagenomic next generation sequencing，focusing on host susceptibility, exploring host-microbe interaction. It has been found that SNPs of TLR relevant inflammatory pathway in NTM patients were significantly different compared with control.Our research aims to analyze association of SNPs, vitro study and transfection were applied to confirm whether mutation downregulate TLR2 pathway, and increase host susceptibility.
非结核分枝杆菌（Non-tuberculosis mycobacteria，NTM）病的发病率已逐渐超过结核病，临床诊治更为困难，但相关研究相对匮乏。既往基于病原菌的发病机制研究不能很好解释NTM个体化的临床表现和发病特征。我们前期研究发现，NTM患者中宿主Toll样受体2（TLR2）通路相关基因多态性（SNPs）与对照组相比有显著差异，结合既往关于NTM可激活TLR2通路产生Th1型免疫反应的研究，我们推测TLR2通路相关SNPs的机制可直接影响TLR2-IL12/TNFα相关炎症通路的激活水平，最终决定宿主对NTM免疫应答的个体差异。本课题拟利用宏基因测序技术，对疾病样本库中样本SNPs进行精确比较、分析炎症通路表达差异，并构建质粒转染体外细胞模型，通过干预实验，探讨宿主SNPs-炎症通路影响宿主易感性相关机制，为临床个体化治疗提供理论依据。

结项摘要

非结核分枝杆菌（Non-tuberculosis mycobacteria，NTM）病的发病率已逐渐超过结核病，临床诊治更为困难，但相关研究相对匮乏。既往基于病原菌的发病机制研究不能很好解释NTM个体化的临床表现和发病特征。针对此问题，本研究以发病机制就、宿主免疫及微生物互作相关的信号通路为主要研究内容，研究主要结果：利用宏基因测序技术，对疾病样本库中样本SNPs进行精确比较、分析炎症通路表达差异，探讨宿主SNPs-炎症通路影响宿主易感性相关机制，为临床个体化治疗提供理论依据。研究推测：NTM患者中宿主Toll样受体2（TLR2）通路相关基因多态性（SNPs）与对照组相比有显著差异，结合既往关于NTM可激活TLR2通路产生Th1型免疫反应的研究，TLR2通路相关SNPs的机制可直接影响TLR2-IL12/TNFα相关炎症通路的激活水平，最终决定宿主对NTM免疫应答的个体差异。

项目成果

期刊论文数量（3）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（1）
Evaluation of the diagnostic performance using four respiratory specimen types 1 and microbiome characterization by clinical metagenomics.
使用 4 种呼吸道标本 1 型和临床宏基因组学表征的微生物组特征评估诊断性能。
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    Respiratory research
  • 影响因子：
    5.8
  • 作者：
    Qing Miao
  • 通讯作者：
    Qing Miao
宏基因二代测序技术对非结核分枝杆菌感染病原学诊断的价值
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2020
  • 期刊：
    中国临床医学
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    缪青;姚雨濛;潘珏;鲍容;王青青;李娜;陈燕琼;金文婷;张尧;苏逸;马玉燕;黄英男;胡必杰
  • 通讯作者：
    胡必杰
Metagenomic Next-Generation Sequencing Versus Traditional Laboratory Methods for the Diagnosis and Treatment of Infection in Liver Transplantation.
宏基因组新一代测序与传统实验室方法在肝移植感染的诊断和治疗中的比较
  • DOI：
    10.3389/fcimb.2022.886359
  • 发表时间：
    2022
  • 期刊：
    Frontiers in cellular and infection microbiology
  • 影响因子：
    5.7
  • 作者：
  • 通讯作者：

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其他文献

南京北郊一次霾过程中气溶胶理化特征变化研究
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2016
  • 期刊：
    环境科学学报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    李艳伟;秦鑫;缪青;徐彬
  • 通讯作者：
    徐彬
南京北郊夏季大气颗粒物中有机碳和元素碳的污染特征
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2014
  • 期刊：
    环境科学
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    段卿;安俊琳;王红磊;缪青
  • 通讯作者：
    缪青
南京北郊春季气溶胶吸湿性分析
  • DOI：
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  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    环境科学
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    李艳伟;秦鑫;缪青;沈艳
  • 通讯作者：
    沈艳

其他文献

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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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