19F标记非天然氨基酸的合成及结合19F-NMR探索蛋白质泛素化动态调控机制研究

批准号:
21977089
项目类别:
面上项目
资助金额:
66.0 万元
负责人:
石景
依托单位:
学科分类:
生物分子的化学生物学
结题年份:
2023
批准年份:
2019
项目状态:
已结题
项目参与者:
石景
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中文摘要
组蛋白泛素化修饰参与调控DNA损伤修复、基因转录等重要生命过程,阐释泛素化修饰动态调控机制对相关疾病治疗开发具有重要意义。19F NMR能够实时动态分析不同时间尺度的蛋白质动力学信息,是研究蛋白质泛素化修饰动态调控机制的重要手段。本项目拟发展普适的氟代氨基酸合成方法,建立氟代氨基酸库;通过19F NMR开展组蛋白泛素化修饰对核小体的结构机制研究。具体内容为:a. 发展普适的氟代氨基酸合成方法,建立氟代氨基酸库;b. 建立合理的多肽或蛋白模型验证氟标氨基酸性能,掌握氟标氨基酸在多肽化学合成中的效率;c. 运用19F NMR技术探索泛素化修饰调控Dot1甲基转移酶活性机制,展示利用氟标非天然氨基酸通过核磁共振研究蛋白质动力学过程的优势。通过本项目的实施,有望建立一套结合19F标记蛋白质化学合成及核磁共振技术的泛素化修饰动态调控机制研究新策略。
英文摘要
Histone ubiquitination is involved in regulating numerous important life processes such as DNA damage repair, gene transcription, and so on. Interpretation of the dynamic regulation mechanism of ubiquitination is of guiding significance for the treatment of related diseases and drug development. 19F NMR can dynamically analyze the dynamic information of protein in different time scales, and is an important means to study the dynamic regulation mechanism of ubiquitination. In this project, we will develop general method for the synthesis of 19F labeled amino acids, and establish a 19F labeled amino acid library. With the chemical synthesis of 19F labeled protein, we will utilize 19F NMR to study the structural mechanism of histone ubiquitination on nucleosome. The specific content is: a. development of general method for the synthesis of 19F labeled amino acids and establishment of a 19F labeled amino acid library; b. establishment of protein model to verify the performance of 19F labeled amino acids and know well the efficiency of 19F labeled amino acids in the chemical synthesis of peptides; c. exploration of the mechanism of ubiquitination to regulate the activity of Dot1 methyltransferase, and demonstrate the advantages of 19F labeled non-natural amino acids using NMR to study the kinetic process of protein. Through the implementation of this project, it is expected to establish a new strategy for the study of the dynamic regulation mechanism of ubiquitination based on 19F labeled protein chemical synthesis and nuclear magnetic resonance technology.
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
DOI:10.1021/acs.orglett.3c02381
发表时间:2023-08
期刊:Organic letters
影响因子:5.2
作者:Rui Zhao;P. Shi;Xiao Wei;Zhemin Xia;Chaowei Shi;Jing Shi
通讯作者:Rui Zhao;P. Shi;Xiao Wei;Zhemin Xia;Chaowei Shi;Jing Shi
DOI:10.1016/j.tetlet.2023.154339
发表时间:2022
期刊:Tetrahedron Letters
影响因子:--
作者:Yu Wang;Rongtian Wang;Pincheng Li;Rujing Yuan;Yi-Ming Li;Jing Shi
通讯作者:Jing Shi
DOI:10.1002/slct.202300831
发表时间:2023-05
期刊:ChemistrySelect
影响因子:2.1
作者:Chengyu Yao;Deguang Liu;Zheyuan Xu;Haizhu Yu;Jing Shi
通讯作者:Chengyu Yao;Deguang Liu;Zheyuan Xu;Haizhu Yu;Jing Shi
Chemical Synthesis of diSUMO Photoaffinity Probes for the Identification of PolySUMO Chain-Specific Interacting Proteins
用于鉴定 PolySUMO 链特异性相互作用蛋白的 diSUMO 光亲和探针的化学合成
DOI:10.31635/ccschem.020.202000282
发表时间:2021-04
期刊:CCS Chemistry
影响因子:11.2
作者:Wang Yu;Chen Chenchen;Meng Xianbin;Fan Jian;Pan Man;Chen Jingnan;Deng Haiteng;Shi Jing;Liu Lei;Li Yiming
通讯作者:Li Yiming
Total chemical synthesis of tyrosine iodinated histone through four-segment sequential native chemical ligation
通过四段连续天然化学连接全化学合成酪氨酸碘化组蛋白
DOI:10.1016/j.tetlet.2022.154047
发表时间:2022-07
期刊:Tetrahedron Letters
影响因子:1.8
作者:Rong Ji;Jian Fan;Ning Wang;Jun Wang;Jing Shi;Yi-Ming Li
通讯作者:Yi-Ming Li
富二硫键生物活性蛋白工具的OaAEP1酶促化学合成及应用
- 批准号:22377117
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:50万元
- 批准年份:2023
- 负责人:石景
- 依托单位:
二氨基二酸替代二硫键类多肽药物的化学合成及结构-活性关系研究
- 批准号:21572214
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:65.0万元
- 批准年份:2015
- 负责人:石景
- 依托单位:
自由基串联反应机理的理论研究
- 批准号:20902088
- 项目类别:青年科学基金项目
- 资助金额:19.0万元
- 批准年份:2009
- 负责人:石景
- 依托单位:
国内基金
海外基金
