基于单细胞测序技术探讨活动性肺结核CD8+T细胞功能耗竭亚群鉴定及分子调控网络注释
批准号:
82072330
项目类别:
面上项目
资助金额:
55.0 万元
负责人:
王国庆
依托单位:
学科分类:
病原生物与感染研究新技术与新方法
结题年份:
2024
批准年份:
2020
项目状态:
已结题
项目参与者:
王国庆
中文摘要
免疫细胞耗竭是影响结核病转归的重要因素,耗竭状态的CD8+T细胞可导致抑制性受体过表达、细胞因子信号通路失调及代谢适应性的改变。了解活动期肺结核患者CD8+T细胞不同亚群的发育和分类,建立CD8+T细胞功能耗竭与肺结核预后的关系亟待解决。本项目通过对活动期肺结核患者血液CD3+CD8+T细胞进行流式分选及单细胞转录组测序,明确活动期肺结核患者体内T细胞亚群的变化及分类,实现对功能耗竭CD8+T细胞亚群的鉴定;应用项目组前期建立的单细胞转录组Bi-cluster聚类技术及分子调控网络注释,解析CD8+T细胞亚群免疫耗竭的关键中枢节点分子,探讨其对免疫细胞耗竭的作用及机制,并最终建立活动性肺结核精准诊疗及预后评估的诊断标志物系统平台。本项目研究的特点是学科交叉合作与互补,从单细胞组学水平上解析结核感染的相关机制,构建结核感染CD8+T细胞耗竭分子网络模块并进行预后分析,为同类研究提供新思路。
英文摘要
Depletion of immune cells is an important factor affecting the outcome of tuberculosis. Depleted CD8 + T cells can lead to overexpression of inhibitory receptors, dysregulation of cytokine signaling pathways, and changes in metabolic adaptability. It is very urgent to understand the development and classification of different subsets of CD8 + T cells in patients with active tuberculosis, and establish the relationship between CD8 + T cell depletion and the prognosis of tuberculosis. In this project, through flow sorting and single cell transcriptome sequencing of blood CD3 + CD8 + T cells in patients with active tuberculosis, the changes and classification of T cell subsets in patients with active tuberculosis were clarified, and functionally exhausted CD8 + T cells were achieved identification of subgroups. Through the application of the single-cell transcriptome Bi-cluster clustering technology and molecular regulatory network annotations established earlier in the project team, we analyzed the key central node molecules of CD8 + T cell subtype immunodepletion and explored its role and mechanism on immune cell depletion. And finally establish a diagnostic marker cluster system platform for accurate diagnosis and prognosis evaluation of active pulmonary tuberculosis. The characteristics of this project research are cross-disciplinary cooperation and complementarity. Analyzing the related mechanism of tuberculosis infection from the level of single cell omics, constructing the molecular network module of tuberculosis infection CD8 + T cell depletion and prognostic analysis can provide new ideas for similar research.
结核病是由结核分枝杆菌引发的重大全球性传染病,每年仍在全球范围内造成大量的发病与死亡病例,对公共卫生构成严重威胁。在结核病的免疫反应中,CD4+和CD8+ T细胞扮演着关键角色。然而,在慢性感染如结核病中,这些T细胞可能会经历功能耗竭,失去产生细胞因子和杀伤能力,这一现象被称为T细胞耗竭。耗竭的T细胞在持续性感染和肿瘤微环境中常见,它们的功能状态与疾病的进展和免疫治疗的效果密切相关。深入研究结核病与免疫耗竭亚群之间的关系,有助于揭示结核发病的免疫病理机制,为开发新型结核病诊断标志物、治疗策略以及疫苗提供重要的理论依据,对改善全球结核病防控现状具有极为重要的意义。本项目利用计算生物学技术、单细胞转录组测序等多种组学手段,探讨活动性肺结核 CD8+T 细胞功能耗竭亚群鉴定和分子调控网络,确定耗竭亚群和标志物,分析细胞通讯及代谢情况,构建结核分枝杆菌感染巨噬细胞亚细胞器模型,绘制了活动性肺结核外周血 T 细胞单细胞图谱,开发细胞特异性代谢途径重编程方法分析免疫细胞代谢情况,为理解结核分枝杆菌感染的分子机制提供新视角。
中俄不同血清型肾综合征出血热miRNA表达谱分析及预警平台的建立
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批准号:82111530060
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项目类别:国际(地区)合作与交流项目
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资助金额:15万元
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批准年份:2021
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负责人:王国庆
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依托单位:
新时期国家自然科学基金地区联络网管理模式的研究
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批准号:--
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项目类别:--
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资助金额:30万元
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批准年份:2020
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负责人:王国庆
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依托单位:
基于单细胞测序技术探讨活动性肺结核CD8+T细胞功能耗竭亚群鉴定及分子调控网络注释
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批准号:--
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项目类别:--
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资助金额:55万元
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批准年份:2020
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负责人:王国庆
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依托单位:
结核分枝杆菌细胞壁合成相关调节子基因组网络模块定位及基因功能分析
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批准号:81871699
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项目类别:面上项目
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资助金额:57.0万元
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批准年份:2018
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负责人:王国庆
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依托单位:
基于分子动态模拟的血/尿液中胃癌淋巴结转移诊断标志物簇的系统性筛选及验证
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批准号:81472662
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项目类别:面上项目
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资助金额:72.0万元
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批准年份:2014
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负责人:王国庆
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依托单位:
基于基因组动态映射的结核分枝杆菌可药性基因组全景扫描及功能分析
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批准号:81101295
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项目类别:青年科学基金项目
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资助金额:14.0万元
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批准年份:2011
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负责人:王国庆
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依托单位:
国内基金
海外基金