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基于CRISPR文库筛选发现SNRPC基因通过RNA可变剪接调控三阴性乳腺癌发展的分子机制研究

批准号:
82072917
项目类别:
面上项目
资助金额:
55.0 万元
负责人:
胡欣
依托单位:
学科分类:
肿瘤细胞命运
结题年份:
2024
批准年份:
2020
项目状态:
已结题
项目参与者:
胡欣

项目摘要

结项摘要

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中文摘要
三阴性乳腺癌(TNBC)因自身病因的复杂性且缺乏明确治疗靶点,成为当今乳腺癌研究的热点之一。已有的乳腺癌病因学研究大多从基因组或转录组的角度展开,而从RNA可变剪接层面开展的探索研究较为匮乏。本项目基于申请者对RNA可变剪切的工作积累,利用针对RNA结合蛋白的CRISPR文库进行高通量筛选,发现了小核糖核蛋白SNRPC对于三阴性乳腺癌的进展具有重要调控功能。在此基础上,本项目拟采用多种先进的实验技术,系统性地解析SNRPC通过RNA可变剪切调控三阴性乳腺癌进展的分子机制,包括:1)明确SNRPC通过U1剪接体对RNA可变剪接的调控作用;2)阐明SNRPC通过RNA可变剪接影响三阴性乳腺癌生存信号的分子机制;3)探索基因组和表观基因组信号共同调控RNA剪接体染色质定位的分子机制。本课题将揭示RNA可变剪接在调控三阴性乳腺癌进展中的重要性,为发现三阴性乳腺癌的新型靶标奠定理论和实验基础。
英文摘要
Triple-negative breast cancer (TNBC) has become one of the major challenges in breast cancer research, because of its complexity of etiology and lack of treatment targets. Most of the existing studies on tumor etiology are conducted at the genomic or transcriptional levels, while the research on RNA splicing is relatively scarce. In this project, we found that SNRPC was an important RNA splicing regulator and controled the development of triple negative breast cancer, via using high-throughput CRISPR screening targeting RNA binding proteins (RBPs). On this basis, the project plans to systematically analyze the molecular mechanism of SNRPC in regulating the progress of TNBC through RNA alternative splicing, including: 1) Clarifying the regulatory effect of SNRPC on RNA alternative splicing through U1 spliceosome; 2) clarifying the molecular mechanism of SNRPC affecting tumor survival signal; 3) exploring the roles of genomic and epigenetic signaling in regulating the chromatin localization of spliceosomes. This study revealed the importance of RNA alternative splicing in the regulation of TNBC development, and laid an experimental and theoretical foundation to discover the new targets in TNBCs.
三阴性乳腺癌(TNBC)因其病因复杂,是当今乳腺癌研究的热点之一。本研究立足于领先的研究平台与扎实的研究基础,从RNA可变剪接层面探索三阴性乳腺癌的发生和发展机制,构建了针对RNA结合蛋白的CRISPR-Cas9文库和乳腺癌演进模型,发现影响三阴性乳腺癌的发展较为显著、具有关键调控作用的RNA结合蛋白SNRPC。SNRPC作为U1小核酸核糖蛋白复合物的特殊亚基之一,维持着U1复合物的稳定性,并调控大量下游基因可变剪接,集中在蛋白转运、细胞黏附、RNA处理方面。值得注意的是,本研究首次提出SNRPC可以通过TNFAIP2-Rac1–b-catenin调控轴,影响三阴性乳腺癌恶性进展。SNRPC高表达提示患者不良预后,是三阴性乳腺癌独立的预后因子。本研究是第一次在乳腺癌中报道SNRPC的生物学功能,并从分子、细胞、动物模型以及临床乳腺癌组织标本等不同层次,系统深入地来解析 SNRPC基因通过RNA可变剪接调控三阴性乳腺癌生物学特性的分子机制。研究成果将发现与完善了RNA剪接复合体调控癌症发生和发展的分子机制,为从RNA可变剪接层面解析三阴性乳腺癌发展的分子机制及对应新靶标奠定重要的理论和实验基础。
基于多维度免疫压力模型的CRISPR文库筛选发现Galectin2介导三阴性乳腺癌免疫逃逸的机制及靶向策略研究
  • 批准号:
    --
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    52万元
  • 批准年份:
    2022
  • 负责人:
    胡欣
  • 依托单位:
基于突变编码文库技术筛选乳腺癌中PI3K驱动性突变及其功能机制研究
  • 批准号:
    81872137
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    57.0万元
  • 批准年份:
    2018
  • 负责人:
    胡欣
  • 依托单位:
核苷磷酸酶NTPCR通过调控BRCA1-A蛋白复合体介导乳腺癌耐药的机制研究
  • 批准号:
    81672601
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    65.0万元
  • 批准年份:
    2016
  • 负责人:
    胡欣
  • 依托单位:
潜在原癌基因MERIT40/NBA1在乳腺癌发生、发展中的功能和机制研究
  • 批准号:
    81201531
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    24.0万元
  • 批准年份:
    2012
  • 负责人:
    胡欣
  • 依托单位:
国内基金
海外基金