植物铵转运蛋白泛素化调控的单分子研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31670182
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    63.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0207.植物生殖与发育
  • 结题年份:
    2020
  • 批准年份:
    2016
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2017-01-01 至2020-12-31

项目摘要

In plant cells, the ammonium acquisition and transport is mediated by AMMONIUM TRANSPORTERs (AMTs), which play essential roles in the regulation of ammonium ion balance in all organisms. Therefore, the transport activity of AMTs is strictly controlled by ammonium-triggered feedback inhibition to prevent cellular ammonium toxicity. However, the regulation mechanism of AMTs activity in living plant cells remains to be further elucidated. Based on our previous investigations, the project mainly focuses on the mechanisms of how ubiquitination regulates ammonium transporter AMT1;3 by means of dynamic analysis in the living cells together with biochemical and genetic approaches. First, we will analyze the ubiquitin-dependent degradation pathway of ammonium transporter in the presence of ammonium. Then we will elucidate the roles of ubiquitination in the dynamic properties and the endocytosis of ammonium transporter AMT1;3. Finally, we are going to investigate the intracellular trafficking affected by ubiquitin-modification. In the course of the investigation, some new methods and techniques including variable-angle total internal reflection fluorescence microscopy, fluorescence correlation spectroscopy and fluorescence cross-correlation spectroscopy will be used. Taken together, the results of this study will lay foundation for the better understanding of the regulatory mechanisms of ubiquitination involved in the functional characterization of ammonium transporter proteins in plants.
植物细胞膜上铵转运蛋白(AMMONIUM TRANSPORTERS, AMTs)是植物根系吸收和转运铵根离子的重要载体,其对体内铵根离子平衡的调节是细胞能正常进行各种生理活动的基础。因此,为了防止过量摄入铵而产生的铵毒害,铵转运蛋白的活性受到严格的调控,但其调控机制尚不十分明确,仍需进一步深入研究。本项目将在我们前期研究工作的基础上,利用活体动态研究技术并结合生物化学和遗传学分析方法,对拟南芥铵转运蛋白的泛素化修饰调控机制进行研究:(1) 分析铵转运蛋白的泛素化降解途径;(2) 探讨泛素化修饰对铵转运蛋白质膜上运动状态和胞吞方式的影响;(3) 阐释泛素化修饰对铵转运蛋白的胞内转运途径的调控机制。在本项目研究中,拟采用可变角度的全内反射荧光显微术、荧光相关光谱、荧光互相关光谱等新技术,旨在揭示泛素化修饰参与调控铵转运蛋白活性的分子机制,从而为进一步阐明铵转运蛋白活性调控的机理提供新的依据。

结项摘要

氮素是植物合成蛋白质、核酸和一些辅助因子等含氮化合物的必需组分,植物细胞膜上的铵转运蛋白(AMT)是植物根系吸收和转运铵离子的主要负责蛋白,在拟南芥中AMTs家族共有6个成员,其中AMT1;3仅在根部特异性表达,负责根部铵根离子的吸收和转运。因此为了在农业生产中合理利用氮肥以及防止过量摄入铵而产生铵毒害,铵转运蛋白的活性受到严格的调控,但其调控机制以及泛素化修饰是否影响铵转运蛋白AMT1;3的胞吞及囊泡转运机制尚不十分明确。因此,本项目以铵转运蛋白AMT1;3为研究对象,利用活体动态研究技术结合生物化学和分子生物学等实验方法,对拟南芥铵转运蛋白的泛素化修饰调控机制进行研究,得到的主要结果如下:(1) . 在拟南芥植物体内AMT1;3蛋白存在一个本底水平的泛素化修饰;在高铵胁迫下泛素化修饰参与拟南芥中AMT1;3蛋白的降解。(2) 泛素化修饰对AMT1;3蛋白动力学参数的影响:泛素化修饰对AMT1;3在质膜上的运动模式无显著影响;高铵胁迫条件下,突变体植株AMT1;3K75K233-EGFP中AMT1;3蛋白的扩散系数显著降低,长距离扩散所占的比例显著降低,运动速率显著上升,表明在高铵胁迫下泛素化缺失影响AMT1;3在细胞质膜上的运动状态。(3) 泛素化修饰影响AMT1;3蛋白的胞吞:正常铵处理条件下AMT1;3-EGFP以及AMT1;3K75K233-EGFP突变体植株中AMT1;3蛋白的胞吞无明显差异,而在高铵胁迫条件下AMT1;3K75K233-EGFP突变体中AMT1;3蛋白的胞吞受到极显著的抑制,表明泛素化修饰影响高铵胁迫条件下AMT1;3蛋白的胞吞。(4) 泛素化修饰对铵转运蛋白AMT1;3囊泡转运途径调控的研究:在高铵胁迫条件下,突变体植株中AMT1;3蛋白主要聚集在早期内涵体 (early endosome, EE) 中,减少向晚期内涵体 (late endosome, LE) 的转运以及液泡中的降解,表明植物AMT1;3蛋白在高铵胁迫条件下其胞内循环与降解平衡机制受到影响。这些结果为进一步揭示泛素化修饰参与调控铵转运蛋白活性的分子机制,阐明铵转运蛋白活性调控的机理提供新的理论依据。

项目成果

期刊论文数量(19)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
A rapid and effective optical-clearing technique for deep tissue fluorescence imaging in trees
一种快速有效的树木深层组织荧光成像光学清除技术
  • DOI:
    10.1007/s00468-020-01957-0
  • 发表时间:
    2020-02
  • 期刊:
    Trees - Structure and Function
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Lu Liang;Cao Yangyang;He Qizouhong;Xu Wenchao;Zhang Yan;Li Li;Li Ruili
  • 通讯作者:
    Li Ruili
Organization and dynamics of functional plant membrane microdomains
功能性植物膜微区的组织和动力学
  • DOI:
    10.1007/s00018-019-03270-7
  • 发表时间:
    2019-08
  • 期刊:
    Cellular and Molecular Life Sciences
  • 影响因子:
    8
  • 作者:
    Yu Meng;Cui Yaning;Zhang Xi;Li Ruili;Lin Jinxing
  • 通讯作者:
    Lin Jinxing
Dynamics and Endocytosis of Flot1 in Arabidopsis Require CPI1 Function
拟南芥中 Flot1 的动力学和内吞作用需要 CPI1 功能
  • DOI:
    10.3390/ijms21051552
  • 发表时间:
    2020-03-01
  • 期刊:
    INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES
  • 影响因子:
    5.6
  • 作者:
    Cao, Yangyang;He, Qizouhong;Li, Ruili
  • 通讯作者:
    Li, Ruili
PDM3, a pentatricopeptide repeat-containing protein, affects chloroplast development
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  • DOI:
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  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    Journal of Experimental Botany
  • 影响因子:
    6.9
  • 作者:
    Jian Zhang;Jianwei Xiao
  • 通讯作者:
    Jianwei Xiao
RNA表观遗传修饰及其在植物中的研究进展
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
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  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    鲁良;陈博;曹阳阳;邓玮杭;李晔;林金星;李瑞丽
  • 通讯作者:
    李瑞丽

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  • 作者:
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  • 通讯作者:
    李瑞丽
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  • 发表时间:
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  • 通讯作者:
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  • 期刊:
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
    魏长华
植物膜筏微区参与病原菌的防御反应
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    电子显微学报
  • 影响因子:
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  • 作者:
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    李瑞丽
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  • 期刊:
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  • 影响因子:
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  • 作者:
    刘海娇;杜立群;林金星;李瑞丽
  • 通讯作者:
    李瑞丽

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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