Highlights on the capacities of "Gel-based" proteomics.
Highlights on the capacities of "Gel-based" proteomics.
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DOI：
10.1186/1477-5956-8-23
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发表时间：
2010-04-28
期刊：
影响因子：
2
通讯作者：
Chevalier F
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Chevalier F
基于凝胶的蛋白质组学是目前最流行的蛋白质分离和定量方法。这是一种成熟的大规模筛选蛋白质表达的方法，与无凝胶蛋白质组学相比是一种更便宜的方法。基于蛋白质的两个独立的生化特性，双向电泳结合了等电聚焦和SDS-PAGE，等电聚焦根据蛋白质的等电点分离蛋白质，SDS-PAGE根据蛋白质的分子量进一步分离蛋白质。基于凝胶的蛋白质组学流程的下一个典型步骤是斑点可视化和评估，表达分析，最后通过质谱法鉴定蛋白质。对于差异表达蛋白质的研究，二维电泳允许同时检测，定量和比较多达上千个蛋白质点异构体，包括翻译后修饰，在同一凝胶和广泛的生物系统中。在这篇综述文章中，使用具体的例子讨论了基于凝胶的蛋白质组学方法的局限性，好处和前景。
Gel-based proteomic is the most popular and versatile method of global protein separation and quantification. This is a mature approach to screen the protein expression at the large scale, and a cheaper approach as compared with gel-free proteomics. Based on two independent biochemical characteristics of proteins, two-dimensional electrophoresis combines isoelectric focusing, which separates proteins according to their isoelectric point, and SDS-PAGE, which separates them further according to their molecular mass. The next typical steps of the flow of gel-based proteomics are spots visualization and evaluation, expression analysis and finally protein identification by mass spectrometry. For the study of differentially expressed proteins, two-dimensional electrophoresis allows simultaneously to detect, quantify and compare up to thousand protein spots isoforms, including post-translational modifications, in the same gel and in a wide range of biological systems. In this review article, the limits, benefits, and perspectives of gel-based proteomic approaches are discussed using concrete examples.
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影响因子：
3.8
作者：
Chevalier, F;Rofidal, V;Rossignol, M
通讯作者：
Rossignol, M
影响因子：
4.4
作者：
Ball, Malcolm S.;Karuso, Peter
通讯作者：
Karuso, Peter
影响因子：
2.9
作者：
Gorg, A;Obermaier, C;Madjar, JJ
通讯作者：
Madjar, JJ
影响因子：
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作者：
Clark, Brittan N.;Gutstein, Howard B.
通讯作者：
Gutstein, Howard B.
影响因子：
4.4
作者：
Chevalier, F;Centeno, D;Rossignol, M
通讯作者：
Rossignol, M