Detection of 3'-end RNA uridylation with a protein nanopore.
Detection of 3'-end RNA uridylation with a protein nanopore.
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DOI：
10.1021/nn4050479
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发表时间：
2014-02-25
期刊：
影响因子：
17.1
通讯作者：
Bayley H
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Clamer M;Höfler L;Mikhailova E;Viero G;Bayley H
RNA分子3′-末端的转录后修饰对其在细胞中的稳定性和加工有着深远的影响。最近发现，尿苷化，即在3′-末端添加尿苷，是稳定标记分子或指导其降解的重要调节信号。用于检测这种转录后修饰的简单且具有成本效益的方法尚不可用。在这里，我们证明了3′-尿苷化的ssRNA在葡萄球菌α-溶血素（αHL）纳米孔的β桶内的选择性和瞬时结合，并研究了孔识别尿苷的分子基础。我们显示了基于其长度的3′-寡尿苷尾的区分，并提出αHL纳米孔作为这种生物相关RNA修饰的有用传感器。
Post-transcriptional modifications of the 3′-ends of RNA molecules have a profound impact on their stability and processing in the cell. Uridylation, the addition of uridines to 3′-ends, has recently been found to be an important regulatory signal to stabilize the tagged molecules or to direct them towards degradation. Simple and cost-effective methods for the detection of this post-transcriptional modification are not yet available. Here, we demonstrate the selective and transient binding of 3′-uridylated ssRNAs inside the β barrel of the staphylococcal alpha-hemolysin (αHL) nanopore, and investigate the molecular basis of uridine recognition by the pore. We show the discrimination of 3′-oligouridine tails on the basis of their lengths and propose the αHL nanopore as a useful sensor for this biologically relevant RNA modification.
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影响因子：
4.8
作者：
Hammerstein, Anne F.;Jayasinghe, Lakmal;Bayley, Hagan
通讯作者：
Bayley, Hagan
影响因子：
--
作者：
Maglia, Giovanni;Heron, Andrew J.;Stoddart, David;Japrung, Deanpen;Bayley, Hagan
通讯作者：
Bayley, Hagan
DOI：
10.1073/pnas.1119057109
发表时间：
2012-01-17
影响因子：
11.1
作者：
Chen, Huimin;Meisburger, Steve P.;Pollack, Lois
通讯作者：
Pollack, Lois
影响因子：
11.4
作者：
Achsel, T;Brahms, H;Lührmann, R
通讯作者：
Lührmann, R
DOI：
10.1073/pnas.91.26.12828
发表时间：
1994-12-20
影响因子：
11.1
作者：
GOUAUX, JE;BRAHA, O;BAYLEY, H
通讯作者：
BAYLEY, H