Discover of a Novel SNP Highly Associated with Chicken Blue Egg
Discover of a Novel SNP Highly Associated with Chicken Blue Egg
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发现与蓝鸡蛋高度相关的新 SNP
DOI：
10.3923/javaa.2011.92.95
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发表时间：
2011
影响因子：
--
通讯作者：
Deng, X. M.
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Wang, Z. P.;Wang, X. T.;Liu, R. F.;Wang, A. R.;Li, J. Y.;Deng, X. M.
蓝蛋是由位于鸡1号染色体短臂上的一个显性突变Ocyan（O）引起的，但其确切的遗传机制尚不清楚。在这项研究中，我们使用126只褐壳鸡和202只蓝壳鸡发现了一个SNP（g.67419892- 67419904 del 13）与蓝蛋显着相关。蓝壳鸡中g.67419892- 67419904 del 13的等位基因频率和基因型频率（92.5%和87.1%）显著高于褐壳鸡（10.7%和8.7%，p < 0.0001）。利用149个蓝壳雄鱼和褐壳雌鱼交配的F（2）后代，估计O和g.67419892- 67419904 del 13之间的遗传距离超过2cM（LOD = 13.51）。该标记可用于鸡O基因的克隆和鸡品种的标记辅助选择。
Blue egg is caused by a dominant mutation, Oocyan (O) which is previous located on short arm of chicken chromosome 1 but precise genetic mechanism underlying blue egg is still unknown so far. In this study, we found a SNP (g.67419892-67419904del13) significantly associated with blue egg using 126 browned-shelled chickens and 202 blue-shelled chickens. The allelic and genotypic frequencies of g.67419892-67419904del13 are significantly higher in blue-shelled chickens (92.5 and 87.1%) compared with brown-shelled chickens (10.7 and 8.7%, p < 0.0001). Moreover, the genetic distance between O and g.67419892-67419904del13 is estimated to be over 2 cM (LOD = 13.51) using 149 F(2) offspring from mating between blue-shelled males and brown-shelled females. Apparently, the marker is useful for the cloning of O and marker aid selection of blue-shelled chicken breed.
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影响因子：
3.8
作者：
Wu Y;Brosh RM Jr
通讯作者：
Brosh RM Jr
影响因子：
11.8
作者：
Smits, P;Li, P;Lefebvre, V
通讯作者：
Lefebvre, V
影响因子：
4.8
作者：
Liu, XM;Peyton, KJ;Durante, W
通讯作者：
Durante, W
影响因子：
4.8
作者：
Macfarlane, WM;Campbell, SC;Docherty, K
通讯作者：
Docherty, K
DOI：
10.1016/j.biocel.2009.07.016
发表时间：
2010-03
影响因子：
4
作者：
Lefebvre, Veronique
通讯作者：
Lefebvre, Veronique