CCL3L1 copy number, HIV load, and immune reconstitution in sub-Saharan Africans.
CCL3L1 copy number, HIV load, and immune reconstitution in sub-Saharan Africans.
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DOI：
10.1186/1471-2334-13-536
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发表时间：
2013-11-12
影响因子：
3.7
通讯作者：
Hollox EJ
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Aklillu E;Odenthal-Hesse L;Bowdrey J;Habtewold A;Ngaimisi E;Yimer G;Amogne W;Mugusi S;Minzi O;Makonnen E;Janabi M;Mugusi F;Aderaye G;Hardwick R;Fu B;Viskaduraki M;Yang F;Hollox EJ
编码MIP1α的CCL3L1基因的拷贝数变异在宿主易感性和应答中的作用尚存争议。在这里，我们分析了来自坦桑尼亚和埃塞俄比亚的撒哈拉以南非洲队列，这两个国家艾滋病毒-1的高流行率和艾滋病毒与结核病的高共同发病率。我们使用一种称为平行比率检验的定量聚合酶链式反应来检测1134名个体的CCL3L1基因拷贝数，并使用阵列比较基因组杂交和纤维FISH来验证我们的拷贝数分型。我们发现，在开始联合高效抗逆转录病毒治疗之前，抗逆转录病毒初治患者中CCL3L1基因拷贝数与HIV载量没有显著相关性。然而，我们发现低CCL3L1基因拷贝数与开始高效抗逆转录病毒治疗后免疫重建的改善显著相关(p = 0.012)，重复了先前的研究。我们的工作支持CCL3L1拷贝数在艾滋病抗逆转录病毒治疗后的免疫重建中的作用，并提示MIP1α-CCR5轴可能是辅助免疫重建的靶点。
The role of copy number variation of the CCL3L1 gene, encoding MIP1α, in contributing to the host variation in susceptibility and response to HIV infection is controversial. Here we analyse a sub-Saharan African cohort from Tanzania and Ethiopia, two countries with a high prevalence of HIV-1 and a high co-morbidity of HIV with tuberculosis. We use a form of quantitative PCR called the paralogue ratio test to determine CCL3L1 gene copy number in 1134 individuals and validate our copy number typing using array comparative genomic hybridisation and fiber-FISH. We find no significant association of CCL3L1 gene copy number with HIV load in antiretroviral-naïve patients prior to initiation of combination highly active anti-retroviral therapy. However, we find a significant association of low CCL3L1 gene copy number with improved immune reconstitution following initiation of highly active anti-retroviral therapy (p = 0.012), replicating a previous study. Our work supports a role for CCL3L1 copy number in immune reconstitution following antiretroviral therapy in HIV, and suggests that the MIP1α -CCR5 axis might be targeted to aid immune reconstitution.
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DOI：
10.1016/j.meegid.2012.03.021
发表时间：
2012-07
期刊：
Infection, genetics and evolution : journal of molecular epidemiology and evolutionary genetics in infectious diseases
影响因子：
--
作者：
Carpenter D;Färnert A;Rooth I;Armour JA;Shaw MA
通讯作者：
Shaw MA
影响因子：
82.9
作者：
Ahuja, Sunil K.;Kulkarni, Hemant;Dolan, Matthew J.
通讯作者：
Dolan, Matthew J.
影响因子：
15.9
作者：
Menten, P;Struyf, S;Van Damme, J
通讯作者：
Van Damme, J
影响因子：
56.9
作者：
Gonzalez, E;Kulkarni, H;Ahuja, SK
通讯作者：
Ahuja, SK
影响因子：
64.8
作者：
通讯作者：
--