Structure of the Drosophila apoptosome at 6.9 å resolution.
Structure of the Drosophila apoptosome at 6.9 å resolution.
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DOI：
10.1016/j.str.2010.10.009
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发表时间：
2011-01-12
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Akey CW
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Yuan S;Yu X;Topf M;Dorstyn L;Kumar S;Ludtke SJ;Akey CW
果蝇Apaf-1相关的杀伤细胞（Dark）在内在细胞死亡途径中形成一个线粒体。在这项研究中，我们表明，黑暗形成一个单环时，引发剂procaspases绑定。由此产生的Dark-Dronc复合物有效地切割DrICE;因此，一个单环代表果蝇的染色体。然后，我们确定了一个双环的3D结构，分辨率约为6.9 μ m，并创建了一个模型的线粒体。暗复合体中的亚基相互作用与Apaf-1和CED-4中的亚基相互作用相似，但也存在显著差异。特别是，Dark在核苷酸结合口袋中“丢失”了一个环，这为线粒体中可能的dATP交换打开了一条路径。此外，半胱天冬酶募集结构域（CARD）在暗小体的中心枢纽上形成冠状结构。这种CARD几何结构表明，形成活性Dark-Dronc复合物需要构象变化。当结合在一起时，这些数据提供了对染色体结构，功能和进化的新见解。
The Drosophila Apaf-1 related killer (Dark) forms an apoptosome in the intrinsic cell death pathway. In this study, we show that Dark forms a single-ring when initiator procaspases are bound. The resulting Dark-Dronc complex cleaves DrICE efficiently; hence, a single-ring represents the Drosophila apoptosome. We then determined the 3D structure of a double-ring at ~6.9Å resolution and created a model of the apoptosome. Subunit interactions in the Dark complex are similar to those in Apaf-1 and CED-4 apoptosomes, but there are also significant differences. In particular, Dark has “lost” a loop in the nucleotide binding pocket, which opens a path for possible dATP exchange in the apoptosome. In addition, caspase recruitment domains (CARDs) form a crown on the central hub of the Dark apoptosome. This CARD geometry suggests that conformational changes will be required to form active Dark-Dronc complexes. When taken together, these data provide novel insights into apoptosome structure, function and evolution.
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