Programmatic access to bioinformatics tools from EMBL-EBI update: 2017.
Programmatic access to bioinformatics tools from EMBL-EBI update: 2017.
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从EMBL-EBI更新：2017年对生物信息学工具的程序化访问。
DOI：
10.1093/nar/gkx273
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发表时间：
2017-07-03
影响因子：
14.9
通讯作者：
Lopez R
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Chojnacki S;Cowley A;Lee J;Foix A;Lopez R
自2009年以来，EMBL-EBI通过用户浏览器以及通过Web服务API以编程方式提供对几种生物信息学工具的免费和不受限制的访问。对这些工具的程序化访问是生物信息学的基础，随着产生更多的高通量数据，例如从蛋白质组学和元基因组学实验中获得这些工具，这一点变得越来越重要。可以使用SOAP和RESTful方法进行访问，并定期检查它们的使用情况，以确保所有用户都可以使用最好的、受支持的工具。我们在这里提供一个更新，描述对作业分派器API的最新增强以及在其下的治理。
Since 2009 the EMBL-EBI provides free and unrestricted access to several bioinformatics tools via the user's browser as well as programmatically via Web Services APIs. Programmatic access to these tools, which is fundamental to bioinformatics, is increasingly important as more high-throughput data is generated, e.g. from proteomics and metagenomic experiments. Access is available using both the SOAP and RESTful approaches and their usage is reviewed regularly in order to ensure that the best, supported tools are available to all users. We present here an update describing the latest enhancement to the Job Dispatcher APIs as well as the governance under it.
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通讯作者：
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