Development of microsatellites from Fothergilla ×intermedia (Hamamelidaceae) and cross transfer to four other genera within Hamamelidaceae.
Development of microsatellites from Fothergilla ×intermedia (Hamamelidaceae) and cross transfer to four other genera within Hamamelidaceae.
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DOI：
10.3732/apps.1400123
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发表时间：
2015-04
影响因子：
3.6
通讯作者：
Trigiano RN
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Hatmaker EA;Wadl PA;Mantooth K;Scheffler BE;Ownley BH;Trigiano RN
我们开发了Fothergilla ×intermedia的微卫星，以建立能够区分物种和品种的基因座，并评估遗传多样性，供观赏育种者使用，并在金缕梅科内转移。我们对一个富含微卫星的小插入基因组文库进行测序，以开发12个多态性微卫星位点。在金缕梅科的5个属中检测到的等位基因数从4个到15个不等。香农的信息指数在0.07到0.14之间。这些微卫星位点提供了一套标记，以评估自然和栽培资源的遗传多样性，并协助观赏植物育种家的遗传研究的五个流行属的木本观赏植物。
We developed microsatellites from Fothergilla ×intermedia to establish loci capable of distinguishing species and cultivars, and to assess genetic diversity for use by ornamental breeders and to transfer within Hamamelidaceae. We sequenced a small insert genomic library enriched for microsatellites to develop 12 polymorphic microsatellite loci. The number of alleles detected ranged from four to 15 across five genera within Hamamelidaceae. Shannon’s information index ranged from 0.07 to 0.14. These microsatellite loci provide a set of markers to evaluate genetic diversity of natural and cultivated collections and assist ornamental plant breeders for genetic studies of five popular genera of woody ornamental plants.
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DOI：
10.21273/jashs.122.4.529
发表时间：
1997-07-01
影响因子：
1.9
作者：
Marquard, RD;Davis, EP;Stowe, EL
通讯作者：
Stowe, EL
影响因子：
1.9
作者：
Sefidi, Kiomars;Mohadjer, Mohammad R. Marvie;Copenheaver, Carolyn A.
通讯作者：
Copenheaver, Carolyn A.
DOI：
10.1111/j.1471-8286.2006.01655.x
发表时间：
2007-07-01
期刊：
MOLECULAR ECOLOGY NOTES
影响因子：
--
作者：
Wang, X. W.;Trigiano, R. N.;Spiers, J. M.
通讯作者：
Spiers, J. M.
影响因子：
1.9
作者：
Li, JH;Bogle, AL;Klein, AS
通讯作者：
Klein, AS
DOI：
10.1093/bioinformatics/bts460
发表时间：
2012-10-01
期刊：
Bioinformatics (Oxford, England)
影响因子：
--
作者：
Peakall R;Smouse PE
通讯作者：
Smouse PE