A map of transcriptional heterogeneity and regulatory variation in human microglia.
A map of transcriptional heterogeneity and regulatory variation in human microglia.
复制标题
DOI：
10.1038/s41588-021-00875-2
复制
发表时间：
2021-06
期刊：
影响因子：
30.8
通讯作者：
Gaffney DJ
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Young AMH;Kumasaka N;Calvert F;Hammond TR;Knights A;Panousis N;Park JS;Schwartzentruber J;Liu J;Kundu K;Segel M;Murphy NA;McMurran CE;Bulstrode H;Correia J;Budohoski KP;Joannides A;Guilfoyle MR;Trivedi R;Kirollos R;Morris R;Garnett MR;Timofeev I;Jalloh I;Holland K;Mannion R;Mair R;Watts C;Price SJ;Kirkpatrick PJ;Santarius T;Mountjoy E;Ghoussaini M;Soranzo N;Bayraktar OA;Stevens B;Hutchinson PJ;Franklin RJM;Gaffney DJ
小胶质细胞是中枢神经系统的组织驻留巨噬细胞，在免疫防御、发育和体内平衡中发挥着关键作用。然而，从人类中大量分离小胶质细胞具有挑战性。在这里，我们分析了从 141 名接受神经外科手术的患者中分离出的原代人类小胶质细胞的基因表达变异。利用单细胞和批量 RNA 测序，我们利用表达数量性状位点 (eQTL) 作图来确定年龄、性别和临床病理学如何影响小胶质细胞基因表达，以及哪些遗传变异具有小胶质细胞特异性功能。我们使用基于 hIPSC 的巨噬细胞模型来跟踪我们的一项发现，在 BIN1 位点上精细定位阿尔茨海默病的候选因果变异。我们的研究提供了第一个对人类中枢神经系统发育和疾病至关重要的细胞的群体规模转录图谱。
Microglia, the tissue resident macrophages of the CNS, play critical roles in immune defence, development and homeostasis. However, isolating microglia from humans in large numbers is challenging. Here, we profiled gene expression variation in primary human microglia isolated from 141 patients undergoing neurosurgery. Using single cell and bulk RNA sequencing, we identify how age, sex and clinical pathology influence microglia gene expression and which genetic variants have microglia-specific functions using expression quantitative trait loci (eQTL) mapping. We follow up one of our findings using an hIPSC-based macrophage model to fine-map a candidate causal variant for Alzheimer’s disease at the BIN1 locus. Our study provides the first population-scale transcriptional map of a critically important cell for human CNS development and disease.
登录
查看更多内容
DOI：
10.1056/nejmoa1211851
发表时间：
2013-01-10
期刊：
The New England journal of medicine
影响因子：
--
作者：
Guerreiro R;Wojtas A;Bras J;Carrasquillo M;Rogaeva E;Majounie E;Cruchaga C;Sassi C;Kauwe JS;Younkin S;Hazrati L;Collinge J;Pocock J;Lashley T;Williams J;Lambert JC;Amouyel P;Goate A;Rademakers R;Morgan K;Powell J;St George-Hyslop P;Singleton A;Hardy J;Alzheimer Genetic Analysis Group
通讯作者：
Alzheimer Genetic Analysis Group
影响因子：
5.9
作者：
Douvaras P;Sun B;Wang M;Kruglikov I;Lallos G;Zimmer M;Terrenoire C;Zhang B;Gandy S;Schadt E;Freytes DO;Noggle S;Fossati V
通讯作者：
Fossati V
影响因子：
32.4
作者：
Hammond, Timothy R.;Dufort, Connor;Stevens, Beth
通讯作者：
Stevens, Beth
影响因子：
48
作者：
Habib N;Avraham-Davidi I;Basu A;Burks T;Shekhar K;Hofree M;Choudhury SR;Aguet F;Gelfand E;Ardlie K;Weitz DA;Rozenblatt-Rosen O;Zhang F;Regev A
通讯作者：
Regev A
影响因子：
48
作者：
Korsunsky, Ilya;Millard, Nghia;Raychaudhuri, Soumya
通讯作者：
Raychaudhuri, Soumya