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Einzelmoleküluntersuchungen von DNA-Helikasenmotoren an DNA und Chromatin

Einzelmoleküluntersuchungen von DNA-Helikasenmotoren an DNA und Chromatin
DNA 和染色质上 DNA 解旋酶马达的单分子研究
批准号:
13513989
负责人:
Professor Dr. Ralf Seidel
金额:
$0.0万
依托单位国家:
德国
项目类别:
Independent Junior Research Groups
财政年份:
2005
资助国家:
德国
项目状态:
已结题
起止时间:
2004-12-31 至 2010-12-31

项目摘要

项目成果

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中文摘要
翻译
dna -马达蛋白复合体的结构与结构。遗传zellulären基因工程häufig DNA-Helikasen angetrieben。DNAHelikasen是一种多功能酶,deren grundlegende function darin best DNADuplexe zu缠绕在一起Einzelstränge zu zerlegen。核苷三磷酸的水解。机械工程与机械工程。Obwohl Helikasen ein ähnliches struktrumtiv nutzen, um Nukleosidtriphosphate zu hydrolysieren, können ihre funcktionen völlig verschiedenartig sein。dna复制、重组、修复和转录的研究进展。我们ein möglichst detailreiches Abbild der Motorfunktion zu bekommen, ist sehr hilfreich einzelmolek<e:1>在ehtzeit zu beobachten。die gibt Aufschluss <e:1> die dynamischen Eigenschaften von einzelnen酶,die häufig in konventionellen Ensemblemessungen, bei denen <s:1> berine große Population von molek<e:1> len gemittelt wind, verloren gehen。Zur Untersuchung der DNA-Motoren sollen -of- AFM - einzelmolek<s:1> ltecnniken, wie Magnetische Pinzette, AFM, und einzelmolek<e:1> lfluoreszenz angewendet and fr das konkrete Anwendungsgebiet weiter entwickelt werden。Diese Techniken sollen grundlegendes Wissen zu Translokationsraten, generierten Kräften, Prozessivität, Initiierung und Beendigung der Helikaseaktivität, ordination zwischen verschiedenen Motoren, Drehmomentgenerierung, Schrittgrößen and Bewegungsmechanismus entlang des DNA-Templates fr verschiedene Helikasensysteme (SF2 Helikasen, replicative Helikasen) lifefen。模具自适应参数和模具spezifische Funktionalität des enzymes soll Aufschluss <e:1> ber den eigentlichen Mechanismus des Motorenzyms geben。德国德国德国德国德国德国德国德国德国德国德国德国德国Später索伦迪斯实验与染色质研究;齐尔等,周永平,周永平,等。dna -分子动力学研究进展。Damit soll in Werkzeug geschaffen werden, mit dem Vielzahl von existenziellen Prozessen, mit dna转录、修复、复制和核染色体修饰,mit Zusammenwirken mit Chromatin和mit untersucht werden kann。
英文摘要
DNA-Motorproteinkomplexe sind die treibenden Elemente in existenziellen Prozessen des Zellzyklus. Diese zellulären Maschinen werden häufig von DNA-Helikasen angetrieben. DNAHelikasen sind multifunktionelle Enzyme, deren grundlegende Funktion darin besteht DNADuplexe zu entwinden und in ihre Einzelstränge zu zerlegen. Dieser Prozess ist an die Hydrolyse von Nukleosidtriphosphaten gekoppelt. Das Ziel des Projektes ist die Mechanismen von Helikasen zu verstehen. Obwohl Helikasen ein ähnliches Strukturmotiv nutzen, um Nukleosidtriphosphate zu hydrolysieren, können ihre Funktionen völlig verschiedenartig sein. Deshalb werden sich die Untersuchungen darauf fokussieren, wie gemeineinsame Helikasemechanismen adaptiert sind und zu komplexen Funktionsweisen führen, entsprechend ihrer Spezialisierung in DNA-Replikation, Rekombination, Reparatur und Transkription. Um ein möglichst detailreiches Abbild der Motorfunktion zu bekommen, ist sehr hilfreich Einzelmoleküle in Echtzeit zu beobachten. Dies gibt Aufschluss über die dynamischen Eigenschaften von einzelnen Enzymen, die häufig in konventionellen Ensemblemessungen, bei denen über eine große Population von Molekülen gemittelt wird, verloren gehen. Zur Untersuchung der DNA-Motoren sollen ¿State-of-the-aif -Einzelmolekültecnniken, wie Magnetische Pinzette, AFM, und Einzelmolekülfluoreszenz angewendet und für das konkrete Anwendungsgebiet weiter entwickelt werden. Diese Techniken sollen grundlegendes Wissen zu Translokationsraten, generierten Kräften, Prozessivität, Initiierung und Beendigung der Helikaseaktivität, Koordination zwischen verschiedenen Motoren, Drehmomentgenerierung, Schrittgrößen und Bewegungsmechanismus entlang des DNA-Templates für verschiedene Helikasensysteme (SF2 Helikasen, replikative Helikasen) liefern. Die Adaption dieser Parameter an die spezifische Funktionalität des Enzyms soll Aufschluss über den eigentlichen Mechanismus des Motorenzyms geben. Die Untersuchungen der Helikasenmotoren sollen zuerst an nativer DNA durchgeführt werden. Später sollen diese Experimente an Chromatin durchgeführt werden. Ziel ist es, Methoden zu entwickeln, mit denen die Umstrukturierung von Chromatin durch DNA-Motoren beobachtet werden kann. Damit soll ein Werkzeug geschaffen werden, mit dem eine Vielzahl von existenziellen Prozessen, wie DNA-Transkription, Reparatur, Replikation und Nukleosommodifikation, im Zusammenwirken mit Chromatin an Einzelmolekülen untersucht werden kann.
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