The Network Interface between Gene Regulation and Metabolism - Mathematical Description, Dynamics, and Evolutionary Design Principles

在设计项目中，我们对物质代谢进行了分析，并对其进行了动态分析。我们是世界上最大的数学模型，也是最大的动力系统和最大的系统集成。(2)spzifisische Modelle Wohlfinierter zelluläerter Prozesse，(2)Spezifische Model le Wohlfinierter zellulärer Prozesse，(3)verkoppelte Netzwwerke Gender Gender and代谢者Reaktionauf der Skala Ganzer Organisman(E.coli，Hefe，Mensch)；Insbesondere were，Wie sich das Zusamel Spider beiden zelluläerer Prozesse)；(2)数学模型和代谢调节与代谢系统的数学模型；(3)Einen konzeptionellen Anatz für Schnittstellenkrankheiten，以及Ebenen zellulärer组织的系统动力学。

In diesem Projekt werden wir ein Materialflussnetz (Metabolismus) und ein Boolesches Regulationsnetz (Genregulation) zusammenfügen und die dynamischen Prozesse dieser beiden verkoppelten Netzwerke analysieren. Wir werden mathematische Modelle verwenden, um die gemeinsame Dynamik der beiden Systeme zu beschreiben und so zu einer integrierten Sicht auf das System zu gelangen. Das verkoppelte System wird auf drei Skalen diskutiert: (1) abstrakte Boolesche Netze, die mit abstrakten Flussnetzen verkoppelt sind, (2) spezifische Modelle wohldefinierter zellulärer Prozesse (die wir in entsprechende regulatorische und metabolische Unternetzwerke zerlegen, (3) verkoppelte Netzwerke der Genregulation und metabolischer Reaktionen auf der Skala ganzer Organismen (E. coli, Hefe, Mensch).Insbesondere wollen wir verstehen, wie sich das Zusammenspiel der beiden Systeme evolutionär entwickelt hat und wie jedes System das andere auf einer evolutionären Zeitskala geprägt hat.Folgende Resultate streben wir an: (1) ein Formalismus zur Analyse und Beschreibung verkoppelter Fluss- und Regulationsnetzwerke, (2) mathematische Modelle für die Dynamik ausgewählter Subsysteme an der Schnittstelle von Genregulation und Metabolismus und (3) einen konzeptionellen Ansatz für Schnittstellenkrankheiten, als eine dynamische Sichtweise auf das systemweite Fehlschlagen auf beiden Ebenen zellulärer Organisation.