Biochemistry and bioenergetics of anaerobic toluene and p-cresol degradation in Desulfobacula toluolica

甲苯脱硫杆菌是一种专性厌氧菌，主要用于硫酸盐细菌、甲苯脱硫杆菌和甲苯脱硫杆菌。糖尿病的新陈代谢是如此高的水平，而不是像现在这样。在甲苯基丁二酸丁二醇酯和甲基丁二酸丁二醇酯的加成反应中，甲基丁二酸丁二醇酯与甲基丁二酸丁二醇酯的加成反应不同。在硫酸盐中的特征是酶，在硫酸盐中的Das Diese Reaktion in Bakterien katalysiert，Wurden Jedoch noch nch nch untersuht；ebenso gibt es keine informationen zum weiteren abbauweg des Benzylsteinats in Diesen Organisman.对甲苯酚类物质的来源：对甲酚类化合物。Der Organismus gehört zu einer Komplett oxdierenden系统发育组von Sulate reduzierenden三角洲-Proteobakterien和wird zur Zeit Genomenziert。自养脱硫杆菌是一种新型的自养脱硫杆菌，属于自养脱硫杆菌。Das beantragte Forschungsprojekt zielt auf die Identifizierung and die生化学Charakterisierung der Stoffwechselwege and der der酶des anoboben Toluol-und p-Cresol-Abbaus in Dieser Art.这是一种能量有限的生理学和生理学方法。(1)生物信息学分析。工业蛋白von Zellen，从甲苯到甲酚，从对甲酚到对甲酚，从基因组序列到基因序列，从基因到基因的识别，再到对甲酚的识别，再加上对甲苯酚的研究，我们就可以得到更多的产品。Zugleich dienen Dienen基因鉴定的基础是编码酶的生化分析。(2)苯基琥珀酸合酶von D.toluolica，乙二酰基-Radikal-Enzym，SOL生化特性。他说：“这是一件很重要的事情，因为这是一件很重要的事情。这是一件非常重要的事情，因为它是一种新的能源供应方式。Ebenso具有甲苯酚和对甲酚Gibt的分离同工酶。在体外实验中，分别以甘氨酰-钾盐合成酶、甘氨酰-放射钾合酶形式和Kristallisierung Des Enzyms Sein形式进行了研究。(3)Der weitere Abbauweg des Benzylsteinats zu苯甲酰-CoA，bzw.des 4-羟基-苯甲酰-CoA，唯一未见文献报道。在连接酶和生物化学特性之间的酶的作用下，生物化学和生物化学的特征。在我们的国家里，我们不是在做什么，而是为了让他们更好地工作。

Das obligate anaerobe Bakterium Desulfobacula toluolica war das erste sulfatreduzierende Bakterium, bei dem der Abbau von Toluol nachgewiesen wurde. Diese metabolische Fähigkeit ist auch heute noch nicht bei vielen Sulfatreduzierern bekannt. Der Toluolabbau wird dabei durch Fumarataddition an die Methylgruppe eingeleitet und verläuft über Benzylsuccinat als erstes Intermediat. Die genaueren Eigenschaften des Enzyms, das diese Reaktion in sulfatreduzierenden Bakterien katalysiert, wurden jedoch noch nicht untersucht; ebenso gibt es keine Informationen zum weiteren Abbauweg des Benzylsuccinats in diesen Organismen. Neben Toluol baut D. toluolica auch p-Cresol ab, vermutlich über einen analogen Stoffwechselweg. Der Organismus gehört zu einer komplett oxidierenden phylogenetischen Gruppe von sulfatreduzierenden Delta-Proteobakterien und wird zur Zeit Genom-sequenziert. Es wird das erste verfügbare Genom eines Kohlenwasserstoff-oxidierenden sulfatreduzierenden Bakteriums werden und nach Desulfobacterium autotrophicum das zweite einer komplett oxidierenden Art. Das beantragte Forschungsprojekt zielt auf die Identifizierung und die biochemische Charakterisierung der Stoffwechselwege und der Enzyme des anaeroben Toluol- und p-Cresol-Abbaus in dieser Art. Ein weiteres spezifisches Ziel ist die Untersuchung 3 der Bioenergetik der beteiligten Reaktionen, um herauszufinden, wie der Abbau von Toluol mit der Energie-limitierten Physiologie eines Sulfatreduzierers in Einklang zu bringen ist. Die Ziele sind dabei im einzelnen: (1) Bioinformatische Analyse. Induzierte Proteine von Zellen, die auf Toluol bzw. p-Cresol angezogen wurden, werden mit der Genomsequenz korreliert, um die jeweils beteiligten Gene zu identifizieren und die die Stoffwechselwege zu rekonstruieren. Zugleich dienen die identifizierten Gene als Basis für die biochemische Analyse der codierten Enzyme. (2) Die Benzylsuccinatsynthase von D. toluolica, ein Glycyl-Radikal-Enzym, soll biochemisch charakterisiert werden. Hauptsächlich werden dabei Aspekte untersucht, die das Enzym aus Sulfatreduzierern von den orthologen Enzymen aus Denitrifizierern unterscheiden sollten. Die interessanteste Frage stellung ist dabei, ob die freiwerdende Energie der Additionsreaktionen über einen Energiekonservierungs-Mechanismus nutzbar gemacht wird. Ebenso wird untersucht, ob es ein gemeinsames oder separate Isoenzyme für Toluol und p-Cresol gibt. Weitere wichtige Aspekte der Untersuchung der Benzylsuccinatsynthase werden die in-vitro-Aktivierung zur aktiven, Glycyl-Radikalhaltigen Form und Versuche zur Kristallisierung des Enzyms sein. (3) Der weitere Abbauweg des Benzylsuccinats zu Benzoyl-CoA, bzw. des 4-Hydroxy- Benzylsuccinats zu 4-Hydroxy-Benzoyl-CoA, soll untersucht werden. Dies erfordert zunächst die Aufklärung der bisher unbekannten Stoffwechselwege und der beteiligten Enzyme, anschließend dann die biochemische Charakterisierung der wichtigsten Enzyme. Auch in diesem Teilprojekt werden wir uns auf die Reaktionen konzentrieren, die aufgrund ihrer Energetik bei Sulfatreduzierern nur schwer ablaufen können.