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Treatment of the biomolecular docking process using Fuzzy Set theory

Treatment of the biomolecular docking process using Fuzzy Set theory
使用模糊集理论处理生物分子对接过程
批准号:
5237720
负责人:
Professor Dr. Jürgen Brickmann
金额:
$0.0万
依托单位国家:
德国
项目类别:
Research Grants
财政年份:
2000
资助国家:
德国
项目状态:
已结题
起止时间:
1999-12-31 至 2003-12-31

项目摘要

项目成果

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中文摘要
翻译
参考文献:1 .在生物化学构象鉴定中,生物化学构象鉴定和晶体结构鉴定中,生物化学构象鉴定和晶体结构鉴定中,生物化学构象鉴定和晶体结构鉴定中,生物化学构象鉴定和晶体结构鉴定(sogenanntes对接问题). ...本文主要研究了模糊逻辑策略研究与发展的关系,并对Komplementarität分子生物学Oberflächen gewährleisten进行了分析。In anderen Anwendungsgebieten konnte gezeiget werden, dasass - fuzzy-logic- algorithm besser In der Lage, Expertenwissen In einenmathematischen Algorithmus umzusetzen,也klassische Verfahren. ...Als Kriterien毛皮一张Zielfunktion sollen死topographischen Eigenschaften, das elektrostatische潜力,Hydrophilie / Lipophilie和港口死拉赫·冯·Wasserstoffbrucken-Donatoren和-Akzeptoren herangezogen了,死Als Skalarfeld auf一张berechnete Molekuloberflache projiziert wurden奥得河Als dreidimensionale Daten auf einem git苏珥Verfugung模特大赛。中文:中文:中文:中文:中文:中文:中文:特征分析。Die Zugehörigkeitswerte zu diesen linguistischen Variablen können dann als ingabeparameter f<e:1> r Die zu entwickelnden算法dienen, Die and bekannten protein - ligan - komplexen optimiert werden sollen。在Anschluß和die Optimierung中,die strucktur der complex和der ungebundenen Komponenten dieser complex rekonstruciert werden。每一个分子都是这样的:每一个分子都是这样的:每一个分子都是这样的。
英文摘要
Im Rahmen der vorliegenden Arbeit soll ein neues Verfahren entwickelt werden, das zur Identifizierung der Konfiguration biochemischer Komplexe anhand der Kristallstruktur der ungebundenen Komplexpartner dienen soll (sogenanntes docking-Problem). ... Es sollen mit Hilfe von fuzzy-logic-Strategien Kriterien entwickelt werden, die eine Bewertung der Komplementarität von molekularen Oberflächen gewährleisten. In anderen Anwendungsgebieten konnte gezeigt werden, daß fuzzy-logic-Algorithmen besser in der Lage sind, Expertenwissen in einen mathematischen Algorithmus umzusetzen, als klassische Verfahren. ... Als Kriterien für eine Zielfunktion sollen die topographischen Eigenschaften, das elektrostatische Potential, die Hydrophilie/Lipophilie sowie die Lage von Wasserstoffbrücken-Donatoren und -Akzeptoren herangezogen werden, die als Skalarfeld auf eine berechnete Moleküloberfläche projiziert wurden oder als dreidimensionale Daten auf einem Gitter zur Verfügung stehen. Diese Kriterien sollen geeignet fuzzifiziert werden, d.h. den berechneten Eigenschaften sollen linguistische Variablen zugeordnet werden. Die Zugehörigkeitswerte zu diesen linguistischen Variablen können dann als Eingabeparameter für die zu entwickelnden Algorithmen dienen, die an bekannten Protein-Ligand-Komplexen optimiert werden sollen. Im Anschluß an die Optimierung soll die Struktur der Komplexe anhand der ungebundenen Komponenten dieser Komplexe rekonstruiert werden. Nach dieser Verifizierung sollen die Algorithmen zu einem Programmpaket zusammengefaßt werden, mit dem eine weitgehend vollautomatische Suche nach molekularer Komplementarität möglich sein sollte.
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会议论文
Theoretische und experimentelle Untersuchungen zur biomimetischen Morphogenese von Apatit-Gelatine-Nanokompositen
  • 批准号:
    26845258
  • 项目类别:
    Research Grants
  • 资助金额:
    $0.0万
  • 财政年份:
    2006
  • 负责人:
    Professor Dr. Jürgen Brickmann
  • 依托单位:
Modellierung und Simulation der Morphogenese von Apatiten in Gegenwart von Biomolekülen
  • 批准号:
    5406781
  • 项目类别:
    Priority Programmes
  • 资助金额:
    $0.0万
  • 财政年份:
    2003
  • 负责人:
    Professor Dr. Jürgen Brickmann
  • 依托单位:
Mikroskopische und makroskopische Modelle wäßriger Lösungen zur Lokalisation hydrophober Effekte
  • 批准号:
    5075178
  • 项目类别:
    Research Grants
  • 资助金额:
    $0.0万
  • 财政年份:
    1997
  • 负责人:
    Professor Dr. Jürgen Brickmann
  • 依托单位:
Computersimulation zur Untersuchung des Lösungsverhaltens von Cellulose unter der Beteiligung aliphatischer N-Oxide
  • 批准号:
    5276800
  • 项目类别:
    Priority Programmes
  • 资助金额:
    $0.0万
  • 财政年份:
    1996
  • 负责人:
    Professor Dr. Jürgen Brickmann
  • 依托单位:
海外基金