Ab initio-, Tight-Binding- und QM³-Rechnungen eines realistischen Rhodopsinmodells

11顺式视紫红质，DEM蛋白，das in der Netzhaut der Augen von Wirbeltieren für das HellDunkel-sehen verantwortlich.Ausselöst wird der Sehproze？光化学？顺式/反式异构体一直存在于C11-C12的视网膜，Eine Reaktion，die au？erordentlich Schnell and MIT Hoher Quantosbeute and Selektivität erfolgt.在蛋白质的结合中，生色体和发色体之间的关系不变，肌萎缩侧索硬化症患者也不例外。AUF Well Che Weise der Chromopor MIT DEM Protein Wechselwirkt，IST Witgehend Unbekkannt(变色体和变色体DEM蛋白质)，我们的过敏反应不会发生。他说：“这是一件很重要的事情，因为这是一件很重要的事情。Gegenstand des Projektes ist deshalb die Berechnung eines realistischen Rhotopinmodelells MIT Hilfe von MolekülDynamischen Simulationen auf ab Initio-und tig-Bindung-niveau and Durch Kombination von QuantChemie und Molekülmachik(Quantum Embedding oder QM³)。Ausgehend von der kürzlich bekannt gewordenen kristallstruktur des视紫红质Soll De Efluüder der Proteinumgebung auf die Chromophorkon form untersusuht and ein modell für die Steuerung der Sehkaskade dech die im Chromphor gebundene Phoonische Energie entwickelt den.

11-cis-Retinal ist der Chromophor von Rhodopsin, dem Protein, das in der Netzhaut der Augen von Wirbeltieren für das HellDunkel-Sehen verantwortlich ist. Ausgelöst wird der Sehprozeß photochemisch durch die cis/trans-Isomerisierung der C11-C12Doppelbindung des Retinals, eine Reaktion, die außerordentlich schnell und mit hoher Quantenausbeute und Selektivität erfolgt. Diese besondere Reaktivität zeigt der Chromophor nur im gebundenen Zustand, als Folge seiner Einpassung in die Bindungstasche des Proteins. Auf welche Weise der Chromophor mit dem Protein wechselwirkt, ist allerdings weitgehend unbekannt. Von einer Struktur mit atomarer Auflösung, aus der die geometrischen Konsequenzen der Proteinbindung für den Chromophor zu erkennen wären, ist man noch Jahrzehnte entfernt. Gegenstand des Projektes ist deshalb die Berechnung eines realistischen Rhodopsinmodells mit Hilfe von moleküldynamischen Simulationen auf ab initio- und Tight-Bindung-Niveau und durch Kombination von Quantenchemie und Molekülmechanik (Quantum Embedding oder QM³). Ausgehend von der kürzlich bekannt gewordenen Kristallstruktur des Rhodopsins soll so der Einfluß der Proteinumgebung auf die Chromophorkonformation untersucht und ein Modell für die Steuerung der Sehkaskade durch die im Chromophor gebundene photonische Energie entwickelt werden.