Developing the computing procedures and systems for genetic evaluation of resource animals using the chromosome segment model
Developing the computing procedures and systems for genetic evaluation of resource animals using the chromosome segment model
批准号:
20580303
负责人:
IWAISAKI Hiroaki
金额:
$3.0万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份:
2008
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2008 至 2010
中文摘要
本文研究了一种利用染色体片段模型进行资源动物遗传评价的计算程序和系统。使用大量SNP数据的遗传评估也考虑了几种方法。利用异种家畜小鼠和牛的模拟数据和实际数据,对这些计算方法的有效性进行了检验。理论和仿真研究表明,利用染色体片段模型对资源动物进行遗传评价是可行的。与使用多基因模型的混合模型方法相比,拟合SNP效应的贝叶斯方法在估计总遗传价值方面显得相对准确和有希望。
英文摘要
In this study, a computing procedure and system for genetic evaluation of resource animals using the chromosome segment model was considered. Those for the genetic evaluation using a large amount of SNP data were also investigated considering several approaches. Using simulated and actual data of hetero-stock mice and cattle, validities of those computing procedures were examined. Based on the theory and simulation study, the genetic evaluation of resource animals using the chromosome segment model was shown to be useful. Bayesian methods fitting SNP effects appeared to be relatively accurate and promising, in terms of estimation of total genetic merit, compared with the mixed model method using the polygene model.
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50K SNPデータを利用した黒毛和種枝肉重量の分散の推定
使用 50K SNP 数据估计日本黑色品种胴体重量的方差
DOI:
--
发表时间:
2010
期刊:
影响因子:
--
作者:
[渡邊敏夫, 荒川愛作, 西村翔太, 山田宜永, 杉本喜憲, 祝前博明]
通讯作者:
祝前博明
Genomic selection some relevant topics Japanese Journal of Animal Breeding Research Vol.18 2010 17-49 無
基因组选择一些相关主题 Japanese Journal of Animal Breeding Research Vol.18 2010 17-49 无
DOI:
--
发表时间:
2010
期刊:
Japanese Journal of Animal Breeding Research Vol.18
影响因子:
--
作者:
[H.Iwaisaki, A.Arakawa, H.Matsuda]
通讯作者:
H.Matsuda
Estimation of variance components for carcass traits in Japanese Black cattle using 50K SNP genotype data.
使用 50K SNP 基因型数据估计日本黑牛胴体性状的方差分量。
DOI:
--
发表时间:
2014
期刊:
Animal science journal = Nihon chikusan Gakkaiho
影响因子:
--
作者:
[Toshio Watanabe, H. Matsuda, A. Arakawa, Takahisa Yamada, H. Iwaisaki, S. Nishimura, Y. Sugimoto]
通讯作者:
Y. Sugimoto
Genomic selection : some relevant topics
基因组选择:一些相关主题
DOI:
--
发表时间:
2011
期刊:
Japanese Journal of Animal Breeding Research
影响因子:
--
作者:
[H.Iwaisaki, et al.]
通讯作者:
et al.
ゲノミック選抜における選択的タイピングの有効性の検討
检查选择性分型在基因组选择中的有效性
DOI:
--
发表时间:
2010
期刊:
影响因子:
--
作者:
[板東大三郎, 荒川愛作, 谷口幸雄, 山田宜永, 祝前博明]
通讯作者:
祝前博明
共 7 条
Challenging studies on the whole genome evaluation of feed utilization efficiency
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批准号:26660208
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项目类别:Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
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资助金额:$2.58万
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财政年份:2014
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负责人:IWAISAKI Hiroaki
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依托单位:
Analyzing the genetic population structure using DNA marker and pedigree information in the artificially-reared population of an endangered animal species
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批准号:24658235
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项目类别:Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
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资助金额:$2.58万
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财政年份:2012
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负责人:IWAISAKI Hiroaki
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依托单位:
海外基金