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Development of a pyrosequence-based technique for HIV drug-resistance diagnosis

Development of a pyrosequence-based technique for HIV drug-resistance diagnosis
开发基于焦磷酸序列的 HIV 耐药性诊断技术
批准号:
21360408
负责人:
TAKEYAMA Haruko
金额:
$11.23万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份:
2009
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2009 至 2011

项目摘要

项目成果

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中文摘要
翻译
本研究的目的是开发一种基于焦磷酸测序的单细胞分析技术,以准确识别HIV内的多种突变,并对HIV准种形成的相关机制进行基于序列的阐明。结果,我们成功地建立了一个低至10个拷贝的cDNA分子测量系统。此外,我们还成功地追踪了HIV准种相关的原病毒DNA、Gag和PR亚型之间的共同进化。
英文摘要
The aim of this research is to develop a single-cell analytical technique based on pyrosequencing to accurately identify diverse mutations within HIV and to conduct sequence-based elucidation of the mechanisms related to HIV quasispecies formation. As a result, we were successful in the establishment of a system for measuring cDNA molecules to as low as 10 copies. Furthermore, we were also successful in tracing the coevolution between the subtypes of HIV quasispecies-related proviral DNA, Gag and PR.
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会议论文
DOI: 10.1002/bit.22240
发表时间: 2009-05
期刊: Biotechnology and Bioengineering
影响因子: 3.8
作者: [T. Yoshino;T. Nishimura;Tetsushi Mori;Shigeya Suzuki;H. Kambara;H. Takeyama;T. Matsunaga]
通讯作者: T. Yoshino;T. Nishimura;Tetsushi Mori;Shigeya Suzuki;H. Kambara;H. Takeyama;T. Matsunaga
マイクロ流体デバイスのバイオ計測への応用「ナノ融合による先進バイオデバイス」
微流控装置在生物测量中的应用“利用纳米融合的先进生物装置”
DOI: --
发表时间: 2011
期刊:
影响因子: --
作者: [竹山春子, モリテツシ, 庄子習一]
通讯作者: 庄子習一
一細胞からのmRNAをデジタル計測するための要素技術開発:「シングルセル解析の最前線」)(松永是・神原秀記・植田充美監修)
开发数字化测量单细胞 mRNA 的基本技术:“单细胞分析的最前沿”(松永是、神原英树、上田光美监督)
DOI: --
发表时间: 2010
期刊:
影响因子: --
作者: [竹山春子, 岡村好子, 吉野知子, 神原秀記]
通讯作者: 神原秀記
一細胞からのmRNAをデジタル計測するための要素技術開発:「シングルセル解析の最前線」
开发数字化测量单细胞 mRNA 的基本技术:“单细胞分析的前沿”
DOI: --
发表时间: 2010
期刊:
影响因子: --
作者: [竹山春子, 岡村好子, 吉野知子, 神原秀記]
通讯作者: 神原秀記
共 16 条
    Development of technique for digital counting of DNA copy number at the single-cell level
    • 批准号:
      24360344
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额:
      $12.15万
    • 财政年份:
      2012
    • 负责人:
      TAKEYAMA Haruko
    • 依托单位:
    Nano-screening of marine symbiotic consortium for useful bio-materials and their analyses
    Application of buoyant marine cyanobacteriaon to eco-monitoring
    Screening of enviromental stress response elements and their application
    国内基金
    海外基金
    人类免疫缺陷病毒(HIV)总核酸检测试剂盒
    HIV相关肺癌免疫微环境中关键免疫细胞亚群的功能特征与调控机制研究
    基于深度测序与SNV 芯片的HIV重复感染与毒株重组机制研究
    • 批准号:
      2026JJ81281
    • 项目类别:
      省市级项目
    • 资助金额:
      --
    • 批准年份:
      2026
    • 负责人:
      徐艳
    • 依托单位:
    PGT123中和抗体修饰的工程化载肽囊泡疫苗通过诱导CD4+ T细胞极化在抗HIV感染中的应用和机制研究