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Functional genome analysis of the uncultivated baterial symbiont of the deep-sea tube worm Riftia pachyptila

Functional genome analysis of the uncultivated baterial symbiont of the deep-sea tube worm Riftia pachyptila
深海管虫 Riftia pachyptila 未培养的细菌共生体的功能基因组分析
批准号:
5402344
负责人:
Professor Dr. Thomas Schweder
金额:
$0.0万
依托单位:
依托单位国家:
德国
项目类别:
Research Grants
财政年份:
2003
资助国家:
德国
项目状态:
已结题
起止时间:
2002-12-31 至 2011-12-31

项目摘要

项目成果

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中文摘要
翻译
Der Röhrenwurm Riftia pachyptila ist ein Hauptbesiedler der Hauptbesiedler desöstlichen Pazifik and beherbergt eine dihte ophte dihte种群von endosymbiontischen Sulfidoxdierenenden Bakterien in seiner Körperhöhle.化学自养共生是一种新的自养方式,适用于自然界。我们的贷款人Kultivierungsmöglichkeiten is eine Charakterisierung der monospezifischen symbionten Sowie der Wirt-Bakterien-Interaktionen bislang Nur be chränkt möglich.Pachyptila ermöglicht Neue ansätze in der Erforschung der Physiologischen Potenziale der Bakterien und liefert die Grundlage für das Groudlage für das Grandlte Projekt.麻省理工学院的现代方法和功能基因分析将在更明确的定义下表达和共生。Dazu Sollen das细胞质和das Extrazelluläre Proteom des bakteriellen symbionten analysiert。这是一种新型的二维蛋白质识别技术,它是一种新型的蛋白质识别技术。在DNA阵列分析过程中,我们发现了一种新的基因。他说:“我的工作就是把他们的工作做好。”
英文摘要
Der Röhrenwurm Riftia pachyptila ist ein Hauptbesiedler der Hydrothermalquellen des östlichen Pazifik und beherbergt eine dichte Population von endosymbiontischen sulfidoxidierenden Bakterien in seiner Körperhöhle. Die chemoautotrophen Symbionten spielen eine zentrale Rolle bei der Ernährung ihres Wirtstieres, welches selbst kein Verdauungssystem besitzt. Wegen fehlender Kultivierungsmöglichkeiten ist eine Charakterisierung der monospezifischen Symbionten sowie der Wirt-Bakterien-Interaktionen bislang nur beschränkt möglich. Die vollständige Genomsequenzierung der Symbionten von R. pachyptila ermöglicht neue Ansätze in der Erforschung der physiologischen Potenziale der Bakterien und liefert die Grundlage für das geplante Projekt. Mit Hilfe von modernen Methoden der funktionellen Genomanalyse wird angestrebt, die Genexpression der Symbionten unter definierten Umweltbedingungen zu analysieren. Dazu sollen das cytoplasmatische und das extrazelluläre Proteom des bakteriellen Symbionten analysiert werden. Die hohe Auflösung 2-dimensionaler Proteinelektrophoresegele und die nachfolgende Proteinidentifizierung mit Hilfe von MALDI-TOF-Massenspektrometrie ermöglichen die globale Charakterisierung differentiell exprimierter Gene. Weiterhin soll die mRNA-Abundanz umweltregulierter Gene durch den Einsatz von DNA-Arrays analysiert werden. Aus den Ergebnissen dieser Forschung wird ein besseres Verständnis der molekularen Grundlagen der Entstehung und der Wirt-Bakterien-Wechselwirkungen der R. pachyptila-Symbiose erhofft.
期刊论文(3)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
DOI: 10.1073/pnas.1121198109
发表时间: 2012-05-08
期刊: PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA
影响因子: 11.1
作者: [Kleiner, Manuel, Wentrup, Cecilia, Dubilier, Nicole]
通讯作者: Dubilier, Nicole
DOI: 10.1038/ismej.2011.137
发表时间: 2012-04-01
期刊: ISME JOURNAL
影响因子: 11
作者: [Gardebrecht, Antje, Markert, Stephanie, Schweder, Thomas]
通讯作者: Schweder, Thomas
Polysaccharide utilization mechanisms under permanent low-temperature conditions in the Southern Ocean
  • 批准号:
    315079146
  • 项目类别:
    Infrastructure Priority Programmes
  • 资助金额:
    $0.0万
  • 财政年份:
    2016
  • 负责人:
    Professor Dr. Thomas Schweder
  • 依托单位:
Physiological proteomics of relevant enzymes and transporters in marine polysaccharide-degrading Bacteroidetes
  • 批准号:
    321353516
  • 项目类别:
    Research Units
  • 资助金额:
    $0.0万
  • 财政年份:
    --
  • 负责人:
    Professor Dr. Thomas Schweder
  • 依托单位:
Coordination Funds
  • 批准号:
    321538268
  • 项目类别:
    Research Units
  • 资助金额:
    $0.0万
  • 财政年份:
    --
  • 负责人:
    Professor Dr. Thomas Schweder
  • 依托单位:
国内基金
海外基金
雷特综合症致病蛋白MeCP2在DNA损伤修复中的功能及分子机制研究
  • 批准号:
    32070780
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    58.0万元
  • 批准年份:
    2020
  • 负责人:
    刘红美
  • 依托单位:
组蛋白去乙酰化酶SirT7翻译后修饰及其在调控肿瘤耐药中的作用研究
  • 批准号:
    32070770
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    58.0万元
  • 批准年份:
    2020
  • 负责人:
    孙莲慧
  • 依托单位:
新的FANCM关联蛋白复合物FMAP150-FMAP160调控FANCM修复停滞复制叉的作用及机制
  • 批准号:
    32070716
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    58.0万元
  • 批准年份:
    2020
  • 负责人:
    ZHIJIANG YAN
  • 依托单位:
激活SENP1-Sirt3轴改善线粒体健康对延缓衰老的作用与机制研究
  • 批准号:
    92049113
  • 项目类别:
    重大研究计划
  • 资助金额:
    60.0万元
  • 批准年份:
    2020
  • 负责人:
    王田实
  • 依托单位: