SUMO:SBMのタンパク質 - タンパク質相互作用阻害剤の発見
SUMO:SBMのタンパク質 - タンパク質相互作用阻害剤の発見
批准号:
12F02509
负责人:
VOET ARNOUT (2013)
金额:
$1.09万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2012
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2012 至 2014-03-31
中文摘要
自从这个项目开始以来,我们已经开发了一种计算方法来有效地靶向蛋白质-蛋白质相互作用,这是目前药物发现的热门话题。sumo-sim相互作用在sumo化中是必不可少的,但人们对其了解甚少。因此,需要一种化学探针来研究这种相互作用。我们已经证明了将SUMO-SIM与药物样化合物相互作用作为PPI抑制和刺激的可行性。这些结果发表在两份不同的出版物上。考虑到这些有希望的结果,在分析开发之后,建立了中等通量筛选实验,并确定了可能具有更有前景的临床应用的新型化合物。虽然该项目现已终止,但它为未来的研究工作开辟了一条道路,因为这些化合物对优化分析sumo-SIM相互作用和评估临床应用(癌细胞的化疗和放射增敏)很有趣。此外,与本研究平行的是一种利用静电发现靶向蛋白质-蛋白质相互作用药物的新方法。在SAMPL4虚拟筛选挑战中也采用了这种新方法,并获得了最高的排名分数。
英文摘要
Since the start of this project we have developed a computational approach to efficiently target protein-protein interactions, currently a hot topic in drug discovery. The sumo-sim interaction is essential in sumoylation and remains poorly understood. Therefore there is a need for a chemical probe to investigate this interaction. We have demonstrated the feasibility to target the SUMO-SIM interaction with druglike compounds for PPI inhibition as well as stimulation. These results have been published into 2 different publications. Given these promising results and after the development of the assays, a medium throughput screening experiment was set up and novel classes of compounds were identified that have possibly a more promising future for clinical usage. While this project is now terminated, it has opened a path to future research efforts as these compounds are interesting for optimization to analyse the sumo-SIM interactions and evaluate clinical usage (chemo and radio sensitization of cancer cells).Furthermore parallel with this research a novel method to utilize electrostatics for drug discovery targeting protein-protein interactions was developed and evaluated. This new method was also employed during the SAMPL4 virtual screening challenge and helped in obtained the highest ranking score.
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Computational Methods for the discovery of SMPPII
发现 SMPPII 的计算方法
DOI:
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发表时间:
2013
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Tomonobu Nakayama. Jianxun Xu, Rhiannon Creasey, Yoshitama Shingaya and Masakazu Aono, Arnout R. D Voet]
通讯作者:
Arnout R. D Voet
Computational methods for the inhibition of SMPPII
SMPPII 抑制的计算方法
DOI:
--
发表时间:
2013
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Voet A, Berenger F, Zhang KY., Arnout Voet]
通讯作者:
Arnout Voet
Combining in silico and in cerebro approaches for virtual screening and pose prediction in SAMPL4
结合计算机和脑中方法在 SAMPL4 中进行虚拟筛选和姿势预测
DOI:
--
发表时间:
2014
期刊:
Journal Computer Aided Molecular Design
影响因子:
--
作者:
[Voet AR, Kumar A, Berenger F, Zhang KY.]
通讯作者:
Zhang KY.
DOI:
10.1016/j.ab.2013.12.009
发表时间:
2014-03-01
期刊:
ANALYTICAL BIOCHEMISTRY
影响因子:
2.9
作者:
[Hirohama, Mikako, Voet, Arnout R. D., Yoshida, Minoru]
通讯作者:
Yoshida, Minoru
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丹参酮ⅡA联合miR-29b inhibitor调控TGF-β1 / Smad3协同促进肌腱功能修复的机制研究
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批准号:81702135
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项目类别:青年科学基金项目
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资助金额:20.0万元
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批准年份:2017
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负责人:卢荟
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依托单位:
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批准号:31672538
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项目类别:面上项目
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资助金额:62.0万元
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批准年份:2016
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负责人:孙跃峰
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依托单位:
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项目类别:青年科学基金项目
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资助金额:25.0万元
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批准年份:2014
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依托单位:
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批准号:30270842
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项目类别:面上项目
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资助金额:20.0万元
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批准年份:2002
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负责人:柳俊
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依托单位:
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批准号:39270620
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项目类别:面上项目
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资助金额:4.0万元
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批准年份:1992
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负责人:郑珊珊
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依托单位: