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Linear skalierende Algorithmen zur Behandlung der Coulomb-Wechselwirkung

Linear skalierende Algorithmen zur Behandlung der Coulomb-Wechselwirkung
用于处理库仑相互作用的线性缩放算法
批准号:
5412404
负责人:
Dr. Jörg Rottler
金额:
$0.0万
依托单位国家:
德国
项目类别:
Research Fellowships
财政年份:
2003
资助国家:
德国
项目状态:
已结题
起止时间:
2002-12-31 至 2003-12-31

项目摘要

项目成果

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中文摘要
翻译
在柴油机ARBITHANDELN WIR新的算法,Zur模拟冯·格勒阿恩Festkörpersystem en。在此基础上,提出了一种新的方法和方法,并在此基础上提出了新的方法。这是一种另一种选择,我们选择了这种方式,而不是把它们放在一起。耶尔贝将在洛卡尔扩散自由海茨格勒和电气领域的Eingeführt。麻省理工学院einer蒙特卡罗实现演示,dass柴油算法的线性MIT和系统的技巧。这是一种新的生活方式,是一种新的生活方式和生活方式。在Arbeit entwickeln Wireine实施的过程中,我们发现了一种新的方法,即用蒙特卡罗方法模拟Von Biomolekülen的蛋白质和DNS。在统计力学和哈密顿系统的基础上,提出了一种新的理论和方法。
英文摘要
In dieser Arbeit behandeln wir neue Algorithmen zur Simulation von geladenen Festkörpersystemen. Gegenwärtig vorhandene Methoden, die auf Multipol- und Fouriermethoden basieren, sind aufwendig und für eine Vielzahl von Anwendungen ungeeignet. Kürzlich wurde ein alternativer Weg zur Berechnung der CoulombWechselwirkung vorgeschlagen, der auf lokalen Energiefunktionalen mit Nebenbedingungen beruht. Hierbei wird ein lokal diffusiver Freiheitsgrad für das elektrische Feld eingeführt. Mit einer Monte Carlo Implementation wurde demonstriert, dass dieser Algorithmus linear mit der Systemgrösse skaliert. Dies steht im Gegensatz zum Aufwand bei der direkten Berechnung der langreichweitigen Coulomb-Wechselwirkung, der quadratisch mit der Anzahl der Teilchen ansteigt. In dieser Arbeit entwickeln wir eine Implementation dieses Ansatzes für die Molekulardynamik, die für eine Reihe von Fragestellungen wie z.B. der Simulation von Biomolekülen, Proteinen und DNS der Monte Carlo Methode überlegen ist. In diesem Zusammenhang erfolgt auch eine Behandlung der statischen Mechanik eingeschränkter Hamiltonscher Systeme mit Randbedingungen mit feldtheoretischen Methoden.
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