Foamy Virus Replication: Structure-function analysis of viral enzymes involved in generating genetic diversity or in conserving the genome

泡沫病毒（FV） oder Spumaviren gehören zur family der Retroviridae, jedoch unterscheidet，这是一种复制策略。因此，wind z.b.d as Pol-Vorläuferprotein与Kapsidprotein实验和night vollständig gespalten分离。逆转录tritt spät in Lebenszyklus auf， wodurch病毒颗粒进入steen，死亡DNA被吸入。FV复制与结构与逆转转录酶（RT）的克隆与结构与蛋白酶-RT （PR-RT）与猴泡沫病毒1号（SFV-1）的克隆与结构与蛋白质-RT （PR-RT）及其核苷抑制剂AZT耐药衍生物分析[m] . Aufschluß <e:1> ber den Replikationsmechanismus und die Grundlagen der AZT- resistenz zu erhalten。Nach rekombinter Expression und Reinigung sollen biochemische （Analyse der Polymerisations- und RNase H-Aktivitäten, insbesonere die Untersuchung der Prozessivität und der Fehlerrate bei der Polymerisation）和strukturelle Untersuchungen (CD， NMR) mit demwildtype - enzyme und der Resistenzmutante durchgefhrt werden。RT和PR <s:1> ssen offenbar fusioniert sein, um aktiv zu sein。c -末端缺失的PR-RT蛋白sollen dar<s:1> ber Aufschluß geben, wie groß der RT-Anteil f<s:1> r die Aktivität der PR-Domäne sein muß。[4] [9] [9] [9] [9] [9] [9] [3] [3] [3] [3] [4]Durch interinfusionen mit PR and RT können spezifisch nur in der PR-Domäne mit 15N markierte PR-RT蛋白hergestellt werden， die es erlauben, die PR im Kontext der gesamten PR-RT nmr - spectroskopisch zu untersuchen。达西奇在verwandten Systemen gezeigt帽子,Daß体外Daten不unbedingt das体内Verhalten widerspiegeln,将komplementar吧台oben skizzierten Experimenten etabliert静脉系统,麻省理工学院的民主党西奇模体内Mutationsrate冯阵线untersuchen laßt。

Foamy Viren (FV) oder Spumaviren gehören zur Familie der Retroviridae, jedoch unterscheidet sich ihre Replikationsstrategie von anderen Retroviren. So wird z.B. das Pol-Vorläuferprotein separat vom Kapsidprotein exprimiert und nicht vollständig gespalten. Reverse Transkription tritt spät im Lebenszyklus auf, wodurch Viruspartikel entstehen, die DNA beinhalten. Aufgrund der ungewöhnlichen FV Replikation und Struktur der Reversen Transkriptase (RT) wollen wir die Protease-RT (PR-RT) des Simian Foamy Virus 1 (SFV-1) und ein gegenüber dem Nukleosidinhibitor AZT resistentes Derivat analysieren, um Aufschluß über den Replikationsmechanismus und die Grundlagen der AZT-Resistenz zu erhalten. Nach rekombinanter Expression und Reinigung sollen biochemische (Analyse der Polymerisations- und RNase H-Aktivitäten, insbesondere die Untersuchung der Prozessivität und der Fehlerrate bei der Polymerisation) und strukturelle Untersuchungen (CD, NMR) mit dem Wildtyp-Enzym und der Resistenzmutante durchgeführt werden. RT und PR müssen offenbar fusioniert sein, um aktiv zu sein. C-terminale Deletionen am PR-RT Protein sollen darüber Aufschluß geben, wie groß der RT-Anteil für die Aktivität der PR-Domäne sein muß. Darüber hinaus werden C-terminale Deletionsmutanten für NMR-spektroskopische Untersuchungen verwendet. Durch Inteinfusionen mit PR und RT können spezifisch nur in der PR-Domäne mit 15N markierte PR-RT Proteine hergestellt werden, die es erlauben, die PR im Kontext der gesamten PR-RT NMR-spektroskopisch zu untersuchen. Da sich in verwandten Systemen gezeigt hat, daß in vitro Daten nicht unbedingt das in vivo Verhalten widerspiegeln, wird komplementär zu den oben skizzierten Experimenten ein System etabliert, mit dem sich die in vivo Mutationsrate von FV untersuchen läßt.