BIOMOLECULAR INTERACTION AND GENE NETWORK SIMULATIONS

这个子项目是利用资源的许多研究子项目之一。 由NIH/NCRR资助的中心拨款提供。对子项目的主要支持 子项目的首席调查员可能是由其他来源提供的， 包括美国国立卫生研究院的其他来源。为子项目列出的总成本可能 表示该子项目使用的中心基础设施的估计数量， 不是由NCRR赠款提供给次级项目或次级项目工作人员的直接资金。 在目前的提案中，我们正在申请资源，以继续开展两个不同的项目。1.分子动力学模拟研究抗菌肽的作用机理。这是2003年授予审计咨询委员会资源以及2004年、2005年、2006年、2007年、2008年和2009年授予国家资源调拨目标/核心预算资源调拨目标资源的拟议工作的继续。到目前为止完成的工作已经使PI获得了NIH R01拨款(R01GM070989，标题：抗菌肽的计算建模和设计)，这将继续支持我们的工作。我们描述了我们希望在来年进行的模拟工作。2.人工基因网络的设计与仿真。这是2004年、2005年、2006年、2007年、2008年和2009年授予国家资源调拨目标/核心预算资源调拨目标资源的拟议工作的继续。这一领域的工作最初是由美国国家科学基金会的常规赠款(BES-0425882，标题：基因调控网络的多尺度建模)资助的，目前正在得到美国国家科学基金会授予YNK的职业奖(#0644792)和美国国立卫生研究院R01补助金(1R01GM086865-01A2)的支持。

This subproject is one of many research subprojects utilizing the resources provided by a Center grant funded by NIH/NCRR. Primary support for the subproject and the subproject's principal investigator may have been provided by other sources, including other NIH sources. The Total Cost listed for the subproject likely represents the estimated amount of Center infrastructure utilized by the subproject, not direct funding provided by the NCRR grant to the subproject or subproject staff. In the current proposal, we are requesting resources to continue working on two different projects. 1. Insights into the mechanism of action of antimicrobial peptides from molecular dynamics simulations. This is a continuation of proposed work awarded with AAB resources in 2003, and NRAC/TRAC resources in 2004, 2005, 2006, 2007, 2008 and 2009. The work completed to date has resulted in the PI being awarded an NIH R01 grant (R01GM070989, title: Computational Modeling and Design of Antimicrobial Peptides), which continues to support our work. We describe simulation efforts that we hope to pursue in the coming year. 2. Design and simulations of artificial gene networks. This is a continuation of proposed work awarded with NRAC/TRAC resources in 2004, 2005, 2006, 2007, 2008 and 2009. Work in this area was originally funded by a regular NSF grant (BES-0425882, title: Multiscale Modeling of Gene Regulatory Network) and is currently being supported by an NSF CAREER award (# 0644792) to YNK and a NIH R01 grant (1R01GM086865-01A2).