A Translational Informatics Framework to Mine Efficacy and Safety of Dietary Supplements

项目总结 大多数美国成年人(77%)服用膳食补充剂(DS)，其中87%的人表示总体上对 DS的安全性、质量和有效性。然而，DS并不总是安全的。DS信息散布在生物医学领域 文献、社交媒体和FDA自发报告系统。因此，要优化正确和安全地使用 DS，仍然迫切需要开发具有创新工具和资源的信息学框架，以实现 我们通过多模式数据源更好地了解DS的有效性和安全性。在我们先前项目的基础上， 此续订申请的目标是创建丰富的DS知识库(EDISK)，并开发 翻译信息学框架(IDISK-MILE)，采用创新的信息学方法促进DS研究 使用真实世界、多站点的EHR数据和。我们将在两个主要方面扩大前期工作：(1)扩大我们的 范围到DS的有效性和安全性(先前项目的重点)，使用多模式数据源丰富我们的 目前的DS知识库(即eDISK)；以及(2)开发和评估翻译信息学框架，以 使用多个站点的真实EHR数据促进DS研究。我们提出了以下具体目标：(1)创造 EDISK通过集成来自多模式数据源的DS有效性和安全性；(2)开发可翻译的 信息学框架(IDISK-MINE)，以促进基于EHR的观察性DS研究；以及(3)评估 IDISK-MILE对抑郁症患者多部位EHR数据的通用性和实用性这是第一个项目 开发翻译信息学框架，以使用多模式数据源提高我们的DS知识 并使我们能够使用真实的电子病历数据了解患者(例如抑郁症患者)如何使用DS。 该项目的成功完成将提供一个具有宝贵工具和资源的新框架 用于DS临床和转译研究。

PROJECT SUMMARY Most U.S. adults (77%) take dietary supplements (DS) and 87% of them express overall confidence in the safety, quality and efficacy of DS. However, DS are not always safe. DS information is scattered in biomedical literature, social media, and FDA spontaneous reporting system. Thus, to optimize the proper and safe use of DS, there remains a critical need to develop informatics framework with innovative tools and resources to enable us better understand efficacy and safety of DS through multimodal data sources. Built upon our prior project, the objective of this renewal application is to create an enriched DS knowledge base (eDISK) and to develop a translational informatics framework (iDISK-Mine) with innovative informatics approaches to facility DS research using real-world, multi-site EHR data and. We will expand our prior work in two major aspects: (1) Expand our scope to both efficacy and safety (focus of the prior project) of DS using multimodal data sources to enrich our current DS knowledge base (i.e., eDISK); and (2) Develop and evaluate a translational informatics framework to facilitate DS research using multi-site real world EHR data. We propose the following Specific Aims: (1) Create eDISK by integrating DS efficacy and safety from multimodal data sources; (2) Develop a translational informatics framework (iDISK-Mine) to facilitate EHR-based observational DS research; and (3) Evaluate the generalizability and utility of iDISK-Mine on the multi-site EHR data of depression patients. This is the first project to develop a translational informatics framework to advance our DS knowledge using multimodal data sources and enable us to understand how patients (e.g., depression patients) use DS using the real-world EHR data. The successful accomplishment of this project will deliver a novel framework with valuable tools and resources for DS clinical and translational research.