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应用量子化学从头算（φψχ1）三维势能面提高蛋白质经验分子力场的精度

批准号：
20773160
项目类别：
面上项目
资助金额：
26.0 万元
负责人：
汪志祥
依托单位：
中国科学院大学
学科分类：
化学理论与方法
结题年份：
2010
批准年份：
2007
项目状态：
已结题
项目参与者：
于淑媛、刘涛、张成根
关键词：
量子化学从头算经验力场分子动力学生物大分子

项目摘要

结项摘要

项目成果

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中文摘要
经验分子力场是计算机模拟生物大分子的基础和核心。根据近年来发展起来的快速GB溶剂模型和本人近年来在这方面的探索，我们建议使用更精确的考虑了溶剂效应的量子化学从头算结果来进行与GB溶剂模型匹配的经验力场参数化。该方法包括：（1）利用数值插值的方法，使用量子化学从头算的（φ ψ χ1）三维势能面表示力场中所对应的φ ψ χ1二面角扭转能。（2）根据氨基酸的个性和特性,分组使用不同的势能面。（3）根据量子化学计算的溶剂化能，优化GB半径。该方法可以克服现有力场参数化中出现的一些缺点，提高力场的精度，为今后更准确的模拟生物大分子打下基础。
英文摘要
期刊论文列表
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专利列表
Reversible Heterolytic Methane Activation of Metal‐Free Closed‐Shell Molecules: A Computational Proof‐of‐Principle Study
DOI： 10.1002/ejic.201000242
发表时间： 2010-05
期刊： European Journal of Inorganic Chemistry
影响因子： 2.3
作者： [G. Lu;Lili Zhao;Haixia Li;Fangcheng Huang;Zhi‐Xiang Wang]
通讯作者： G. Lu;Lili Zhao;Haixia Li;Fangcheng Huang;Zhi‐Xiang Wang
Planar tetracoordinate carbon species involving beryllium substituents.
DOI： 10.1021/ic7017709
发表时间： 2008-01
期刊： Inorganic chemistry
影响因子： 4.6
作者： [Zhi‐Xiang Wang;Chenggen Zhang;Zhongfang Chen;P. Schleyer]
通讯作者： Zhi‐Xiang Wang;Chenggen Zhang;Zhongfang Chen;P. Schleyer
A bifunctional strategy towards experimentally (synthetically) attainable molecules with planar tetracoordinate carbons.
DOI： 10.1039/b916594k
发表时间： 2010-01
期刊： Physical chemistry chemical physics : PCCP
影响因子： --
作者： [Yan-Bo Wu;Jin Jiang;Hua Li;Zhongfang Chen;Zhi‐Xiang Wang]
通讯作者： Yan-Bo Wu;Jin Jiang;Hua Li;Zhongfang Chen;Zhi‐Xiang Wang
Catalytic metal-free ketone hydrogenation: a computational experiment.
DOI： 10.1039/c001399d
发表时间： 2010-06
期刊： Dalton transactions
影响因子： 4
作者： [Haixia Li;Lili Zhao;G. Lu;Fangcheng Huang;Zhi‐Xiang Wang]
通讯作者： Haixia Li;Lili Zhao;G. Lu;Fangcheng Huang;Zhi‐Xiang Wang
共 14 条
    结合实验和理论计算发展过渡金属催化的C-B/10B还原交叉偶联反应及机理研究
    • 批准号：
      22573107
    • 项目类别：
      面上项目
    • 资助金额：
      50.00万元
    • 批准年份：
      2025
    • 负责人：
      汪志祥
    • 依托单位：
      中国科学院大学
    四齿螯合双功能金属催化剂的理论计算设计和实验合成
    • 批准号：
      22173103
    • 项目类别：
      面上项目
    • 资助金额：
      62.00万元
    • 批准年份：
      2021
    • 负责人：
      汪志祥
    • 依托单位：
      中国科学院大学
    理论计算研究基于钛的催化反应机理及新催化体系的发展
    • 批准号：
      21773240
    • 项目类别：
      面上项目
    • 资助金额：
      64.0万元
    • 批准年份：
      2017
    • 负责人：
      汪志祥
    • 依托单位：
      中国科学院大学
    理论计算研究过渡金属-有机分子协同催化的酮的C-H或C-C键官能团化的催化机理及新催化体系的发展
    • 批准号：
      21573233
    • 项目类别：
      面上项目
    • 资助金额：
      64.0万元
    • 批准年份：
      2015
    • 负责人：
      汪志祥
    • 依托单位：
      中国科学院大学
    国内基金
    海外基金