基于双分子互补的细菌动态蛋白相互作用网络技术研究
批准号:
31170100
项目类别:
面上项目
资助金额:
61.0 万元
负责人:
王瑶
依托单位:
学科分类:
微生物学新技术与新方法
结题年份:
2015
批准年份:
2011
项目状态:
已结题
项目参与者:
罗招庆、王阳、彭中、宋云洪、李玉萍、邓丹丹
中文摘要
本项目针对当前动态蛋白相互作用研究的技术瓶颈,利用细菌荧光素酶的独特优势,克服现有真核生物荧光素酶双分子互补系统在实时动态检测方面的缺陷,构建拥有完全自主知识产权、基于细菌荧光素酶的高通量活细胞实时动态双分子互补蛋白相互作用检测系统;进一步利用此系统,以研究基础较好的细菌鞭毛系统为研究对象,通过遗传操作实现在最接近细胞生理状态的情况下检测鞭毛系统蛋白相互作用的时序性和竞争性动态表达,从而构建鞭毛系统动态蛋白相互作用网络,并结合活细胞实时动态基因表达分析、动态蛋白相互作用干扰等技术对鞭毛系统调控蛋白FlgM的动态调控机制进行深入分析。通过本项目的实施,一方面可建立一种对蛋白质功能研究有重要促进意义的高通量活细胞实时动态蛋白相互作用检测新技术,另一方面可为大规模动态蛋白相互作用网络研究进行前期探索和技术储备,并努力实现从跟踪学科前沿转变为争取引领学科前沿的原创意义上的大胆探索和技术革新。
英文摘要
本项目针对当前微生物动态蛋白相互作用研究的技术瓶颈,利用细菌荧光素酶的独特优势,以生物发光共振能量转移理论为基石,构建了一个新的拥有完全自主知识产权的活细胞实时动态蛋白相互作用检测系统,并用FKBP-FRB以及鞭毛系统结构蛋白和调控蛋白的可逆动态相互作用对该系统进行验证,表明该系统除了可实现活细胞实时动态蛋白相互作用检测外,还可实现蛋白相互作用检测的可视化,以及用于蛋白相互作用抑制剂的筛选及抑制常数测定;进一步我们构建了围绕细菌鞭毛系统调控蛋白FlgM的动态蛋白相互作用网络,根据鞭毛合成过程中这些蛋白相互作用的动态变化,揭示了细菌鞭毛系统基因表达的关闭机制,并提出了一个新的基于蛋白动态相互作用的细菌鞭毛系统基因表达调控模型,该模型合理解释和完善了当前对细菌鞭毛系统调控机制认识的一些空白,并为进一步揭示鞭毛系统的复杂调控机制提出了可行途径。鉴于动态蛋白相互作用研究的重要性,我们将在以后的工作中继续完善我们发明的基于细菌荧光素酶的活细胞实时动态蛋白相互作用检测系统,不断提高其灵敏性和通量,并扩大其使用范围。
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Ohr Protects Corynebacterium glutamicum against Organic Hydroperoxide Induced Oxidative Stress.
Ohr 保护谷氨酸棒杆菌免受有机氢过氧化物诱导的氧化应激
DOI:
10.1371/journal.pone.0131634
发表时间:
2015
期刊:
PloS one
影响因子:
3.7
作者:
[Si M, Wang J, Xiao X, Guan J, Zhang Y, Ding W, Chaudhry MT, Wang Y, Shen X]
通讯作者:
Shen X
Roles of RpoS in Yersinia pseudotuberculosis stress survival, motility, biofilm formation and type VI secretion system expression
RpoS 在假结核耶尔森菌应激存活、运动、生物膜形成和 VI 型分泌系统表达中的作用
DOI:
10.1007/s12275-015-0099-6
发表时间:
2015-09-01
期刊:
JOURNAL OF MICROBIOLOGY
影响因子:
3
作者:
[Guan, Jingyuan, Xiao, Xiao, Wang, Yao]
通讯作者:
Wang, Yao
NrdH Redoxin Enhances Resistance to Multiple Oxidative Stresses by Acting as a Peroxidase Cofactor in Corynebacterium glutamicum
NrdH 氧化还原蛋白通过充当谷氨酸棒杆菌中的过氧化物酶辅因子来增强对多种氧化应激的抵抗力
DOI:
10.1128/aem.03654-13
发表时间:
2014-03-01
期刊:
APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY
影响因子:
4.4
作者:
[Si, Mei-Ru, Zhang, Lei, Liu, Shuang-Jiang]
通讯作者:
Liu, Shuang-Jiang
The dual transcriptional regulator RovM regulates the expression of AR3- and T6SS4-dependent acid survival systems in response to nutritional status in Yersinia pseudotuberculosis.
双转录调节因子 RovM 调节 AR3 和 T6SS4 依赖性酸性生存系统的表达,以响应假结核耶尔森氏菌的营养状况。
DOI:
10.1111/1462-2920.12996
发表时间:
2015
期刊:
Environmental Microbiology
影响因子:
5.1
作者:
[Song Yunhong, Xiao Xiao, Li Changfu, Wang Tietao, Zhao Ruoxi, Zhang Weipeng, Zhang Lei, Wang Yao, Shen Xihui]
通讯作者:
Shen Xihui
A bioluminescence resonance energy transfer (BRET) system for measuring dynamic protein-protein interactions in bacteria
用于测量细菌中动态蛋白质-蛋白质相互作用的生物发光共振能量转移(BRET)系统
DOI:
--
发表时间:
2014
期刊:
mBio
影响因子:
6.4
作者:
[崔博宇, 王瑶]
通讯作者:
王瑶
共 9 条
金黄色葡萄球菌感知竞争信号激活非接触依赖T7SS表达的机制研究
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批准号:32570140
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项目类别:面上项目
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资助金额:50.00万元
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批准年份:2025
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负责人:王瑶
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依托单位:
脂多糖结合蛋白介导的细菌外膜囊泡招募及铁转运机制研究
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批准号:--
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项目类别:面上项目
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资助金额:58万元
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批准年份:2021
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负责人:王瑶
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依托单位:
细菌VI型分泌系统的非接触杀菌新功能研究
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批准号:31970114
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项目类别:面上项目
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资助金额:60.0万元
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批准年份:2019
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负责人:王瑶
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依托单位:
双重分子开关CsrA-RovM反向调控假结核耶尔森氏菌生物膜和运动性的机制研究
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批准号:31671292
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项目类别:面上项目
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资助金额:65.0万元
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批准年份:2016
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负责人:王瑶
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依托单位:
细菌VI型分泌系统抗环境胁迫新功能研究及其作用机制解析
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批准号:31370150
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项目类别:面上项目
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资助金额:78.0万元
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批准年份:2013
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负责人:王瑶
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依托单位:
国内基金
海外基金